yasmmin/ncbi_nerfair_processed · Datasets at Hugging Face

id stringlengths 5 8	tokens listlengths 53 590	ner_tags listlengths 53 590
10021369	[ "Identification", "of", "APC2", ",", "a", "homologue", "of", "the", "adenomatous", "polyposis", "coli", "tumour", "suppressor", ".", "The", "adenomatous", "polyposis", "coli", "(", "APC", ")", "tumour", "-", "suppressor", "protein", "controls", "the", "Wnt", "signalling", "pathway", "by", "forming", "a", "complex", "with", "glycogen", "synthase", "kinase", "3beta", "(", "GSK", "-", "3beta", ")", ",", "axin", "/", "conductin", "and", "betacatenin", ".", "Complex", "formation", "induces", "the", "rapid", "degradation", "of", "betacatenin", ".", "In", "colon", "carcinoma", "cells", ",", "loss", "of", "APC", "leads", "to", "the", "accumulation", "of", "betacatenin", "in", "the", "nucleus", ",", "where", "it", "binds", "to", "and", "activates", "the", "Tcf", "-", "4", "transcription", "factor", "(", "reviewed", "in", "[", "1", "]", "[", "2", "]", ")", ".", "Here", ",", "we", "report", "the", "identification", "and", "genomic", "structure", "of", "APC", "homologues", ".", "Mammalian", "APC2", ",", "which", "closely", "resembles", "APC", "in", "overall", "domain", "structure", ",", "was", "functionally", "analyzed", "and", "shown", "to", "contain", "two", "SAMP", "domains", ",", "both", "of", "which", "are", "required", "for", "binding", "to", "conductin", ".", "Like", "APC", ",", "APC2", "regulates", "the", "formation", "of", "active", "betacatenin", "-", "Tcf", "complexes", ",", "as", "demonstrated", "using", "transient", "transcriptional", "activation", "assays", "in", "APC", "-", "/", "-", "colon", "carcinoma", "cells", ".", "Human", "APC2", "maps", "to", "chromosome", "19p13", ".", "3", ".", "APC", "and", "APC2", "may", "therefore", "have", "comparable", "functions", "in", "development", "and", "cancer", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 8, 8, 0, 0, 0, 7, 8, 8, 8, 8, 8, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0 ]
10051005	[ "A", "common", "MSH2", "mutation", "in", "English", "and", "North", "American", "HNPCC", "families", ":", "origin", ",", "phenotypic", "expression", ",", "and", "sex", "specific", "differences", "in", "colorectal", "cancer", ".", "The", "frequency", ",", "origin", ",", "and", "phenotypic", "expression", "of", "a", "germline", "MSH2", "gene", "mutation", "previously", "identified", "in", "seven", "kindreds", "with", "hereditary", "non", "-", "polyposis", "cancer", "syndrome", "(", "HNPCC", ")", "was", "investigated", ".", "The", "mutation", "(", "A", "-", "-", ">", "T", "at", "nt943", "+", "3", ")", "disrupts", "the", "3", "splice", "site", "of", "exon", "5", "leading", "to", "the", "deletion", "of", "this", "exon", "from", "MSH2", "mRNA", "and", "represents", "the", "only", "frequent", "MSH2", "mutation", "so", "far", "reported", ".", "Although", "this", "mutation", "was", "initially", "detected", "in", "four", "of", "33", "colorectal", "cancer", "families", "analysed", "from", "eastern", "England", ",", "more", "extensive", "analysis", "has", "reduced", "the", "frequency", "to", "four", "of", "52", "(", "8", "%", ")", "English", "HNPCC", "kindreds", "analysed", ".", "In", "contrast", ",", "the", "MSH2", "mutation", "was", "identified", "in", "10", "of", "20", "(", "50", "%", ")", "separately", "identified", "colorectal", "families", "from", "Newfoundland", ".", "To", "investigate", "the", "origin", "of", "this", "mutation", "in", "colorectal", "cancer", "families", "from", "England", "(", "n", "=", "4", ")", ",", "Newfoundland", "(", "n", "=", "10", ")", ",", "and", "the", "United", "States", "(", "n", "=", "3", ")", ",", "haplotype", "analysis", "using", "microsatellite", "markers", "linked", "to", "MSH2", "was", "performed", ".", "Within", "the", "English", "and", "US", "families", "there", "was", "little", "evidence", "for", "a", "recent", "common", "origin", "of", "the", "MSH2", "splice", "site", "mutation", "in", "most", "families", ".", "In", "contrast", ",", "a", "common", "haplotype", "was", "identified", "at", "the", "two", "flanking", "markers", "(", "CA5", "and", "D2S288", ")", "in", "eight", "of", "the", "Newfoundland", "families", ".", "These", "findings", "suggested", "a", "founder", "effect", "within", "Newfoundland", "similar", "to", "that", "reported", "by", "others", "for", "two", "MLH1", "mutations", "in", "Finnish", "HNPCC", "families", ".", "We", "calculated", "age", "related", "risks", "of", "all", ",", "colorectal", ",", "endometrial", ",", "and", "ovarian", "cancers", "in", "nt943", "+", "3", "A", "-", "-", ">", "T", "MSH2", "mutation", "carriers", "(", "n", "=", "76", ")", "for", "all", "patients", "and", "for", "men", "and", "women", "separately", ".", "For", "both", "sexes", "combined", ",", "the", "penetrances", "at", "age", "60", "years", "for", "all", "cancers", "and", "for", "colorectal", "cancer", "were", "0", ".", "86", "and", "0", ".", "57", ",", "respectively", ".", "The", "risk", "of", "colorectal", "cancer", "was", "significantly", "higher", "(", "p", "<", "0", ".", "01", ")", "in", "males", "than", "females", "(", "0", ".", "63", "v", "0", ".", "30", "and", "0", ".", "84", "v", "0", ".", "44", "at", "ages", "50", "and", "60", "years", ",", "respectively", ")", ".", "For", "females", "there", "was", "a", "high", "risk", "of", "endometrial", "cancer", "(", "0", ".", "5", "at", "age", "60", "years", ")", "and", "premenopausal", "ovarian", "cancer", "(", "0", ".", "2", "at", "50", "years", ")", ".", "These", "intersex", "differences", "in", "colorectal", "cancer", "risks", "have", "implications", "for", "screening", "programmes", "and", "for", "attempts", "to", "identify", "colorectal", "cancer", "susceptibility", "modifiers", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 4, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 6, 6, 6, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 0, 0, 0 ]
10051007	[ "Age", "of", "onset", "in", "Huntington", "disease", ":", "sex", "specific", "influence", "of", "apolipoprotein", "E", "genotype", "and", "normal", "CAG", "repeat", "length", ".", "Age", "of", "onset", "(", "AO", ")", "of", "Huntington", "disease", "(", "HD", ")", "is", "known", "to", "be", "correlated", "with", "the", "length", "of", "an", "expanded", "CAG", "repeat", "in", "the", "HD", "gene", ".", "Apolipoprotein", "E", "(", "APOE", ")", "genotype", ",", "in", "turn", ",", "is", "known", "to", "influence", "AO", "in", "Alzheimer", "disease", ",", "rendering", "the", "APOE", "gene", "a", "likely", "candidate", "to", "affect", "AO", "in", "other", "neurological", "diseases", "too", ".", "We", "therefore", "determined", "APOE", "genotype", "and", "normal", "CAG", "repeat", "length", "in", "the", "HD", "gene", "for", "138", "HD", "patients", "who", "were", "previously", "analysed", "with", "respect", "to", "CAG", "repeat", "length", ".", "Genotyping", "for", "APOE", "was", "performed", "blind", "to", "clinical", "information", ".", "In", "addition", "to", "highlighting", "the", "effect", "of", "the", "normal", "repeat", "length", "upon", "AO", "in", "maternally", "inherited", "HD", "and", "in", "male", "patients", ",", "we", "show", "that", "the", "APOE", "epsilon2epsilon3", "genotype", "is", "associated", "with", "significantly", "earlier", "AO", "in", "males", "than", "in", "females", ".", "Such", "a", "sex", "difference", "in", "AO", "was", "not", "apparent", "for", "any", "of", "the", "other", "APOE", "genotypes", ".", "Our", "findings", "suggest", "that", "subtle", "differences", "in", "the", "course", "of", "the", "neurodegeneration", "in", "HD", "may", "allow", "interacting", "genes", "to", "exert", "gender", "specific", "effects", "upon", "AO", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
100562	[ "Familial", "deficiency", "of", "the", "seventh", "component", "of", "complement", "associated", "with", "recurrent", "bacteremic", "infections", "due", "to", "Neisseria", ".", "The", "serum", "of", "a", "29", "-", "year", "old", "woman", "with", "a", "recent", "episode", "of", "disseminated", "gonococcal", "infection", "and", "a", "history", "of", "meningococcal", "meningitis", "and", "arthritis", "as", "a", "child", "was", "found", "to", "lack", "serum", "hemolytic", "complement", "activity", ".", "The", "seventh", "component", "of", "complement", "(", "C7", ")", "was", "not", "detected", "by", "functional", "or", "immunochemical", "assays", ",", "whereas", "other", "components", "were", "normal", "by", "hemolytic", "and", "immunochemical", "assessment", ".", "Her", "fresh", "serum", "lacked", "complement", "-", "mediated", "bactericidal", "activity", "against", "Neisseria", "gonorrhoeae", ",", "but", "the", "addition", "of", "fresh", "normal", "serum", "or", "purified", "C7", "restored", "bactericidal", "activity", "as", "well", "as", "hemolytic", "activity", ".", "The", "absence", "of", "functional", "C7", "activity", "could", "not", "be", "accounted", "for", "on", "the", "basis", "of", "an", "inhibitor", ".", "Opsonization", "and", "generation", "of", "chemotactic", "activity", "functioned", "normally", ".", "Complete", "absence", "of", "C7", "was", "also", "found", "in", "one", "sibling", "who", "had", "the", "clinical", "syndrome", "of", "meningococcal", "meningitis", "and", "arthritis", "as", "a", "child", "and", "in", "this", "siblings", "clinically", "well", "eight", "-", "year", "-", "old", "son", ".", "HLA", "histocompatibility", "typing", "of", "the", "family", "members", "did", "not", "demonstrate", "evidence", "for", "genetic", "linkage", "of", "C7", "deficiency", "with", "the", "major", "histocompatibility", "loci", ".", "This", "report", "represents", "the", "first", "cases", "of", "C7", "deficiency", "associated", "with", "infectious", "complications", "and", "suggests", "that", "bactericidal", "activity", "may", "be", "important", "in", "host", "defense", "against", "bacteremic", "neisseria", "infections", "." ]	[ 3, 4, 4, 4, 4, 4, 4, 4, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 8, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0 ]
10064668	[ "Increased", "incidence", "of", "cancer", "in", "patients", "with", "cartilage", "-", "hair", "hypoplasia", ".", "OBJECTIVE", "Previous", "reports", "have", "suggested", "an", "increased", "risk", "of", "cancer", "among", "patients", "with", "cartilage", "-", "hair", "hypoplasia", "(", "CHH", ")", ".", "This", "study", "was", "carried", "out", "to", "further", "evaluate", "this", "risk", "among", "patients", "with", "CHH", "and", "their", "first", "-", "degree", "relatives", ".", "STUDY", "DESIGN", "One", "hundred", "twenty", "-", "two", "patients", "with", "CHH", "were", "identified", "through", "2", "countrywide", "epidemiologic", "surveys", "in", "1974", "and", "in", "1986", ".", "Their", "parents", "and", "nonaffected", "siblings", "were", "identified", "through", "the", "Population", "Register", "Center", ".", "This", "cohort", "underwent", "follow", "-", "up", "for", "cancer", "incidence", "through", "the", "Finnish", "Cancer", "Registry", "to", "the", "end", "of", "1995", ".", "RESULTS", "A", "statistically", "significant", "excess", "risk", "of", "cancer", "was", "seen", "among", "the", "patients", "with", "CHH", "(", "standardized", "incidence", "ratio", "6", ".", "9", ",", "95", "%", "confidence", "interval", "2", ".", "3", "to", "16", ")", ",", "which", "was", "mainly", "attributable", "to", "non", "-", "Hodgkins", "lymphoma", "(", "standardized", "incidence", "ratio", "90", ",", "95", "%", "confidence", "interval", "18", "to", "264", ")", ".", "In", "addition", ",", "a", "significant", "excess", "risk", "of", "basal", "cell", "carcinoma", "was", "seen", "(", "standardized", "incidence", "ratio", "35", ",", "95", "%", "confidence", "interval", "7", ".", "2", "to", "102", ")", ".", "The", "cancer", "incidence", "among", "the", "siblings", "or", "the", "parents", "did", "not", "differ", "from", "the", "average", "cancer", "incidence", "in", "the", "Finnish", "population", ".", "CONCLUSIONS", "This", "study", "confirms", "an", "increased", "risk", "of", "cancer", ",", "especially", "non", "-", "Hodgkins", "lymphoma", ",", "probably", "attributable", "to", "defective", "immunity", ",", "among", "patients", "with", "CHH", "." ]	[ 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0 ]
10071185	[ "Genotype", "and", "phenotype", "in", "patients", "with", "dihydropyrimidine", "dehydrogenase", "deficiency", ".", "Dihydropyrimidine", "dehydrogenase", "(", "DPD", ")", "deficiency", "is", "an", "autosomal", "recessive", "disease", "characterised", "by", "thymine", "-", "uraciluria", "in", "homozygous", "deficient", "patients", "and", "has", "been", "associated", "with", "a", "variable", "clinical", "phenotype", ".", "In", "order", "to", "understand", "the", "genetic", "and", "phenotypic", "basis", "for", "DPD", "deficiency", ",", "we", "have", "reviewed", "17", "families", "presenting", "22", "patients", "with", "complete", "deficiency", "of", "DPD", ".", "In", "this", "group", "of", "patients", ",", "7", "different", "mutations", "have", "been", "identified", ",", "including", "2", "deletions", "[", "295", "-", "298delTCAT", ",", "1897delC", "]", ",", "1", "splice", "-", "site", "mutation", "[", "IVS14", "+", "1G", ">", "A", ")", "]", "and", "4", "missense", "mutations", "(", "85T", ">", "C", ",", "703C", ">", "T", ",", "2658G", ">", "A", ",", "2983G", ">", "T", ")", ".", "Analysis", "of", "the", "prevalence", "of", "the", "various", "mutations", "among", "DPD", "patients", "has", "shown", "that", "the", "G", "-", "-", ">", "A", "point", "mutation", "in", "the", "invariant", "splice", "donor", "site", "is", "by", "far", "the", "most", "common", "(", "52", "%", ")", ",", "whereas", "the", "other", "six", "mutations", "are", "less", "frequently", "observed", ".", "A", "large", "phenotypic", "variability", "has", "been", "observed", ",", "with", "convulsive", "disorders", ",", "motor", "retardation", "and", "mental", "retardation", "being", "the", "most", "abundant", "manifestations", ".", "A", "clear", "correlation", "between", "the", "genotype", "and", "phenotype", "has", "not", "been", "established", ".", "An", "altered", "beta", "-", "alanine", ",", "uracil", "and", "thymine", "homeostasis", "might", "underlie", "the", "various", "clinical", "abnormalities", "encountered", "in", "patients", "with", "DPD", "deficiency", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 3, 4, 4, 4, 4, 4, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 1, 2, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0 ]
10071193	[ "Fibroblast", "growth", "factor", "homologous", "factor", "2", "(", "FHF2", ")", ":", "gene", "structure", ",", "expression", "and", "mapping", "to", "the", "Borjeson", "-", "Forssman", "-", "Lehmann", "syndrome", "region", "in", "Xq26", "delineated", "by", "a", "duplication", "breakpoint", "in", "a", "BFLS", "-", "like", "patient", ".", "Borjeson", "-", "Forssman", "-", "Lehmann", "syndrome", "(", "BFLS", ")", "is", "a", "syndromal", "X", "-", "linked", "mental", "retardation", ",", "which", "maps", "by", "linkage", "to", "the", "q26", "region", "of", "the", "human", "X", "chromosome", ".", "We", "have", "identified", "a", "male", "patient", "with", "BFLS", "-", "like", "features", "and", "a", "duplication", ",", "46", ",", "Y", ",", "dup", "(", "X", ")", "(", "q26q28", ")", ",", "inherited", "from", "his", "phenotypically", "normal", "mother", ".", "Fluorescence", "in", "situ", "hybridisation", "using", "yeast", "artificial", "chromosome", "clones", "from", "Xq26", "localised", "the", "duplication", "breakpoint", "to", "an", "approximately", "400", "-", "kb", "interval", "in", "the", "Xq26", ".", "3", "region", "between", "DXS155", "and", "DXS294", "/", "DXS730", ".", "Database", "searches", "and", "analysis", "of", "available", "genomic", "DNA", "sequence", "from", "the", "region", "revealed", "the", "presence", "of", "the", "fibroblast", "growth", "factor", "homologous", "factor", "gene", ",", "FHF2", ",", "within", "the", "duplication", "breakpoint", "interval", ".", "The", "gene", "structure", "of", "FHF2", "was", "determined", "and", "two", "new", "exons", "were", "identified", ",", "including", "a", "new", "5", "end", "exon", ",", "1B", ".", "FHF2", "is", "a", "large", "gene", "extending", "over", "approximately", "200", "kb", "in", "Xq26", ".", "3", "and", "is", "composed", "of", "at", "least", "seven", "exons", ".", "It", "shows", "tissue", "-", "specific", "alternative", "splicing", "and", "alternative", "transcription", "starts", ".", "Northern", "blot", "hybridisation", "showed", "highest", "expression", "in", "brain", "and", "skeletal", "muscle", ".", "The", "FHF2", "gene", "localisation", "and", "tissue", "-", "specific", "expression", "pattern", "suggest", "it", "to", "be", "a", "candidate", "gene", "for", "familial", "cases", "of", "the", "BFLS", "syndrome", "and", "other", "syndromal", "and", "non", "-", "specific", "forms", "of", "X", "-", "linked", "mental", "retardation", "mapping", "to", "the", "region", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 8, 8, 8, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 4, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0 ]
10072428	[ "Germline", "E", "-", "cadherin", "gene", "(", "CDH1", ")", "mutations", "predispose", "to", "familial", "gastric", "cancer", "and", "colorectal", "cancer", ".", "Inherited", "mutations", "in", "the", "E", "-", "cadherin", "gene", "(", "CDH1", ")", "were", "described", "recently", "in", "three", "Maori", "kindreds", "with", "familial", "gastric", "cancer", ".", "Familial", "gastric", "cancer", "is", "genetically", "heterogeneous", "and", "it", "is", "not", "clear", "what", "proportion", "of", "gastric", "cancer", "susceptibility", "in", "non", "-", "Maori", "populations", "is", "due", "to", "germline", "CDH1", "mutations", ".", "Therefore", ",", "we", "screened", "eight", "familial", "gastric", "cancer", "kindreds", "of", "British", "and", "Irish", "origin", "for", "germline", "CDH1", "mutations", ",", "by", "SSCP", "analysis", "of", "all", "16", "exons", "and", "flanking", "sequences", ".", "Each", "family", "contained", "(", "i", ")", "two", "cases", "of", "gastric", "cancer", "in", "first", "degree", "relatives", "with", "one", "affected", "before", "age", "50", "years", ";", "or", "(", "ii", ")", "three", "or", "more", "cases", "of", "gastric", "cancer", ".", "Novel", "germline", "CDH1", "mutations", "(", "a", "nonsense", "and", "a", "splice", "site", ")", "were", "detected", "in", "two", "families", "(", "25", "%", ")", ".", "Both", "mutations", "were", "predicted", "to", "truncate", "the", "E", "-", "cadherin", "protein", "in", "the", "signal", "peptide", "domain", ".", "In", "one", "family", "there", "was", "evidence", "of", "non", "-", "penetrance", "and", "susceptibility", "to", "both", "gastric", "and", "colorectal", "cancer", ";", "thus", ",", "in", "addition", "to", "six", "cases", "of", "gastric", "cancer", ",", "a", "CDH1", "mutation", "carrier", "developed", "colorectal", "cancer", "at", "age", "30", "years", ".", "We", "have", "confirmed", "that", "germline", "mutations", "in", "the", "CDH1", "gene", "cause", "familial", "gastric", "cancer", "in", "non", "-", "Maori", "populations", ".", "However", ",", "only", "a", "minority", "of", "familial", "gastric", "cancers", "can", "be", "accounted", "for", "by", "CDH1", "mutations", ".", "Loss", "of", "E", "-", "cadherin", "function", "has", "been", "implicated", "in", "the", "pathogenesis", "of", "sporadic", "colorectal", "and", "other", "cancers", ",", "and", "our", "findings", "provide", "evidence", "that", "germline", "CDH1", "mutations", "predispose", "to", "early", "onset", "colorectal", "cancer", ".", "Thus", ",", "CDH1", "should", "be", "investigated", "as", "a", "cause", "of", "inherited", "susceptibility", "to", "both", "gastric", "and", "colorectal", "cancers", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 6, 0 ]
10077614	[ "A", "zinc", "finger", "truncation", "of", "murine", "WT1", "results", "in", "the", "characteristic", "urogenital", "abnormalities", "of", "Denys", "-", "Drash", "syndrome", ".", "The", "Wilms", "tumor", "-", "suppressor", "gene", ",", "WT1", ",", "plays", "a", "key", "role", "in", "urogenital", "development", ",", "and", "WT1", "dysfunction", "is", "implicated", "in", "both", "neoplastic", "(", "Wilms", "tumor", ",", "mesothelioma", ",", "leukemias", ",", "and", "breast", "cancer", ")", "and", "nonneoplastic", "(", "glomerulosclerosis", ")", "disease", ".", "The", "analysis", "of", "diseases", "linked", "specifically", "with", "WT1", "mutations", ",", "such", "as", "Denys", "-", "Drash", "syndrome", "(", "DDS", ")", ",", "can", "provide", "valuable", "insight", "concerning", "the", "role", "of", "WT1", "in", "development", "and", "disease", ".", "DDS", "is", "a", "rare", "childhood", "disease", "characterized", "by", "a", "nephropathy", "involving", "mesangial", "sclerosis", ",", "XY", "pseudohermaphroditism", ",", "and", "/", "or", "Wilms", "tumor", "(", "WT", ")", ".", "DDS", "patients", "are", "constitutionally", "heterozygous", "for", "exonic", "point", "mutations", "in", "WT1", ",", "which", "include", "mutations", "predicted", "to", "truncate", "the", "protein", "within", "the", "C", "-", "terminal", "zinc", "finger", "(", "ZF", ")", "region", ".", "We", "report", "that", "heterozygosity", "for", "a", "targeted", "murine", "Wt1", "allele", ",", "Wt1", "(", "tmT396", ")", ",", "which", "truncates", "ZF3", "at", "codon", "396", ",", "induces", "mesangial", "sclerosis", "characteristic", "of", "DDS", "in", "adult", "heterozygous", "and", "chimeric", "mice", ".", "Male", "genital", "defects", "also", "were", "evident", "and", "there", "was", "a", "single", "case", "of", "Wilms", "tumor", "in", "which", "the", "transcript", "of", "the", "nontargeted", "allele", "showed", "an", "exon", "9", "skipping", "event", ",", "implying", "a", "causal", "link", "between", "Wt1", "dysfunction", "and", "Wilms", "tumorigenesis", "in", "mice", ".", "However", ",", "the", "mutant", "WT1", "(", "tmT396", ")", "protein", "accounted", "for", "only", "5", "%", "of", "WT1", "in", "both", "heterozygous", "embryonic", "stem", "cells", "and", "the", "WT", ".", "This", "has", "implications", "regarding", "the", "mechanism", "by", "which", "the", "mutant", "allele", "exerts", "its", "effect", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 3, 4, 4, 4, 0, 0, 7, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 3, 4, 0, 3, 0, 3, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 7, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 3, 4, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 3, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
10077651	[ "Mechanism", "of", "increased", "iron", "absorption", "in", "murine", "model", "of", "hereditary", "hemochromatosis", ":", "increased", "duodenal", "expression", "of", "the", "iron", "transporter", "DMT1", ".", "Hereditary", "hemochromatosis", "(", "HH", ")", "is", "a", "common", "autosomal", "recessive", "disorder", "characterized", "by", "tissue", "iron", "deposition", "secondary", "to", "excessive", "dietary", "iron", "absorption", ".", "We", "recently", "reported", "that", "HFE", ",", "the", "protein", "defective", "in", "HH", ",", "was", "physically", "associated", "with", "the", "transferrin", "receptor", "(", "TfR", ")", "in", "duodenal", "crypt", "cells", "and", "proposed", "that", "mutations", "in", "HFE", "attenuate", "the", "uptake", "of", "transferrin", "-", "bound", "iron", "from", "plasma", "by", "duodenal", "crypt", "cells", ",", "leading", "to", "up", "-", "regulation", "of", "transporters", "for", "dietary", "iron", ".", "Here", ",", "we", "tested", "the", "hypothesis", "that", "HFE", "-", "/", "-", "mice", "have", "increased", "duodenal", "expression", "of", "the", "divalent", "metal", "transporter", "(", "DMT1", ")", ".", "By", "4", "weeks", "of", "age", ",", "the", "HFE", "-", "/", "-", "mice", "demonstrated", "iron", "loading", "when", "compared", "with", "HFE", "+", "/", "+", "littermates", ",", "with", "elevated", "transferrin", "saturations", "(", "68", ".", "4", "%", "vs", ".", "49", ".", "8", "%", ")", "and", "elevated", "liver", "iron", "concentrations", "(", "985", "micrograms", "vs", ".", "381", "micrograms", ")", ".", "By", "using", "Northern", "blot", "analyses", ",", "we", "quantitated", "duodenal", "expression", "of", "both", "classes", "of", "DMT1", "transcripts", "one", "containing", "an", "iron", "responsive", "element", "(", "IRE", ")", ",", "called", "DMT1", "(", "IRE", ")", ",", "and", "one", "containing", "no", "IRE", ",", "called", "DMT1", "(", "non", "-", "IRE", ")", ".", "The", "positive", "control", "for", "DMT1", "up", "-", "regulation", "was", "a", "murine", "model", "of", "dietary", "iron", "deficiency", "that", "demonstrated", "greatly", "increased", "levels", "of", "duodenal", "DMT1", "(", "IRE", ")", "mRNA", ".", "HFE", "-", "/", "-", "mice", "also", "demonstrated", "an", "increase", "in", "duodenal", "DMT1", "(", "IRE", ")", "mRNA", "(", "average", "7", ".", "7", "-", "fold", ")", ",", "despite", "their", "elevated", "transferrin", "saturation", "and", "hepatic", "iron", "content", ".", "Duodenal", "expression", "of", "DMT1", "(", "non", "-", "IRE", ")", "was", "not", "increased", ",", "nor", "was", "hepatic", "expression", "of", "DMT1", "increased", ".", "These", "data", "support", "the", "model", "for", "HH", "in", "which", "HFE", "mutations", "lead", "to", "inappropriately", "low", "crypt", "cell", "iron", ",", "with", "resultant", "stabilization", "of", "DMT1", "(", "IRE", ")", "mRNA", ",", "up", "-", "regulation", "of", "DMT1", ",", "and", "increased", "absorption", "of", "dietary", "iron", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
10078732	[ "Neurophysiologic", "follow", "-", "up", "of", "long", "-", "term", "dietary", "treatment", "in", "adult", "-", "onset", "adrenoleukodystrophy", ".", "OBJECTIVE", "To", "monitor", "the", "effects", "of", "dietary", "treatment", "in", "adult", "-", "onset", "adrenoleukodystrophy", "(", "ALD", ")", "by", "means", "of", "somatosensory", "evoked", "potentials", "(", "SEPs", ")", "and", "motor", "evoked", "potentials", "(", "MEPs", ")", ".", "BACKGROUND", "SEPs", "and", "MEPs", "have", "proved", "useful", "in", "revealing", "signs", "of", "progressively", "severe", ",", "central", "dying", "-", "back", "axonopathy", "in", "early", "stages", "of", "adult", "-", "onset", "ALD", ".", "METHODS", "Eight", "patients", "with", "adult", "-", "onset", "ALD", "underwent", "clinical", "examination", ",", "brain", "and", "spine", "MRI", ",", "and", "SEP", "and", "MEP", "studies", "before", "and", "after", "3", "years", "of", "Lorenzos", "oil", "dietary", "therapy", ".", "RESULTS", "Before", "treatment", ",", "brain", "MRI", "was", "normal", "in", "five", "patients", ".", "Three", "of", "these", "patients", "had", "pure", "spinal", "SEP", "abnormalities", "and", "in", "the", "remaining", "two", "patients", "SEPs", "showed", "signs", "of", "involvement", "of", "both", "the", "spinal", "and", "cerebral", "somatosensory", "tracts", ".", "After", "treatment", ",", "the", "three", "patients", "with", "pure", "spinal", "abnormalities", "showed", "clinical", "and", "neurophysiologic", "worsening", ",", "whereas", "the", "two", "patients", "with", "a", "more", "advanced", "stage", "of", "disease", "(", "exhibited", "by", "SEPs", ")", "showed", "substantially", "unchanged", "clinical", "and", "neurophysiologic", "features", ".", "The", "patients", "with", "abnormal", "brain", "MRI", "at", "the", "onset", "of", "treatment", "showed", "clinical", "and", "neurophysiologic", "worsening", ".", "CONCLUSIONS", "Lorenzos", "oil", "therapy", "had", "no", "effect", "on", "patients", "with", "evidence", "of", "inflammatory", "brain", "lesions", ".", "Moreover", ",", "in", "patients", "without", "clear", "signs", "of", "inflammatory", "damage", ",", "this", "treatment", "does", "not", "modify", "significantly", "the", "natural", "course", "of", "the", "disease", ".", "However", ",", "because", "effective", "treatments", "should", "begin", "before", "the", "onset", "of", "severe", "neurologic", "symptoms", ",", "SEPs", "and", "MEPs", "should", "be", "considered", "to", "evaluate", "the", "effectiveness", "of", "other", "experimental", "treatments", "in", "the", "patient", "with", "a", "negative", "brain", "MRI", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
10078749	[ "GCH1", "mutation", "in", "a", "patient", "with", "adult", "-", "onset", "oromandibular", "dystonia", ".", "The", "authors", "report", "a", "mutation", "in", "exon", "5", "of", "GCH1", "in", "a", "patient", "with", "adult", "-", "onset", "oromandibular", "dystonia", "and", "no", "obvious", "family", "history", "of", "dystonia", ".", "The", "patient", "responded", "positively", "to", "treatment", "with", "L", "-", "dopa", ".", "These", "findings", "demonstrate", "that", "GCH1", "mutations", "must", "be", "considered", "even", "in", "patients", "with", "dystonic", "symptoms", "not", "typical", "of", "dopa", "-", "responsive", "dystonia", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 0 ]
10083733	[ "Germline", "mutations", "of", "the", "APC", "gene", "in", "Korean", "familial", "adenomatous", "polyposis", "patients", ".", "We", "extensively", "analyzed", "genomic", "DNA", "and", "messenger", "RNA", "(", "mRNA", ")", "from", "62", "unrelated", "Korean", "patients", "with", "familial", "adenomatous", "polyposis", "(", "FAP", ")", "for", "identification", "of", "germline", "adenomatous", "polyposis", "coli", "(", "APC", ")", "gene", "mutations", ".", "We", "adopted", "both", "single", "-", "strand", "conformation", "polymorphism", "(", "SSCP", ")", "analysis", "and", "a", "method", "of", "analysis", "involving", "the", "reverse", "transcription", "-", "polymerase", "chain", "reaction", "(", "RT", "-", "PCR", ")", "followed", "by", "a", "protein", "truncation", "test", "(", "PTT", ")", ".", "DNA", "sequencing", "confirmed", "all", "alterations", "represented", "by", "aberrant", "bands", ".", "Germline", "mutations", "were", "identified", "in", "38", "patients", "(", "61", "%", ")", ".", "Nineteen", "of", "the", "detected", "mutations", "were", "presumed", "to", "be", "novel", ",", "thus", "emphasizing", "the", "heterogeneity", "of", "the", "mutational", "spectrum", "in", "Korean", "FAP", "patients", ".", "In", "the", "initial", "48", "patients", ",", "SSCP", "analysis", "was", "followed", "by", "PTT", "for", "those", "patients", "for", "whom", "no", "detectable", "mutations", "were", "found", "by", "SSCP", ".", "Using", "this", "combined", "approach", ",", "we", "identified", "germline", "APC", "gene", "mutations", "in", "29", "of", "the", "48", "FAP", "patients", "(", "60", "%", ")", ",", "including", "6", "patients", "in", "whom", "SSCP", "analysis", "failed", "to", "distinguish", "the", "mutant", "allele", ".", "In", "the", "14", "later", "patients", ",", "we", "identified", "truncating", "mutations", "in", "9", "patients", "(", "64", "%", ")", "using", "PTT", "only", ".", "Our", "results", "confirm", "that", "the", "mutation", "detection", "rate", "with", "PTT", "was", "superior", "to", "that", "with", "SSCP", ",", "and", "suggest", "that", "PTT", "would", "be", "a", "more", "practical", "screening", "method", "to", "detect", "germline", "mutations", "of", "the", "APC", "gene", "in", "FAP", "patients", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 7, 8, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 8, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 7, 0, 0 ]
10083734	[ "Molecular", "epidemiology", "of", "C9", "deficiency", "heterozygotes", "with", "an", "Arg95Stop", "mutation", "of", "the", "C9", "gene", "in", "Japan", ".", "Deficiency", "of", "the", "ninth", "component", "of", "human", "complement", "(", "C9", ")", "is", "the", "most", "common", "complement", "deficiency", "in", "Japan", ",", "with", "an", "incidence", "of", "approximately", "one", "homozygote", "in", "1000", ",", "but", "is", "very", "rare", "in", "other", "countries", ".", "Genetic", "analyses", "of", "Japanese", "C9", "deficiency", "have", "shown", "that", "a", "C", "-", "to", "-", "T", "transition", "leading", "to", "TGA", "stop", "codon", "for", "Arg95", "in", "exon", "4", "of", "the", "C9", "gene", "(", "Arg95Stop", ")", "is", "common", "in", "Japanese", "C9", "deficiency", ".", "To", "determine", "the", "prevalence", "of", "heterozygous", "carriers", "of", "the", "Arg95Stop", "mutation", "in", "a", "Japanese", "population", ",", "we", "collected", "DNA", "samples", "from", "300", "individuals", "in", "two", "of", "the", "four", "main", "islands", "of", "Japan", ".", "Heterozygote", "detection", "was", "performed", "with", "an", "allele", "-", "specific", "polymerase", "chain", "reaction", "(", "PCR", ")", "system", "designed", "to", "detect", "exclusively", "only", "one", "of", "the", "normal", "and", "mutant", "alleles", ",", "followed", "by", "confirmation", "with", "PCR", "/", "single", "-", "strand", "conformation", "polymorphism", "(", "SSCP", ")", "analysis", "and", "direct", "sequencing", ".", "Twenty", "individuals", "were", "heterozygous", "for", "the", "Arg95Stop", "mutation", ".", "was", "homozygous", ".", "The", "prevalence", "of", "carriers", "of", "the", "Arg95Stop", "mutation", "was", "6", ".", "7", "%", "(", "20", "/", "300", ")", ".", "An", "estimated", "frequency", "(", "0", ".", "12", "%", ")", "of", "complete", "C9", "deficiency", "due", "to", "homozygous", "Arg95Stop", "mutation", "was", "consistent", "with", "frequencies", "determined", "by", "serological", "studies" ]	[ 0, 0, 0, 7, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 4, 4, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
10085150	[ "The", "hereditary", "hemochromatosis", "protein", ",", "HFE", ",", "specifically", "regulates", "transferrin", "-", "mediated", "iron", "uptake", "in", "HeLa", "cells", ".", "HFE", "is", "the", "protein", "product", "of", "the", "gene", "mutated", "in", "the", "autosomal", "recessive", "disease", "hereditary", "hemochromatosis", "(", "Feder", ",", "J", ".", "N", ".", ",", "Gnirke", ",", "A", ".", ",", "Thomas", ",", "W", ".", ",", "Tsuchihashi", ",", "Z", ".", ",", "Ruddy", ",", "D", ".", "A", ".", ",", "Basava", ",", "A", ".", ",", "Dormishian", ",", "F", ".", ",", "Domingo", ",", "R", ".", "J", ".", ",", "Ellis", ",", "M", ".", "C", ".", ",", "Fullan", ",", "A", ".", ",", "Hinton", ",", "L", ".", "M", ".", ",", "Jones", ",", "N", ".", "L", ".", ",", "Kimmel", ",", "B", ".", "E", ".", ",", "Kronmal", ",", "G", ".", "S", ".", ",", "Lauer", ",", "P", ".", ",", "Lee", ",", "V", ".", "K", ".", ",", "Loeb", ",", "D", ".", "B", ".", ",", "Mapa", ",", "F", ".", "A", ".", ",", "McClelland", ",", "E", ".", ",", "Meyer", ",", "N", ".", "C", ".", ",", "Mintier", ",", "G", ".", "A", ".", ",", "Moeller", ",", "N", ".", ",", "Moore", ",", "T", ".", ",", "Morikang", ",", "E", ".", ",", "Prasss", ",", "C", ".", "E", ".", ",", "Quintana", ",", "L", ".", ",", "Starnes", ",", "S", ".", "M", ".", ",", "Schatzman", ",", "R", ".", "C", ".", ",", "Brunke", ",", "K", ".", "J", ".", ",", "Drayna", ",", "D", ".", "T", ".", ",", "Risch", ",", "N", ".", "J", ".", ",", "Bacon", ",", "B", ".", "R", ".", ",", "and", "Wolff", ",", "R", ".", "R", ".", "(", "1996", ")", "Nat", ".", "Genet", ".", "13", ",", "399", "-", "408", ")", ".", "At", "the", "cell", "surface", ",", "HFE", "complexes", "with", "transferrin", "receptor", "(", "TfR", ")", ",", "increasing", "the", "dissociation", "constant", "of", "transferrin", "(", "Tf", ")", "for", "its", "receptor", "10", "-", "fold", "(", "Gross", ",", "C", ".", "N", ".", ",", "Irrinki", ",", "A", ".", ",", "Feder", ",", "J", ".", "N", ".", ",", "and", "Enns", ",", "C", ".", "A", ".", "(", "1998", ")", "J", ".", "Biol", ".", "Chem", ".", "273", ",", "22068", "-", "22074", ";", "Feder", ",", "J", ".", "N", ".", ",", "Penny", ",", "D", ".", "M", ".", ",", "Irrinki", ",", "A", ".", ",", "Lee", ",", "V", ".", "K", ".", ",", "Lebron", ",", "J", ".", "A", ".", ",", "Watson", ",", "N", ".", ",", "Tsuchihashi", ",", "Z", ".", ",", "Sigal", ",", "E", ".", ",", "Bjorkman", ",", "P", ".", "J", ".", ",", "and", "Schatzman", ",", "R", ".", "C", ".", "(", "1998", ")", "Proc", ".", "Natl", ".", "Acad", ".", "Sci", ".", "U", "S", "A", "95", ",", "1472", "-", "1477", ")", ".", "HFE", "does", "not", "remain", "at", "the", "cell", "surface", ",", "but", "traffics", "with", "TfR", "to", "Tf", "-", "positive", "internal", "compartments", "(", "Gross", "et", "al", ".", ",", "1998", ")", ".", "Using", "a", "HeLa", "cell", "line", "in", "which", "the", "expression", "of", "HFE", "is", "controlled", "by", "tetracycline", ",", "we", "show", "that", "the", "expression", "of", "HFE", "reduces", "55Fe", "uptake", "from", "Tf", "by", "33", "%", "but", "does", "not", "affect", "the", "endocytic", "or", "exocytic", "rates", "of", "TfR", "cycling", ".", "Therefore", ",", "HFE", "appears", "to", "reduce", "cellular", "acquisition", "of", "iron", "from", "Tf", "within", "endocytic", "compartments", ".", "HFE", "specifically", "reduces", "iron", "uptake", "from", "Tf", ",", "as", "non", "-", "Tf", "-", "mediated", "iron", "uptake", "from", "Fe", "-", "nitrilotriacetic", "acid", "is", "not", "altered", ".", "These", "results", "explain", "the", "decreased", "ferritin", "levels", "seen", "in", "our", "HeLa", "cell", "system", "and", "demonstrate", "the", "specific", "control", "of", "HFE", "over", "the", "Tf", "-", "mediated", "pathway", "of", "iron", "uptake", ".", "These", "results", "also", "have", "implications", "for", "the", "understanding", "of", "cellular", "iron", "homeostasis", "in", "organs", "such", "as", "the", "liver", ",", "pancreas", ",", "heart", ",", "and", "spleen", "that", "are", "iron", "loaded", "in", "hereditary", "hemochromatotic", "individuals", "lacking", "functional", "HFE", "." ]	[ 0, 7, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 0, 0, 0, 0, 0 ]
10090880	[ "Mutation", "and", "haplotype", "studies", "of", "familial", "Mediterranean", "fever", "reveal", "new", "ancestral", "relationships", "and", "evidence", "for", "a", "high", "carrier", "frequency", "with", "reduced", "penetrance", "in", "the", "Ashkenazi", "Jewish", "population", ".", "Familial", "Mediterranean", "fever", "(", "FMF", ")", "is", "a", "recessive", "disorder", "characterized", "by", "episodes", "of", "fever", "with", "serositis", "or", "synovitis", ".", "The", "FMF", "gene", "(", "MEFV", ")", "was", "cloned", "recently", ",", "and", "four", "missense", "mutations", "were", "identified", ".", "Here", "we", "present", "data", "from", "non", "-", "Ashkenazi", "Jewish", "and", "Arab", "patients", "in", "whom", "we", "had", "not", "originally", "found", "mutations", "and", "from", "a", "new", ",", "more", "ethnically", "diverse", "panel", ".", "Among", "90", "symptomatic", "mutation", "-", "positive", "individuals", ",", "11", "mutations", "accounted", "for", "79", "%", "of", "carrier", "chromosomes", ".", "Of", "the", "two", "mutations", "that", "are", "novel", ",", "one", "alters", "the", "same", "residue", "(", "680", ")", "as", "a", "previously", "known", "mutation", ",", "and", "the", "other", "(", "P369S", ")", "is", "located", "in", "exon", "3", ".", "Consistent", "with", "another", "recent", "report", ",", "the", "E148Q", "mutation", "was", "observed", "in", "patients", "of", "several", "ethnicities", "and", "on", "multiple", "microsatellite", "haplotypes", ",", "but", "haplotype", "data", "indicate", "an", "ancestral", "relationships", "between", "non", "-", "Jewish", "Italian", "and", "Ashkenazi", "Jewish", "patients", "with", "FMF", "and", "other", "affected", "populations", ".", "Among", "approximately", "200", "anonymous", "Ashkenazi", "Jewish", "DNA", "samples", ",", "the", "MEFV", "carrier", "frequency", "was", "21", "%", ",", "with", "E148Q", "the", "most", "common", "mutation", ".", "Several", "lines", "of", "evidence", "indicate", "reduced", "penetrance", "among", "Ashkenazi", "Jews", ",", "especially", "for", "E148Q", ",", "P369S", ",", "and", "K695R", ".", "Nevertheless", ",", "E148Q", "helps", "account", "for", "recessive", "inheritance", "in", "an", "Ashkenazi", "family", "previously", "reported", "as", "an", "unusual", "case", "of", "dominantly", "inherited", "FMF", ".", "The", "presence", "of", "three", "frequent", "MEFV", "mutations", "in", "multiple", "Mediterranean", "populations", "strongly", "suggests", "a", "heterozygote", "advantage", "in", "this", "geographic", "region", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
10090885	[ "Autoimmune", "lymphoproliferative", "syndrome", "with", "defective", "Fas", ":", "genotype", "influences", "penetrance", ".", "Autoimmune", "lymphoproliferative", "syndrome", "(", "ALPS", ")", "is", "a", "disorder", "of", "lymphocyte", "homeostasis", "and", "immunological", "tolerance", ".", "Most", "patients", "have", "a", "heterozygous", "mutation", "in", "the", "APT1", "gene", ",", "which", "encodes", "Fas", "(", "CD95", ",", "APO", "-", "1", ")", ",", "mediator", "of", "an", "apoptotic", "pathway", "crucial", "to", "lymphocyte", "homeostasis", ".", "Of", "17", "unique", "APT1", "mutations", "in", "unrelated", "ALPS", "probands", ",", "12", "(", "71", "%", ")", "occurred", "in", "exons", "7", "-", "9", ",", "which", "encode", "the", "intracellular", "portion", "of", "Fas", ".", "In", "vitro", ",", "activated", "lymphocytes", "from", "all", "17", "patients", "showed", "apoptotic", "defects", "when", "exposed", "to", "an", "anti", "-", "Fas", "agonist", "monoclonal", "antibody", ".", "Similar", "defects", "were", "found", "in", "a", "Fas", "-", "negative", "cell", "line", "transfected", "with", "cDNAs", "bearing", "each", "of", "the", "mutations", ".", "In", "cotransfection", "experiments", ",", "Fas", "constructs", "with", "either", "intra", "-", "or", "extracellular", "mutations", "caused", "dominant", "inhibition", "of", "apoptosis", "mediated", "by", "wild", "-", "type", "Fas", ".", "Two", "missense", "Fas", "variants", ",", "not", "restricted", "to", "patients", "with", "ALPS", ",", "were", "identified", ".", "Variant", "A", "(", "-", "1", ")", "T", "at", "the", "Fas", "signal", "-", "sequence", "cleavage", "site", ",", "which", "mediates", "apoptosis", "less", "well", "than", "wild", "-", "type", "Fas", "and", "is", "partially", "inhibitory", ",", "was", "present", "in", "13", "%", "of", "African", "American", "alleles", ".", "Among", "the", "ALPS", "-", "associated", "Fas", "mutants", ",", "dominant", "inhibition", "of", "apoptosis", "was", "much", "more", "pronounced", "in", "mutants", "affecting", "the", "intracellular", ",", "versus", "extracellular", ",", "portion", "of", "the", "Fas", "receptor", ".", "Mutations", "causing", "disruption", "of", "the", "intracellular", "Fas", "death", "domain", "also", "showed", "a", "higher", "penetrance", "of", "ALPS", "phenotype", "features", "in", "mutation", "-", "bearing", "relatives", ".", "Significant", "ALPS", "-", "related", "morbidity", "occurred", "in", "44", "%", "of", "relatives", "with", "intracellular", "mutations", ",", "versus", "0", "%", "of", "relatives", "with", "extracellular", "mutations", ".", "Thus", ",", "the", "location", "of", "mutations", "within", "APT1", "strongly", "influences", "the", "development", "and", "the", "severity", "of", "ALPS", "." ]	[ 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 6, 6, 6, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0 ]
10090890	[ "Multicentric", "origin", "of", "hemochromatosis", "gene", "(", "HFE", ")", "mutations", ".", "Genetic", "hemochromatosis", "(", "GH", ")", "is", "believed", "to", "be", "a", "disease", "restricted", "to", "those", "of", "European", "ancestry", ".", "In", "northwestern", "Europe", ",", ">", "80", "%", "of", "GH", "patients", "are", "homozygous", "for", "one", "mutation", ",", "the", "substitution", "of", "tyrosine", "for", "cysteine", "at", "position", "282", "(", "C282Y", ")", "in", "the", "unprocessed", "protein", ".", "In", "a", "proportion", "of", "GH", "patients", ",", "two", "mutations", "are", "present", ",", "C282Y", "and", "H63D", ".", "The", "clinical", "significance", "of", "this", "second", "mutation", "is", "such", "that", "it", "appears", "to", "predispose", "1", "%", "-", "2", "%", "of", "compound", "heterozygotes", "to", "expression", "of", "the", "disease", ".", "The", "distribution", "of", "the", "two", "mutations", "differ", ",", "C282Y", "being", "limited", "to", "those", "of", "northwestern", "European", "ancestry", "and", "H63D", "being", "found", "at", "allele", "frequencies", ">", "5", "%", ",", "in", "Europe", ",", "in", "countries", "bordering", "the", "Mediterranean", ",", "in", "the", "Middle", "East", ",", "and", "in", "the", "Indian", "subcontinent", ".", "The", "C282Y", "mutation", "occurs", "on", "a", "haplotype", "that", "extends", "<", "/", "=", "6", "Mb", ",", "suggesting", "that", "this", "mutation", "has", "arisen", "during", "the", "past", "2", ",", "000", "years", ".", "The", "H63D", "mutation", "is", "older", "and", "does", "not", "occur", "on", "such", "a", "large", "extended", "haplotype", ",", "the", "haplotype", "in", "this", "case", "extending", "<", "/", "=", "700", "kb", ".", "Here", "we", "report", "the", "finding", "of", "the", "H63D", "and", "C282Y", "mutations", "on", "new", "haplotypes", ".", "In", "Sri", "Lanka", "we", "have", "found", "H63D", "on", "three", "new", "haplotypes", "and", "have", "found", "C282Y", "on", "one", "new", "haplotype", ",", "demonstrating", "that", "these", "mutations", "have", "arisen", "independently", "on", "this", "island", ".", "These", "results", "suggest", "that", "the", "HFE", "gene", "has", "been", "the", "subject", "of", "selection", "pressure", ".", "These", "selection", "pressures", "could", "be", "due", "to", "infectious", "diseases", ",", "environmental", "conditions", ",", "or", "other", "genetic", "disorders", "such", "as", "anemia", "." ]	[ 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 1, 0 ]
10094552	[ "A", "retrospective", "anonymous", "pilot", "study", "in", "screening", "newborns", "for", "HFE", "mutations", "in", "Scandinavian", "populations", ".", "We", "have", "retrospectively", "analyzed", "837", "random", "anonymized", "dried", "blood", "spot", "(", "DBS", ")", "samples", "from", "neonatal", "screening", "programs", "in", "Scandinavia", "for", "mutations", "in", "HFE", ",", "the", "candidate", "gene", "for", "hemochromatosis", ".", "We", "have", "found", "C282Y", "allele", "frequencies", "of", "2", ".", "3", "%", "(", "+", "2", ".", "0", "%", ")", "(", "-", "1", ".", "3", "%", ")", "in", "Greenland", ",", "4", ".", "5", "%", "+", "/", "-", "1", ".", "9", "%", "in", "Iceland", ",", "5", ".", "1", "%", "+", "/", "-", "2", ".", "3", "%", "in", "the", "Faeroe", "Islands", ",", "and", "8", ".", "2", "%", "+", "/", "-", "2", ".", "7", "%", "in", "Denmark", ".", "The", "high", "prevalence", "of", "HFE", "mutations", "in", "Denmark", "suggests", "that", "population", "screening", "for", "the", "C282Y", "mutation", "could", "be", "highly", "advantageous", "in", "terms", "of", "preventive", "health", "care", ".", "Long", "-", "term", "follow", "-", "up", "evaluation", "of", "C282Y", "homozygotes", "and", "H63D", "/", "C282Y", "compound", "heterozygotes", "will", "give", "an", "indication", "of", "the", "penetrance", "of", "the", "mutations", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
10094559	[ "Identification", "of", "the", "mutation", "in", "the", "alkaptonuria", "mouse", "model", ".", "Alkaptonuria", "(", "aku", ")", ",", "an", "inborn", "error", "of", "metabolism", "caused", "by", "the", "loss", "of", "homogentisate", "1", ",", "2", "-", "dioxygenase", "(", "HGD", ")", ",", "has", "been", "described", "in", "a", "mouse", "model", "created", "by", "ethylnitrosourea", "mutagenesis", "but", "the", "mutation", "in", "these", "mice", "has", "not", "previously", "been", "identified", ".", "We", "used", "RT", "-", "PCR", "to", "amplify", "the", "Hgd", "cDNA", "from", "Hgd", "(", "aku", ")", "/", "Hgd", "(", "aku", ")", "mice", ".", "Two", "products", "shorter", "than", "the", "wild", "-", "type", "product", "were", "amplified", ".", "Restriction", "mapping", "and", "DNA", "sequencing", "were", "then", "used", "to", "identify", "the", "Hgd", "(", "aku", ")", "mouse", "mutation", ",", "found", "to", "be", "a", "single", "base", "change", "in", "a", "splice", "donor", "consensus", "sequence", ",", "causing", "exon", "skipping", "and", "frame", "-", "shifted", "products", ".", "This", "base", "change", "allowed", "us", "to", "create", "a", "non", "-", "radioactive", "genotyping", "assay", "for", "this", "allele", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 3, 0, 3, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
10190331	[ "Non", "-", "syndromic", "hearing", "loss", "associated", "with", "enlarged", "vestibular", "aqueduct", "is", "caused", "by", "PDS", "mutations", ".", "Enlarged", "vestibular", "aqueduct", "(", "EVA", ")", ",", "known", "as", "the", "most", "common", "form", "of", "inner", "ear", "abnormality", ",", "has", "recently", "been", "of", "particular", "genetic", "interest", "because", "this", "anomaly", "is", "inherited", "in", "a", "recessive", "manner", ".", "The", "locus", "for", "non", "-", "syndromic", "sensorineural", "hearing", "loss", "with", "EVA", "has", "been", "mapped", "to", "the", "same", "chromosomal", "region", ",", "7q31", ",", "as", "the", "Pendred", "syndrome", "locus", ".", "In", "the", "present", "study", ",", "seven", "mutations", "in", "the", "PDS", "gene", "(", "PDS", ")", ",", "the", "gene", "responsible", "for", "Pendred", "syndrome", ",", "have", "been", "found", "in", "families", "of", "non", "-", "syndromic", "sensorineural", "hearing", "loss", "with", "EVA", ".", "One", "family", "is", "homozygous", ",", "three", "families", "are", "compound", "heterozygotes", ",", "and", "two", "families", "are", "heterozygous", "but", "with", "no", "other", "mutation", "detected", ".", "The", "present", "results", "provide", "evidence", "that", "mutations", "in", "PDS", "cause", "both", "syndromic", "and", "non", "-", "syndromic", "hearing", "loss", ".", "." ]	[ 3, 4, 4, 4, 4, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 4, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 4, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 6, 6, 6, 6, 0, 0 ]
10190819	[ "Mutational", "analysis", "and", "genotype", "-", "phenotype", "correlation", "of", "29", "unrelated", "Japanese", "patients", "with", "X", "-", "linked", "adrenoleukodystrophy", ".", "BACKGROUND", "X", "-", "linked", "adrenoleukodystrophy", "(", "ALD", ")", "is", "an", "inherited", "disease", "characterized", "by", "progressive", "neurologic", "dysfunction", ",", "occasionally", "associated", "with", "adrenal", "insufficiency", ".", "The", "classic", "form", "of", "ALD", "usually", "has", "onset", "in", "childhood", "(", "childhood", "cerebral", "ALD", ")", ",", "with", "rapid", "neurologic", "deterioration", "leading", "to", "a", "vegetative", "state", ".", "Adult", "-", "onset", "cerebral", "ALD", "also", "presents", "with", "rapidly", "progressive", "neurologic", "dysfunction", ".", "Milder", "phenotypes", "such", "as", "adrenomyeloneuropathy", "and", "Addison", "disease", "only", "also", "have", "been", "recognized", ".", "Despite", "discovery", "of", "the", "causative", "gene", ",", "a", "molecular", "basis", "for", "the", "diverse", "clinical", "presentations", "remains", "to", "be", "elucidated", ".", "OBJECTIVES", "To", "conduct", "mutational", "analyses", "in", "29", "Japanese", "patients", "with", "ALD", "from", "29", "unrelated", "families", ",", "to", "obtain", "knowledge", "of", "the", "spectrum", "of", "mutations", "in", "this", "gene", ",", "and", "to", "study", "genotype", "-", "phenotype", "correlations", "in", "Japanese", "patients", ".", "METHODS", "The", "29", "patients", "comprised", "13", "patients", "with", "childhood", "cerebral", "ALD", ",", "11", "patients", "with", "adult", "-", "onset", "cerebral", "ALD", ",", "and", "5", "patients", "with", "adrenomyeloneuropathy", ".", "We", "conducted", "detailed", "mutational", "analyses", "of", "29", "unrelated", "Japanese", "patients", "with", "ALD", "by", "genomic", "Southern", "blot", "analysis", "and", "direct", "nucleotide", "sequence", "analysis", "of", "reverse", "transcriptase", "-", "polymerase", "chain", "reaction", "products", "derived", "from", "total", "RNA", "that", "was", "extracted", "from", "cultured", "skin", "fibroblasts", ",", "lymphoblastoid", "cells", ",", "or", "peripheral", "blood", "leukocytes", ".", "RESULTS", "Three", "patients", "with", "adult", "-", "onset", "cerebral", "ALD", "were", "identified", "as", "having", "large", "genomic", "rearrangements", ".", "The", "remaining", "26", "patients", "were", "identified", "as", "having", "21", "independent", "mutations", ",", "including", "12", "novel", "mutations", "resulting", "in", "small", "nucleotide", "alterations", "in", "the", "ALD", "gene", ".", "Eighteen", "(", "69", "%", ")", "of", "26", "mutations", "were", "missense", "mutations", ".", "Most", "missense", "mutations", "involved", "amino", "acids", "conserved", "in", "homologous", "gene", "products", ",", "including", "PMP70", ",", "mALDRP", ",", "and", "Pxa1p", ".", "The", "AG", "dinucleotide", "deletion", "at", "position", "1081", "-", "1082", ",", "which", "has", "been", "reported", "previously", "to", "be", "the", "most", "common", "mutation", "in", "white", "patients", "(", "12", "%", "-", "17", "%", ")", ",", "was", "also", "identified", "as", "the", "most", "common", "mutation", "in", "Japanese", "patients", "(", "12", "%", ")", ".", "All", "phenotypes", "were", "associated", "with", "mutations", "resulting", "in", "protein", "truncation", "or", "subtle", "amino", "acid", "changes", ".", "There", "were", "no", "differences", "in", "phenotypic", "expressions", "between", "missense", "mutations", "involving", "conserved", "amino", "acids", "and", "those", "involving", "nonconserved", "amino", "acids", ".", "CONCLUSIONS", "There", "are", "no", "obvious", "correlations", "between", "the", "phenotypes", "of", "patients", "with", "ALD", "and", "their", "genotypes", ",", "suggesting", "that", "other", "genetic", "or", "environmental", "factors", "modify", "the", "phenotypic", "expressions", "of", "ALD", ".", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0 ]
10192393	[ "A", "common", "human", "skin", "tumour", "is", "caused", "by", "activating", "mutations", "in", "beta", "-", "catenin", ".", "WNT", "signalling", "orchestrates", "a", "number", "of", "developmental", "programs", ".", "In", "response", "to", "this", "stimulus", ",", "cytoplasmic", "beta", "-", "catenin", "(", "encoded", "by", "CTNNB1", ")", "is", "stabilized", ",", "enabling", "downstream", "transcriptional", "activation", "by", "members", "of", "the", "LEF", "/", "TCF", "family", ".", "One", "of", "the", "target", "genes", "for", "beta", "-", "catenin", "/", "TCF", "encodes", "c", "-", "MYC", ",", "explaining", "why", "constitutive", "activation", "of", "the", "WNT", "pathway", "can", "lead", "to", "cancer", ",", "particularly", "in", "the", "colon", ".", "Most", "colon", "cancers", "arise", "from", "mutations", "in", "the", "gene", "encoding", "adenomatous", "polyposis", "coli", "(", "APC", ")", ",", "a", "protein", "required", "for", "ubiquitin", "-", "mediated", "degradation", "of", "beta", "-", "catenin", ",", "but", "a", "small", "percentage", "of", "colon", "and", "some", "other", "cancers", "harbour", "beta", "-", "catenin", "-", "stabilizing", "mutations", ".", "Recently", ",", "we", "discovered", "that", "transgenic", "mice", "expressing", "an", "activated", "beta", "-", "catenin", "are", "predisposed", "to", "developing", "skin", "tumours", "resembling", "pilomatricomas", ".", "Given", "that", "the", "skin", "of", "these", "adult", "mice", "also", "exhibits", "signs", "of", "de", "novo", "hair", "-", "follicle", "morphogenesis", ",", "we", "wondered", "whether", "human", "pilomatricomas", "might", "originate", "from", "hair", "matrix", "cells", "and", "whether", "they", "might", "possess", "beta", "-", "catenin", "-", "stabilizing", "mutations", ".", "Here", ",", "we", "explore", "the", "cell", "origin", "and", "aetiology", "of", "this", "common", "human", "skin", "tumour", ".", "We", "found", "nuclear", "LEF", "-", "1", "in", "the", "dividing", "tumour", "cells", ",", "providing", "biochemical", "evidence", "that", "pilomatricomas", "are", "derived", "from", "hair", "matrix", "cells", ".", "At", "least", "75", "%", "of", "these", "tumours", "possess", "mutations", "affecting", "the", "amino", "-", "terminal", "segment", ",", "normally", "involved", "in", "phosphorylation", "-", "dependent", ",", "ubiquitin", "-", "mediated", "degradation", "of", "the", "protein", ".", "This", "percentage", "of", "CTNNB1", "mutations", "is", "greater", "than", "in", "all", "other", "human", "tumours", "examined", "thus", "far", ",", "and", "directly", "implicates", "beta", "-", "catenin", "/", "LEF", "misregulation", "as", "the", "major", "cause", "of", "hair", "matrix", "cell", "tumorigenesis", "in", "humans", ".", "." ]	[ 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 6, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
10192399	[ "The", "Pendred", "syndrome", "gene", "encodes", "a", "chloride", "-", "iodide", "transport", "protein", ".", "Pendred", "syndrome", "is", "the", "most", "common", "form", "of", "syndromic", "deafness", "and", "characterized", "by", "congenital", "sensorineural", "hearing", "loss", "and", "goitre", ".", "This", "disorder", "was", "mapped", "to", "chromosome", "7", "and", "the", "gene", "causing", "Pendred", "syndrome", "(", "PDS", ")", "was", "subsequently", "identified", "by", "positional", "cloning", ".", "PDS", "encodes", "a", "putative", "transmembrane", "protein", "designated", "pendrin", ".", "Pendrin", "is", "closely", "related", "to", "a", "family", "of", "sulfate", "transport", "proteins", "that", "includes", "the", "rat", "sulfate", "-", "anion", "transporter", "(", "encoded", "by", "Sat", "-", "1", ";", "29", "%", "amino", "acid", "sequence", "identity", ")", ",", "the", "human", "diastrophic", "dysplasia", "sulfate", "transporter", "(", "encoded", "by", "DTD", ";", "32", "%", ")", "and", "the", "human", "sulfate", "transporter", "downregulated", "in", "adenoma", "(", "encoded", "by", "DRA", ";", "45", "%", ")", ".", "On", "the", "basis", "of", "this", "homology", "and", "the", "presence", "of", "a", "slightly", "modified", "sulfate", "-", "transporter", "signature", "sequence", "comprising", "its", "putative", "second", "transmembrane", "domain", ",", "pendrin", "has", "been", "proposed", "to", "function", "as", "a", "sulfate", "transporter", ".", "We", "were", "unable", "to", "detect", "evidence", "of", "sulfate", "transport", "following", "the", "expression", "of", "pendrin", "in", "Xenopus", "laevis", "oocytes", "by", "microinjection", "of", "PDS", "cRNA", "or", "in", "Sf9", "cells", "following", "infection", "with", "PDS", "-", "recombinant", "baculovirus", ".", "The", "rates", "of", "transport", "for", "iodide", "and", "chloride", "were", "significantly", "increased", "following", "the", "expression", "of", "pendrin", "in", "both", "cell", "systems", ".", "Our", "results", "demonstrate", "that", "pendrin", "functions", "as", "a", "transporter", "of", "chloride", "and", "iodide", ",", "but", "not", "sulfate", ",", "and", "may", "provide", "insight", "into", "thyroid", "physiology", "and", "the", "pathophysiology", "of", "Pendred", "syndrome", ".", "." ]	[ 0, 7, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0 ]
10194428	[ "HFE", "mutations", "analysis", "in", "711", "hemochromatosis", "probands", ":", "evidence", "for", "S65C", "implication", "in", "mild", "form", "of", "hemochromatosis", ".", "Hereditary", "hemochromatosis", "(", "HH", ")", "is", "a", "common", "autosomal", "recessive", "genetic", "disorder", "of", "iron", "metabolism", ".", "The", "HFE", "candidate", "gene", "encoding", "an", "HLA", "class", "I", "-", "like", "protein", "involved", "in", "HH", "was", "identified", "in", "1996", ".", "Two", "missense", "mutations", "have", "been", "described", "C282Y", ",", "accounting", "for", "80", "%", "to", "90", "%", "of", "HH", "chromosomes", ",", "and", "H63D", ",", "which", "is", "associated", "with", "a", "milder", "form", "of", "the", "disease", "representing", "40", "%", "to", "70", "%", "of", "non", "-", "C282Y", "HH", "chromosomes", ".", "We", "report", "here", "on", "the", "analysis", "of", "C282Y", ",", "H63D", ",", "and", "the", "193A", "-", "-", ">", "T", "substitution", "leading", "to", "the", "S65C", "missense", "substitution", "in", "a", "large", "series", "of", "probands", "and", "controls", ".", "The", "results", "confirm", "that", "the", "C282Y", "substitution", "was", "the", "main", "mutation", "involved", "in", "hemochromatosis", ",", "accounting", "for", "85", "%", "of", "carrier", "chromosomes", ",", "whereas", "the", "H63D", "substitution", "represented", "39", "%", "of", "the", "HH", "chromosomes", "that", "did", "not", "carry", "the", "C282Y", "mutation", ".", "In", "addition", ",", "our", "screening", "showed", "that", "the", "S65C", "substitution", "was", "significantly", "enriched", "in", "probands", "with", "at", "least", "one", "chromosome", "without", "an", "assigned", "mutation", ".", "This", "substitution", "accounted", "for", "7", ".", "8", "%", "of", "HH", "chromosomes", "that", "were", "neither", "C282Y", "nor", "H63D", ".", "This", "enrichment", "of", "S65C", "among", "HH", "chromosomes", "suggests", "that", "the", "S65C", "substitution", "is", "associated", "with", "the", "mild", "form", "of", "hemochromatosis", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 3, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0 ]
10196379	[ "Germline", "BRCA1", "alterations", "in", "a", "population", "-", "based", "series", "of", "ovarian", "cancer", "cases", ".", "The", "objective", "of", "this", "study", "was", "to", "provide", "more", "accurate", "frequency", "estimates", "of", "breast", "cancer", "susceptibility", "gene", "1", "(", "BRCA1", ")", "germline", "alterations", "in", "the", "ovarian", "cancer", "population", ".", "To", "achieve", "this", ",", "we", "determined", "the", "prevalence", "of", "BRCA1", "alterations", "in", "a", "population", "-", "based", "series", "of", "consecutive", "ovarian", "cancer", "cases", ".", "This", "is", "the", "first", "population", "-", "based", "ovarian", "cancer", "study", "reporting", "BRCA1", "alterations", "derived", "from", "a", "comprehensive", "screen", "of", "the", "entire", "coding", "region", ".", "One", "hundred", "and", "seven", "ovarian", "cancer", "cases", "were", "analyzed", "for", "BRCA1", "alterations", "using", "the", "RNase", "mismatch", "cleavage", "assay", "followed", "by", "direct", "sequencing", ".", "Two", "truncating", "mutations", ",", "962del4", "and", "3600del11", ",", "were", "identified", ".", "Both", "patients", "had", "a", "family", "history", "of", "breast", "or", "ovarian", "cancer", ".", "Several", "novel", "as", "well", "as", "previously", "reported", "uncharacterized", "variants", "were", "also", "identified", ",", "some", "of", "which", "were", "associated", "with", "a", "family", "history", "of", "cancer", ".", "The", "frequency", "distribution", "of", "common", "polymorphisms", "was", "determined", "in", "the", "91", "Caucasian", "cancer", "cases", "in", "this", "series", "and", "24", "sister", "controls", "using", "allele", "-", "specific", "amplification", ".", "The", "rare", "form", "of", "the", "Q356R", "polymorphism", "was", "significantly", "(", "P", "=", "0", ".", "03", ")", "associated", "with", "a", "family", "history", "of", "ovarian", "cancer", ",", "suggesting", "that", "this", "polymorphism", "may", "influence", "ovarian", "cancer", "risk", ".", "In", "summary", ",", "our", "data", "suggest", "a", "role", "for", "some", "uncharacterized", "variants", "and", "rare", "forms", "of", "polymorphisms", "in", "determining", "ovarian", "cancer", "risk", ",", "and", "highlight", "the", "necessity", "to", "screen", "for", "missense", "alterations", "as", "well", "as", "truncating", "mutations", "in", "this", "population", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
10196381	[ "Adrenoleukodystrophy", "-", "related", "protein", "can", "compensate", "functionally", "for", "adrenoleukodystrophy", "protein", "deficiency", "(", "X", "-", "ALD", ")", ":", "implications", "for", "therapy", ".", "Inherited", "defects", "in", "the", "peroxisomal", "ATP", "-", "binding", "cassette", "(", "ABC", ")", "transporter", "adrenoleukodystrophy", "protein", "(", "ALDP", ")", "lead", "to", "the", "lethal", "peroxisomal", "disorder", "X", "-", "linked", "adrenoleukodystrophy", "(", "X", "-", "ALD", ")", ",", "for", "which", "no", "efficient", "treatment", "has", "been", "established", "so", "far", ".", "Three", "other", "peroxisomal", "ABC", "transporters", "currently", "are", "known", "adrenoleukodystrophy", "-", "related", "protein", "(", "ALDRP", ")", ",", "70", "kDa", "peroxisomal", "membrane", "protein", "(", "PMP70", ")", "and", "PMP70", "-", "related", "protein", ".", "By", "using", "transient", "and", "stable", "overexpression", "of", "human", "cDNAs", "encoding", "ALDP", "and", "its", "closest", "relative", "ALDRP", ",", "we", "could", "restore", "the", "impaired", "peroxisomal", "beta", "-", "oxidation", "in", "fibroblasts", "of", "X", "-", "ALD", "patients", ".", "The", "pathognomonic", "accumulation", "of", "very", "long", "chain", "fatty", "acids", "could", "also", "be", "prevented", "by", "overexpression", "of", "ALDRP", "in", "immortalized", "X", "-", "ALD", "cells", ".", "Immunofluorescence", "analysis", "demonstrated", "that", "the", "functional", "replacement", "of", "ALDP", "by", "ALDRP", "was", "not", "due", "to", "stabilization", "of", "the", "mutated", "ALDP", "itself", ".", "Moreover", ",", "we", "were", "able", "to", "restore", "the", "peroxisomal", "beta", "-", "oxidation", "defect", "in", "the", "liver", "of", "ALDP", "-", "deficient", "mice", "by", "stimulation", "of", "ALDRP", "and", "PMP70", "gene", "expression", "through", "a", "dietary", "treatment", "with", "the", "peroxisome", "proliferator", "fenofibrate", ".", "These", "results", "suggest", "that", "a", "correction", "of", "the", "biochemical", "defect", "in", "X", "-", "ALD", "could", "be", "possible", "by", "drug", "-", "induced", "overexpression", "or", "ectopic", "expression", "of", "ALDRP", ".", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 3, 4, 4, 4, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
10198641	[ "Centrosome", "amplification", "and", "a", "defective", "G2", "-", "M", "cell", "cycle", "checkpoint", "induce", "genetic", "instability", "in", "BRCA1", "exon", "11", "isoform", "-", "deficient", "cells", ".", "Germline", "mutations", "of", "the", "Brca1", "tumor", "suppressor", "gene", "predispose", "women", "to", "breast", "and", "ovarian", "cancers", ".", "To", "study", "mechanisms", "underlying", "BRCA1", "-", "related", "tumorigenesis", ",", "we", "derived", "mouse", "embryonic", "fibroblast", "cells", "carrying", "a", "targeted", "deletion", "of", "exon", "11", "of", "the", "Brca1", "gene", ".", "We", "show", "that", "the", "mutant", "cells", "maintain", "an", "intact", "G1", "-", "S", "cell", "cycle", "checkpoint", "and", "proliferate", "poorly", ".", "However", ",", "a", "defective", "G2", "-", "M", "checkpoint", "in", "these", "cells", "is", "accompanied", "by", "extensive", "chromosomal", "abnormalities", ".", "Mutant", "fibroblasts", "contain", "multiple", ",", "functional", "centrosomes", ",", "which", "lead", "to", "unequal", "chromosome", "segregation", ",", "abnormal", "nuclear", "division", ",", "and", "aneuploidy", ".", "These", "data", "uncover", "an", "essential", "role", "of", "BRCA1", "in", "maintaining", "genetic", "stability", "through", "the", "regulation", "of", "centrosome", "duplication", "and", "the", "G2", "-", "M", "checkpoint", "and", "provide", "a", "molecular", "basis", "for", "the", "role", "of", "BRCA1", "in", "tumorigenesis", ".", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
10200300	[ "Defective", "CD95", "/", "APO", "-", "1", "/", "Fas", "signal", "complex", "formation", "in", "the", "human", "autoimmune", "lymphoproliferative", "syndrome", ",", "type", "Ia", ".", "Heterozygous", "mutations", "in", "the", "CD95", "(", "APO", "-", "1", "/", "Fas", ")", "receptor", "occur", "in", "most", "individuals", "with", "autoimmune", "lymphoproliferative", "syndrome", "(", "ALPS", ")", "and", "dominantly", "interfere", "with", "apoptosis", "by", "an", "unknown", "mechanism", ".", "We", "show", "that", "local", "or", "global", "alterations", "in", "the", "structure", "of", "the", "cytoplasmic", "death", "domain", "from", "nine", "independent", "ALPS", "CD95", "death", "-", "domain", "mutations", "result", "in", "a", "failure", "to", "bind", "the", "FADD", "/", "MORT1", "signaling", "protein", ".", "Despite", "heterozygosity", "for", "the", "abnormal", "allele", ",", "lymphocytes", "from", "ALPS", "patients", "showed", "markedly", "decreased", "FADD", "association", "and", "a", "loss", "of", "caspase", "recruitment", "and", "activation", "after", "CD95", "crosslinking", ".", "These", "data", "suggest", "that", "intracytoplasmic", "CD95", "mutations", "in", "ALPS", "impair", "apoptosis", "chiefly", "by", "disrupting", "death", "-", "domain", "interactions", "with", "the", "signaling", "protein", "FADD", "/", "MORT1", ".", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
10205262	[ "Analysis", "of", "alkaptonuria", "(", "AKU", ")", "mutations", "and", "polymorphisms", "reveals", "that", "the", "CCC", "sequence", "motif", "is", "a", "mutational", "hot", "spot", "in", "the", "homogentisate", "1", ",", "2", "dioxygenase", "gene", "(", "HGO", ")", ".", "We", "recently", "showed", "that", "alkaptonuria", "(", "AKU", ")", "is", "caused", "by", "loss", "-", "of", "-", "function", "mutations", "in", "the", "homogentisate", "1", ",", "2", "dioxygenase", "gene", "(", "HGO", ")", ".", "Herein", "we", "describe", "haplotype", "and", "mutational", "analyses", "of", "HGO", "in", "seven", "new", "AKU", "pedigrees", ".", "These", "analyses", "identified", "two", "novel", "single", "-", "nucleotide", "polymorphisms", "(", "INV4", "+", "31A", "-", "-", ">", "G", "and", "INV11", "+", "18A", "-", "-", ">", "G", ")", "and", "six", "novel", "AKU", "mutations", "(", "INV1", "-", "1G", "-", "-", ">", "A", ",", "W60G", ",", "Y62C", ",", "A122D", ",", "P230T", ",", "and", "D291E", ")", ",", "which", "further", "illustrates", "the", "remarkable", "allelic", "heterogeneity", "found", "in", "AKU", ".", "Reexamination", "of", "all", "29", "mutations", "and", "polymorphisms", "thus", "far", "described", "in", "HGO", "shows", "that", "these", "nucleotide", "changes", "are", "not", "randomly", "distributed", ";", "the", "CCC", "sequence", "motif", "and", "its", "inverted", "complement", ",", "GGG", ",", "are", "preferentially", "mutated", ".", "These", "analyses", "also", "demonstrated", "that", "the", "nucleotide", "substitutions", "in", "HGO", "do", "not", "involve", "CpG", "dinucleotides", ",", "which", "illustrates", "important", "differences", "between", "HGO", "and", "other", "genes", "for", "the", "occurrence", "of", "mutation", "at", "specific", "short", "-", "sequence", "motifs", ".", "Because", "the", "CCC", "sequence", "motifs", "comprise", "a", "significant", "proportion", "(", "34", ".", "5", "%", ")", "of", "all", "mutated", "bases", "that", "have", "been", "observed", "in", "HGO", ",", "we", "conclude", "that", "the", "CCC", "triplet", "is", "a", "mutational", "hot", "spot", "in", "HGO", "." ]	[ 0, 0, 7, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
10208848	[ "Fabry", "disease", ":", "identification", "of", "novel", "alpha", "-", "galactosidase", "A", "mutations", "and", "molecular", "carrier", "detection", "by", "use", "of", "fluorescent", "chemical", "cleavage", "of", "mismatches", ".", "Fabry", "disease", "(", "FD", ")", "(", "angiokeratoma", "corporis", "diffusum", ")", "is", "an", "X", "-", "linked", "inborn", "error", "of", "glycosphingolipid", "metabolism", "caused", "by", "defects", "in", "the", "lysosomal", "alpha", "-", "galactosidase", "A", "gene", "(", "GLA", ")", ".", "The", "enzymatic", "defect", "leads", "to", "the", "systemic", "accumulation", "of", "neutral", "glycosphingolipids", "with", "terminal", "alpha", "-", "galactosyl", "moieties", ".", "Clinically", ",", "affected", "hemizygous", "males", "have", "angiokeratoma", ",", "severe", "acroparesthesia", ",", "renal", "failure", ",", "and", "vasculopathy", "of", "the", "heart", "and", "brain", ".", "While", "demonstration", "of", "alpha", "-", "galactosidase", "deficiency", "in", "leukocytes", "is", "diagnostic", "in", "affected", "males", ",", "enzymatic", "detection", "of", "female", "carriers", "is", "often", "inconclusive", ",", "due", "to", "random", "X", "-", "chromosomal", "inactivation", ",", "underlining", "the", "need", "of", "molecular", "investigations", "for", "accurate", "genetic", "counseling", ".", "By", "use", "of", "chemical", "cleavage", "of", "mismatches", "adapted", "to", "fluorescence", "-", "based", "detection", "systems", ",", "we", "have", "characterized", "the", "mutations", "underlying", "alpha", "-", "Gal", "A", "deficiency", "in", "16", "individuals", "from", "six", "unrelated", "families", "with", "FD", ".", "The", "mutational", "spectrum", "included", "five", "missense", "mutations", "(", "C202W", ",", "C223G", ",", "N224D", ",", "R301Q", ",", "and", "Q327K", ")", "and", "one", "splice", "-", "site", "mutation", "[", "IVS3", "G", "(", "-", "1", ")", "-", "-", ">", "C", "]", ".", "Studies", "at", "the", "mRNA", "level", "showed", "that", "the", "latter", "led", "to", "altered", "pre", "-", "mRNA", "splicing", "with", "consequent", "alteration", "of", "the", "mRNA", "translational", "reading", "frame", "and", "generation", "of", "a", "premature", "termination", "codon", "of", "translation", ".", "By", "use", "of", "this", "strategy", ",", "carrier", "status", "was", "accurately", "assessed", "in", "all", "seven", "at", "-", "risk", "females", "tested", ",", "whereas", "enzymatic", "dosages", "failed", "to", "diagnose", "or", "exclude", "heterozygosity", ".", "." ]	[ 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 3, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 3, 4, 0, 3, 4, 0, 0, 5, 6, 6, 6, 6, 6, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
10210128	[ "Prenatal", "diagnosis", "by", "FISH", "in", "a", "family", "with", "Pelizaeus", "-", "Merzbacher", "disease", "caused", "by", "duplication", "of", "PLP", "gene", ".", "A", "diagnosis", "of", "Pelizaeus", "-", "Merzbacher", "disease", "(", "MIM", "312080", ")", "was", "made", "in", "a", "young", "boy", ".", "No", "mutation", "in", "the", "coding", "region", "of", "the", "proteolipid", "protein", "(", "PLP", ")", "gene", "had", "been", "found", ".", "The", "boys", "maternal", "aunt", "came", "for", "prenatal", "diagnosis", "when", "16", "+", "weeks", "pregnant", "and", "carrying", "a", "male", "fetus", ".", "Samples", "were", "tested", "for", "duplication", "of", "the", "PLP", "gene", ",", "by", "interphase", "FISH", ",", "in", "lymphocyte", "preparations", "from", "the", "proband", ",", "his", "aunt", "and", "an", "amniotic", "fluid", "cell", "preparation", "from", "the", "fetus", ".", "The", "proband", "was", "found", "to", "carry", "the", "duplication", ",", "thus", "confirming", "the", "diagnosis", "of", "Pelizaeus", "Merzbacher", "disease", ",", "but", "neither", "the", "aunt", "nor", "the", "fetus", "carried", "a", "duplication", ".", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
10213492	[ "Dominant", "negative", "effect", "of", "the", "APC1309", "mutation", ":", "a", "possible", "explanation", "for", "genotype", "-", "phenotype", "correlations", "in", "familial", "adenomatous", "polyposis", ".", "Inactivation", "of", "the", "adenomatous", "polyposis", "coli", "(", "APC", ")", "gene", "product", "initiates", "colorectal", "tumorigenesis", ".", "Patients", "with", "familial", "APC", "(", "FAP", ")", "carry", "germ", "-", "line", "mutations", "in", "the", "APC", "gene", "and", "develop", "multiple", "colorectal", "adenomas", "and", "subsequent", "carcinomas", "early", "in", "life", ".", "The", "severity", "of", "the", "disease", "correlates", "with", "the", "position", "of", "the", "inherited", "APC", "mutation", "(", "genotype", "-", "phenotype", "correlation", ")", ".", "Together", "with", "the", "fact", "that", "both", "germ", "-", "line", "and", "sporadic", "APC", "mutations", "cluster", "in", "the", "central", "region", "of", "the", "APC", "gene", ",", "this", "points", "to", "a", "dominant", "negative", "effect", "of", "certain", "APC", "mutants", ".", "Loss", "of", "APC", "function", "was", "recently", "shown", "to", "result", "in", "enhanced", "beta", "-", "catenin", "-", "/", "Tcf", "-", "mediated", "transcription", "in", "colon", "epithelial", "cells", ".", "Here", ",", "we", "provide", "experimental", "evidence", "for", "a", "dominant", "negative", "effect", "of", "APC", "gene", "products", "associated", "with", "severe", "polyposis", ".", "Wild", "-", "type", "APC", "activity", "in", "beta", "-", "catenin", "-", "/", "Tcf", "-", "mediated", "transcription", "was", "strongly", "inhibited", "by", "a", "mutant", "APC", "that", "is", "truncated", "at", "codon", "1309", ".", "In", "contrast", ",", "mutant", "APC", "gene", "products", "that", "are", "associated", "with", "attenuated", "polyposis", "(", "codon", "386", "or", "1465", ")", "interfered", "only", "weakly", "with", "wild", "-", "type", "APC", "activity", ".", "These", "results", "suggest", "a", "molecular", "explanation", "for", "the", "genotype", "-", "phenotype", "correlation", "in", "FAP", "patients", "and", "support", "the", "idea", "that", "colorectal", "tumor", "growth", "might", "be", ",", "in", "part", ",", "driven", "by", "selection", "for", "a", "mutation", "in", "the", "mutation", "cluster", "region", ".", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 8, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
10220405	[ "BRCA1", "interacts", "with", "components", "of", "the", "histone", "deacetylase", "complex", ".", "Germ", "-", "line", "mutations", "in", "the", "BRCA1", "tumor", "-", "suppressor", "gene", "are", "associated", "with", "an", "increased", "susceptibility", "to", "breast", "and", "ovarian", "cancer", ".", "BRCA1", "contains", "a", "carboxyl", "-", "terminal", "domain", "(", "BRCT", ")", "that", "is", "shared", "with", "several", "other", "proteins", "involved", "in", "maintaining", "genome", "integrity", ".", "In", "an", "effort", "to", "understand", "the", "function", "of", "BRCA1", ",", "we", "sought", "to", "isolate", "proteins", "that", "interact", "with", "the", "BRCT", "domain", ".", "Purified", "BRCT", "polypeptide", "was", "used", "as", "a", "probe", "to", "screen", "a", "human", "placenta", "cDNA", "expression", "library", "by", "Far", "Western", "analysis", ".", "Here", "we", "report", "that", "BRCA1", "interacts", "in", "vivo", "and", "in", "vitro", "with", "the", "Rb", "-", "binding", "proteins", ",", "RbAp46", "and", "RbAp48", ",", "as", "well", "as", "with", "Rb", ".", "Moreover", ",", "the", "BRCT", "domain", "associates", "with", "the", "histone", "deacetylases", "HDAC1", "and", "HDAC2", ".", "These", "results", "demonstrate", "that", "BRCA1", "interacts", "with", "components", "of", "the", "histone", "deacetylase", "complex", ",", "and", "therefore", "may", "explain", "the", "involvement", "of", "BRCA1", "in", "multiple", "processes", "such", "as", "transcription", ",", "DNA", "repair", ",", "and", "recombination", ".", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
102474	[ "Combined", "genetic", "deficiency", "of", "C6", "and", "C7", "in", "man", ".", "By", "routine", "screening", "of", "sera", ",", "a", "subject", "was", "discovered", "who", "showed", "a", "sub", "-", "total", "deficiency", "of", "C6", "and", "C7", ".", "No", "clinical", "disease", "was", "associated", "with", "this", "deficiency", "which", "was", "transmitted", "through", "the", "subjects", "family", "as", "a", "single", "genetic", "characteristic", ",", "the", "C6", "deficiency", "being", "associated", "with", "a", "silent", "allele", "at", "the", "structural", "locus", ".", "The", "propositus", "was", "found", "to", "have", "low", "quantities", "of", "an", "abnormal", "C6", "which", "was", "both", "antigenically", "deficient", "and", "smaller", "in", "size", "than", "normal", "C6", "(", "110", ",", "000", "daltons", "compared", "with", "140", ",", "000", "daltons", ")", "and", "small", "quantities", "of", "apparently", "normal", "C7", ".", "It", "is", "concluded", "that", "the", "most", "likely", "explanation", "for", "this", "defect", "is", "that", "the", "subject", "has", "a", "structural", "mutation", "in", "his", "C6", "gene", "which", "produces", "hyopsynthesis", "not", "only", "of", "C6", "but", "also", "of", "the", "closely", "linked", "gene", "for", "C7", ".", "These", "findings", "suggest", "the", "possibility", "that", "C6", "and", "C7", "may", "function", "as", "a", "single", "genetic", "unit", "and", "that", "the", "primary", "transcript", "copied", "from", "the", "genome", "includes", "information", "for", "both", "proteins", ".", "." ]	[ 5, 6, 6, 6, 6, 6, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 6, 6, 6, 6, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
10323252	[ "Changes", "at", "P183", "of", "emerin", "weaken", "its", "protein", "-", "protein", "interactions", "resulting", "in", "X", "-", "linked", "Emery", "-", "Dreifuss", "muscular", "dystrophy", ".", "Emery", "-", "Dreifuss", "muscular", "dystrophy", "(", "EDMD", ")", "is", "an", "X", "-", "linked", "recessive", "muscular", "dystrophy", "characterized", "by", "early", "contractures", "of", "the", "elbows", ",", "Achilles", "tendons", "and", "spine", ",", "slowly", "progressive", "muscle", "wasting", "and", "weakness", ",", "and", "cardiomyopathy", "associated", "with", "cardiac", "conduction", "defects", ".", "The", "emerin", "gene", "has", "been", "mapped", "to", "Xq28", "and", "encodes", "a", "34", "-", "kDa", "serine", "-", "rich", "protein", ",", "emerin", ",", "which", "has", "been", "localized", "to", "the", "nuclear", "envelope", "in", "a", "wide", "variety", "of", "tissues", ",", "including", "skeletal", "and", "cardiac", "muscle", ".", "Mutations", "spanning", "the", "emerin", "gene", "have", "been", "identified", "in", "patients", "with", "EDMD", ".", "We", "present", "here", "the", "effect", ",", "on", "emerin", "protein", "expression", ",", "of", "two", "missense", "mutations", "identified", "in", "unrelated", "EDMD", "patients", ".", "These", "alterations", "predict", "the", "replacement", "of", "a", "proline", "residue", "at", "position", "183", "with", "either", "a", "histidine", "or", "a", "threonine", ".", "Biochemical", "analysis", "has", "demonstrated", "that", "the", "mobility", "and", "expression", "levels", "of", "the", "mutant", "forms", "of", "emerin", "are", "indistinguishable", "from", "that", "of", "wild", "-", "type", "emerin", ",", "but", "that", "they", "have", "weakened", "interactions", "with", "nuclear", "lamina", "components", ".", "In", "comparison", "with", "the", "usual", "EDMD", "phenotype", ",", "patients", "with", "P183", "missense", "mutations", "have", "a", "later", "age", "at", "onset", "of", "first", "symptoms", ",", "elbow", "contractures", ",", "ankle", "contractures", ",", "upper", "limb", "weakness", "and", "lower", "limb", "weakness", ",", "but", "there", "is", "no", "difference", "for", "the", "age", "at", "onset", "of", "cardiac", "involvement", ".", "This", "is", "the", "first", "report", "of", "protein", "studies", "on", "patients", "with", "missense", "mutations", "resulting", "in", "the", "clinical", "features", "of", "EDMD", ".", "These", "studies", "demonstrate", "the", "importance", "of", "proline", "183", "for", "the", "proper", "structure", "/", "function", "of", "emerin", ".", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 4, 4, 4, 4, 0, 3, 4, 4, 4, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 6, 6, 6, 6, 6, 6, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 1, 0, 0, 3, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 3, 4, 0, 3, 4, 4, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
10323740	[ "Microdeletions", "at", "chromosome", "bands", "1q32", "-", "q41", "as", "a", "cause", "of", "Van", "der", "Woude", "syndrome", ".", "Van", "der", "Woude", "syndrome", "(", "VWS", ")", "is", "an", "autosomal", "dominant", "disorder", "comprising", "cleft", "lip", "and", "/", "or", "cleft", "palate", "and", "lip", "pits", ".", "We", "reported", "previously", "a", "family", "whose", "underlying", "mutation", "is", "a", "500", "-", "800", "kb", "deletion", "localized", "to", "chromosome", "bands", "1q32", "-", "q41", "[", "Sander", "et", "al", ".", ",", "1994", "Hum", "Mol", "Genet", "3", "576", "-", "578", "]", ".", "Along", "with", "cleft", "lip", "/", "palate", "and", "lip", "pits", ",", "affected", "relatives", "exhibit", "developmental", "delays", ",", "suggesting", "that", "the", "function", "of", "a", "gene", "nearby", "may", "also", "be", "disrupted", ".", "To", "further", "localize", "the", "VWS", "gene", "we", "searched", "for", "other", "deletions", "that", "cause", "VWS", ".", "An", "allele", "loss", "assay", "was", "performed", "using", "a", "novel", "highly", "polymorphic", "marker", ",", "D1S3753", ".", "From", "a", "panel", "of", "37", "unrelated", "individuals", ",", "we", "detected", "an", "allele", "loss", "in", "one", "family", ",", "indicating", "the", "presence", "of", "a", "deletion", ".", "In", "this", "family", ",", "the", "phenotype", "in", "three", "generations", "of", "affected", "individuals", "was", "confined", "to", "the", "cardinal", "signs", "of", "VWS", ".", "Surprisingly", ",", "mapping", "of", "the", "new", "deletion", "showed", "that", "it", "extended", "0", ".", "2", "-", "1", "Mb", "beyond", "the", "proximal", "breakpoint", "for", "the", "deletion", "described", "previously", ".", "No", "deletions", "were", "detected", "in", "seven", "cases", "of", "popliteal", "pterygia", "syndrome", ",", "76", "cases", "of", "mixed", "syndromic", "forms", "of", "cleft", "lip", "and", "palate", ",", "and", "178", "cases", "of", "nonsyndromic", "cleft", "lip", "and", "palate", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 0, 3, 4, 4, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 6, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 6, 6, 6, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 6, 6, 0 ]
10330348	[ "Splicing", "defects", "in", "the", "ataxia", "-", "telangiectasia", "gene", ",", "ATM", ":", "underlying", "mutations", "and", "consequences", ".", "Mutations", "resulting", "in", "defective", "splicing", "constitute", "a", "significant", "proportion", "(", "30", "/", "62", "[", "48", "%", "]", ")", "of", "a", "new", "series", "of", "mutations", "in", "the", "ATM", "gene", "in", "patients", "with", "ataxia", "-", "telangiectasia", "(", "AT", ")", "that", "were", "detected", "by", "the", "protein", "-", "truncation", "assay", "followed", "by", "sequence", "analysis", "of", "genomic", "DNA", ".", "Fewer", "than", "half", "of", "the", "splicing", "mutations", "involved", "the", "canonical", "AG", "splice", "-", "acceptor", "site", "or", "GT", "splice", "-", "donor", "site", ".", "A", "higher", "percentage", "of", "mutations", "occurred", "at", "less", "stringently", "conserved", "sites", ",", "including", "silent", "mutations", "of", "the", "last", "nucleotide", "of", "exons", ",", "mutations", "in", "nucleotides", "other", "than", "the", "conserved", "AG", "and", "GT", "in", "the", "consensus", "splice", "sites", ",", "and", "creation", "of", "splice", "-", "acceptor", "or", "splice", "-", "donor", "sites", "in", "either", "introns", "or", "exons", ".", "These", "splicing", "mutations", "led", "to", "a", "variety", "of", "consequences", ",", "including", "exon", "skipping", "and", ",", "to", "a", "lesser", "degree", ",", "intron", "retention", ",", "activation", "of", "cryptic", "splice", "sites", ",", "or", "creation", "of", "new", "splice", "sites", ".", "In", "addition", ",", "5", "of", "12", "nonsense", "mutations", "and", "1", "missense", "mutation", "were", "associated", "with", "deletion", "in", "the", "cDNA", "of", "the", "exons", "in", "which", "the", "mutations", "occurred", ".", "No", "ATM", "protein", "was", "detected", "by", "western", "blotting", "in", "any", "AT", "cell", "line", "in", "which", "splicing", "mutations", "were", "identified", ".", "Several", "cases", "of", "exon", "skipping", "in", "both", "normal", "controls", "and", "patients", "for", "whom", "no", "underlying", "defect", "could", "be", "found", "in", "genomic", "DNA", "were", "also", "observed", ",", "suggesting", "caution", "in", "the", "interpretation", "of", "exon", "deletions", "observed", "in", "ATM", "cDNA", "when", "there", "is", "no", "accompanying", "identification", "of", "genomic", "mutations", ".", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 7, 8, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
10330430	[ "Alpha", "-", "cardiac", "actin", "is", "a", "novel", "disease", "gene", "in", "familial", "hypertrophic", "cardiomyopathy", ".", "We", "identified", "the", "alpha", "-", "cardiac", "actin", "gene", "(", "ACTC", ")", "as", "a", "novel", "disease", "gene", "in", "a", "pedigree", "suffering", "from", "familial", "hypertrophic", "cardiomyopathy", "(", "FHC", ")", ".", "Linkage", "analyses", "excluded", "all", "the", "previously", "reported", "FHC", "loci", "as", "possible", "disease", "loci", "in", "the", "family", "studied", ",", "with", "lod", "scores", "varying", "between", "-", "2", ".", "5", "and", "-", "6", ".", "0", "0", ".", "Further", "linkage", "analyses", "of", "plausible", "candidate", "genes", "highly", "expressed", "in", "the", "adult", "human", "heart", "identified", "ACTC", "as", "the", "most", "likely", "disease", "gene", ",", "showing", "a", "maximal", "lod", "score", "of", "3", ".", "6", "6", ".", "Mutation", "analysis", "of", "ACTC", "revealed", "an", "Ala295Ser", "mutation", "in", "exon", "5", "close", "to", "2", "missense", "mutations", "recently", "described", "to", "cause", "the", "inherited", "form", "of", "idiopathic", "dilated", "cardiomyopathy", "(", "IDC", ")", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 3, 0, 0 ]
10353787	[ "Overgrowth", "of", "oral", "mucosa", "and", "facial", "skin", ",", "a", "novel", "feature", "of", "aspartylglucosaminuria", ".", "Aspartylglucosaminuria", "(", "AGU", ")", "is", "a", "lysosomal", "storage", "disorder", "caused", "by", "deficiency", "of", "aspartylglucosaminidase", "(", "AGA", ")", ".", "The", "main", "symptom", "is", "progressive", "mental", "retardation", ".", "A", "spectrum", "of", "different", "mutations", "has", "been", "reported", "in", "this", "disease", ",", "one", "missense", "mutation", "(", "Cys163Ser", ")", "being", "responsible", "for", "the", "majority", "of", "Finnish", "cases", ".", "We", "were", "able", "to", "examine", "66", "Finnish", "AGU", "patients", "for", "changes", "in", "the", "oral", "mucosa", "and", "44", "of", "these", "for", "changes", "in", "facial", "skin", ".", "Biopsy", "specimens", "of", "16", "oral", "lesions", ",", "12", "of", "them", "associated", "with", "the", "teeth", ",", "plus", "two", "facial", "lesions", "were", "studied", "histologically", ".", "Immunohistochemical", "staining", "for", "AGA", "was", "performed", "on", "15", "oral", "specimens", ".", "Skin", "was", "seborrhoeic", "in", "adolescent", "and", "adult", "patients", ",", "with", "erythema", "of", "the", "facial", "skin", "already", "common", "in", "childhood", ".", "Of", "44", "patients", ",", "nine", "(", "20", "%", ")", "had", "facial", "angiofibromas", ",", "tumours", "primarily", "occurring", "in", "association", "with", "tuberous", "sclerosis", ".", "Oedemic", "buccal", "mucosa", "(", "leucoedema", ")", "and", "gingival", "overgrowths", "were", "more", "frequent", "in", "AGU", "patients", "than", "in", "controls", "(", "p", "<", "0", ".", "001", ")", ".", "Of", "16", "oral", "mucosal", "lesions", "studied", "histologically", ",", "15", "represented", "fibroepithelial", "or", "epithelial", "hyperplasias", "and", "were", "reactive", "in", "nature", ".", "Cytoplasmic", "vacuolisation", "was", "evident", "in", "four", ".", "Immunohistochemically", ",", "expression", "of", "AGA", "in", "AGU", "patients", "mucosal", "lesions", "did", "not", "differ", "from", "that", "seen", "in", "corresponding", "lesions", "of", "normal", "subjects", ".", "Thus", ",", "the", "high", "frequency", "of", "mucosal", "overgrowth", "in", "AGU", "patients", "does", "not", "appear", "to", "be", "directly", "associated", "with", "lysosomal", "storage", "or", "with", "alterations", "in", "the", "level", "of", "AGA", "expression", "." ]	[ 5, 6, 6, 6, 6, 6, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 3, 0, 3, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 3, 4, 4, 0, 3, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
10364518	[ "Characterization", "of", "a", "germline", "mosaicism", "in", "families", "with", "Lowe", "syndrome", ",", "and", "identification", "of", "seven", "novel", "mutations", "in", "the", "OCRL1", "gene", ".", "The", "oculocerebrorenal", "syndrome", "of", "Lowe", "(", "OCRL", ")", "is", "an", "X", "-", "linked", "disorder", "characterized", "by", "major", "abnormalities", "of", "eyes", ",", "nervous", "system", ",", "and", "kidneys", ".", "Mutations", "in", "the", "OCRL1", "gene", "have", "been", "associated", "with", "the", "disease", ".", "OCRL1", "encodes", "a", "phosphatidylinositol", "4", ",", "5", "-", "biphosphate", "(", "PtdIns", "[", "4", ",", "5", "]", "P2", ")", "5", "-", "phosphatase", ".", "We", "have", "examined", "the", "OCRL1", "gene", "in", "eight", "unrelated", "patients", "with", "OCRL", "and", "have", "found", "seven", "new", "mutations", "and", "one", "recurrent", "in", "-", "frame", "deletion", ".", "Among", "the", "new", "mutations", ",", "two", "nonsense", "mutations", "(", "R317X", "and", "E558X", ")", "and", "three", "other", "frameshift", "mutations", "caused", "premature", "termination", "of", "the", "protein", ".", "A", "missense", "mutation", ",", "R483G", ",", "was", "located", "in", "the", "highly", "conserved", "PtdIns", "(", "4", ",", "5", ")", "P2", "5", "-", "phosphatase", "domain", ".", "Finally", ",", "one", "frameshift", "mutation", ",", "2799delC", ",", "modifies", "the", "C", "-", "terminal", "part", "of", "OCRL1", ",", "with", "an", "extension", "of", "six", "amino", "acids", ".", "Altogether", ",", "70", "%", "of", "missense", "mutations", "are", "located", "in", "exon", "15", ",", "and", "52", "%", "of", "all", "mutations", "cluster", "in", "exons", "11", "-", "15", ".", "We", "also", "identified", "two", "new", "microsatellite", "markers", "for", "the", "OCRL1", "locus", ",", "and", "we", "detected", "a", "germline", "mosaicism", "in", "one", "family", ".", "This", "observation", "has", "direct", "implications", "for", "genetic", "counseling", "of", "Lowe", "syndrome", "families", ".", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 6, 6, 6, 6, 6, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 0, 0, 0 ]
10364520	[ "MEFV", "-", "Gene", "analysis", "in", "armenian", "patients", "with", "Familial", "Mediterranean", "fever", ":", "diagnostic", "value", "and", "unfavorable", "renal", "prognosis", "of", "the", "M694V", "homozygous", "genotype", "-", "genetic", "and", "therapeutic", "implications", ".", "Familial", "Mediterranean", "fever", "(", "FMF", ")", "is", "a", "recessively", "inherited", "disorder", "that", "is", "common", "in", "patients", "of", "Armenian", "ancestry", ".", "To", "date", ",", "its", "diagnosis", ",", "which", "can", "be", "made", "only", "retrospectively", ",", "is", "one", "of", "exclusion", ",", "based", "entirely", "on", "nonspecific", "clinical", "signs", "that", "result", "from", "serosal", "inflammation", "and", "that", "may", "lead", "to", "unnecessary", "surgery", ".", "Renal", "amyloidosis", ",", "prevented", "by", "colchicine", ",", "is", "the", "most", "severe", "complication", "of", "FMF", ",", "a", "disorder", "associated", "with", "mutations", "in", "the", "MEFV", "gene", ".", "To", "evaluate", "the", "diagnostic", "and", "prognostic", "value", "of", "MEFV", "-", "gene", "analysis", ",", "we", "investigated", "90", "Armenian", "FMF", "patients", "from", "77", "unrelated", "families", "that", "were", "not", "selected", "through", "genetic", "-", "linkage", "analysis", ".", "Eight", "mutations", ",", "one", "of", "which", "(", "R408Q", ")", "is", "new", ",", "were", "found", "to", "account", "for", "93", "%", "of", "the", "163", "independent", "FMF", "alleles", ",", "with", "both", "FMF", "alleles", "identified", "in", "89", "%", "of", "the", "patients", ".", "In", "several", "instances", ",", "family", "studies", "provided", "molecular", "evidence", "for", "pseudodominant", "transmission", "and", "incomplete", "penetrance", "of", "the", "disease", "phenotype", ".", "The", "M694V", "homozygous", "genotype", "was", "found", "to", "be", "associated", "with", "a", "higher", "prevalence", "of", "renal", "amyloidosis", "and", "arthritis", ",", "compared", "with", "other", "genotypes", "(", "P", "=", ".", "0002", "and", "P", "=", ".", "006", ",", "respectively", ")", ".", "The", "demonstration", "of", "both", "the", "diagnostic", "and", "prognostic", "value", "of", "MEFV", "analysis", "and", "particular", "modes", "of", "inheritance", "should", "lead", "to", "new", "ways", "for", "management", "of", "FMF", "-", "including", "genetic", "counseling", "and", "therapeutic", "decisions", "in", "affected", "families", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
10364521	[ "Noninvasive", "test", "for", "fragile", "X", "syndrome", ",", "using", "hair", "root", "analysis", ".", "Identification", "of", "the", "FMR1", "gene", "and", "the", "repeat", "-", "amplification", "mechanism", "causing", "fragile", "X", "syndrome", "led", "to", "development", "of", "reliable", "DNA", "-", "based", "diagnostic", "methods", ",", "including", "Southern", "blot", "hybridization", "and", "PCR", ".", "Both", "methods", "are", "performed", "on", "DNA", "isolated", "from", "peripheral", "blood", "cells", "and", "measure", "the", "repeat", "size", "in", "FMR1", ".", "Using", "an", "immunocytochemical", "technique", "on", "blood", "smears", ",", "we", "recently", "developed", "a", "novel", "test", "for", "identification", "of", "patients", "with", "fragile", "X", "syndrome", ".", "This", "method", ",", "also", "called", "\"", "antibody", "test", ",", "\"", "uses", "monoclonal", "antibodies", "against", "the", "FMR1", "gene", "product", "(", "FMRP", ")", "and", "is", "based", "on", "absence", "of", "FMRP", "in", "patients", "cells", ".", "Here", "we", "describe", "a", "new", "diagnostic", "test", "to", "identify", "male", "patients", "with", "fragile", "X", "syndrome", ",", "on", "the", "basis", "of", "lack", "of", "FMRP", "in", "their", "hair", "roots", ".", "Expression", "of", "FMRP", "in", "hair", "roots", "was", "studied", "by", "use", "of", "an", "FMRP", "-", "specific", "antibody", "test", ",", "and", "the", "percentage", "of", "FMRP", "-", "expressing", "hair", "roots", "in", "controls", "and", "in", "male", "fragile", "X", "patients", "was", "determined", ".", "Control", "individuals", "showed", "clear", "expression", "of", "FMRP", "in", "nearly", "every", "hair", "root", ",", "whereas", "male", "fragile", "X", "patients", "lacked", "expression", "of", "FMRP", "in", "almost", "all", "their", "hair", "roots", ".", "Mentally", "retarded", "female", "patients", "with", "a", "full", "mutation", "showed", "FMRP", "expression", "in", "only", "some", "of", "their", "hair", "roots", "(", "<", "55", "%", ")", ",", "and", "no", "overlap", "with", "normal", "female", "controls", "was", "observed", ".", "The", "advantages", "of", "this", "test", "are", "(", "1", ")", "plucking", "of", "hair", "follicles", "does", "no", "appreciable", "harm", "to", "the", "mentally", "retarded", "patient", ",", "(", "2", ")", "hairs", "can", "be", "sent", "in", "a", "simple", "envelope", "to", "a", "diagnostic", "center", ",", "and", "(", "3", ")", "the", "result", "of", "the", "test", "is", "available", "within", "5", "h", "of", "plucking", ".", "In", "addition", ",", "this", "test", "enabled", "us", "to", "identify", "two", "fragile", "X", "patients", "who", "did", "not", "show", "the", "full", "mutation", "by", "analysis", "of", "DNA", "isolated", "from", "blood", "cells", ".", "." ]	[ 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
10364525	[ "In", "Swedish", "families", "with", "hereditary", "prostate", "cancer", ",", "linkage", "to", "the", "HPC1", "locus", "on", "chromosome", "1q24", "-", "25", "is", "restricted", "to", "families", "with", "early", "-", "onset", "prostate", "cancer", ".", "Prostate", "cancer", "clusters", "in", "some", "families", ",", "and", "an", "estimated", "5", "%", "-", "10", "%", "of", "all", "cases", "are", "estimated", "to", "result", "from", "inheritance", "of", "prostate", "cancer", "-", "susceptibility", "genes", ".", "We", "previously", "reported", "evidence", "of", "linkage", "to", "the", "1q24", "-", "25", "region", "(", "HPC1", ")", "in", "91", "North", "American", "and", "Swedish", "families", "each", "with", "multiple", "cases", "of", "prostate", "cancer", "(", "Smith", "et", "al", ".", "1996", ")", ".", "In", "the", "present", "report", "we", "analyze", "40", "(", "12", "original", "and", "28", "newly", "identified", ")", "Swedish", "families", "with", "hereditary", "prostate", "cancer", "(", "HPC", ")", "that", ",", "on", "the", "basis", "of", "40", "markers", "spanning", "a", "25", "-", "cM", "interval", "within", "1q24", "-", "25", ",", "have", "evidence", "of", "linkage", ".", "In", "the", "complete", "set", "of", "families", ",", "a", "maximum", "two", "-", "point", "LOD", "score", "of", "1", ".", "10", "was", "observed", "at", "D1S413", "(", "at", "a", "recombination", "fraction", "[", "theta", "]", "of", ".", "1", ")", ",", "with", "a", "maximum", "NPL", "(", "nonparametric", "linkage", ")", "Z", "score", "of", "1", ".", "64", "at", "D1S202", "(", "P", "=", ".", "05", ")", ".", "The", "evidence", "of", "linkage", "to", "this", "region", "originated", "almost", "exclusively", "from", "the", "subset", "of", "12", "early", "-", "onset", "(", "age", "<", "65", "years", ")", "families", ",", "which", "yielded", "a", "maximum", "LOD", "score", "of", "2", ".", "38", "at", "D1S413", "(", "straight", "theta", "=", "0", ")", "and", "an", "NPL", "Z", "score", "of", "1", ".", "95", "at", "D1S422", "(", "P", "=", ".", "03", ")", ".", "Estimates", "from", "heterogeneity", "tests", "suggest", "that", ",", "within", "Sweden", ",", "as", "many", "as", "50", "%", "of", "early", "-", "onset", "families", "had", "evidence", "of", "linkage", "to", "the", "HPC1", "region", ".", "These", "results", "are", "consistent", "with", "the", "hypothesis", "of", "linkage", "to", "HPC1", "in", "a", "subset", "of", "families", "with", "prostate", "cancer", ",", "particularly", "those", "with", "an", "early", "age", "at", "diagnosis", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
10366443	[ "Molecular", "basis", "of", "feline", "beta", "-", "glucuronidase", "deficiency", ":", "an", "animal", "model", "of", "mucopolysaccharidosis", "VII", ".", "A", "family", "of", "domestic", "cats", "was", "found", "that", "exhibited", "clinical", "and", "biochemical", "abnormalities", "consistent", "with", "mucopolysaccharidosis", "VII", ",", "an", "autosomal", "recessive", "lysosomal", "storage", "disorder", "caused", "by", "beta", "-", "glucuronidase", "deficiency", ".", "beta", "-", "Glucuronidase", "activity", "was", "undetectable", "in", "affected", "cat", "fibroblasts", "and", "restored", "by", "retroviral", "gene", "transfer", "of", "rat", "beta", "-", "glucuronidase", "cDNA", ".", "beta", "-", "Glucuronidase", "mRNA", "was", "normal", "in", "affected", "cat", "testis", "by", "Northern", "blot", "analysis", ".", "Normal", "feline", "beta", "-", "glucuronidase", "cDNA", "was", "cloned", "and", "characterized", ",", "and", "amplified", "from", "affected", "cat", "fibroblasts", "by", "reverse", "transcription", "coupled", "polymerase", "chain", "reaction", ".", "There", "was", "a", "G", "-", "to", "-", "A", "transition", "in", "the", "affected", "cat", "cDNA", "that", "predicted", "an", "E351K", "substitution", ",", "destroyed", "a", "BssSI", "site", ",", "and", "eliminated", "GUSB", "enzymatic", "activity", "in", "expression", "studies", ".", "Multiple", "species", "comparison", "and", "the", "crystal", "structure", "of", "human", "beta", "-", "glucuronidase", "indicated", "that", "E351", "is", "a", "highly", "conserved", "residue", "most", "likely", "essential", "in", "maintenance", "of", "the", "enzymes", "conformation", ".", "BssSI", "digestion", "of", "polymerase", "chain", "reaction", "products", "amplified", "from", "genomic", "DNA", "indicated", "that", "affected", "cats", "were", "homozygous", "and", "cats", "with", "half", "-", "normal", "beta", "-", "glucuronidase", "activity", "were", "heterozygous", "for", "the", "missense", "mutation", ".", "Carriers", "identified", "in", "this", "manner", "produced", "affected", "kittens", "in", "prospective", "breedings", ",", "and", "a", "feline", "MPS", "VII", "breeding", "colony", "has", "been", "established", ".", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 2, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
10369860	[ "A", "common", "molecular", "basis", "for", "rearrangement", "disorders", "on", "chromosome", "22q11", ".", "The", "chromosome", "22q11", "region", "is", "susceptible", "to", "rearrangements", "that", "are", "associated", "with", "congenital", "anomaly", "disorders", "and", "malignant", "tumors", ".", "Three", "congenital", "anomaly", "disorders", ",", "cat", "-", "eye", "syndrome", ",", "der", "(", ")", "syndrome", "and", "velo", "-", "cardio", "-", "facial", "syndrome", "/", "DiGeorge", "syndrome", "(", "VCFS", "/", "DGS", ")", "are", "associated", "with", "tetrasomy", ",", "trisomy", "or", "monosomy", ",", "respectively", ",", "for", "part", "of", "chromosome", "22q11", ".", "VCFS", "/", "DGS", "is", "the", "most", "common", "syndrome", "associated", "with", "22q11", "rearrangements", ".", "In", "order", "to", "determine", "whether", "there", "are", "particular", "regions", "on", "22q11", "that", "are", "prone", "to", "rearrangements", ",", "the", "deletion", "end", "-", "points", "in", "a", "large", "number", "of", "VCFS", "/", "DGS", "patients", "were", "defined", "by", "haplotype", "analysis", ".", "Most", "VCFS", "/", "DGS", "patients", "have", "a", "similar", "3", "Mb", "deletion", ",", "some", "have", "a", "nested", "distal", "deletion", "breakpoint", "resulting", "in", "a", "1", ".", "5", "Mb", "deletion", "and", "a", "few", "rare", "patients", "have", "unique", "deletions", "or", "translocations", ".", "The", "high", "prevalence", "of", "the", "disorder", "in", "the", "population", "and", "the", "fact", "that", "most", "cases", "occur", "sporadically", "suggest", "that", "sequences", "at", "or", "near", "the", "breakpoints", "confer", "susceptibility", "to", "chromosome", "rearrangements", ".", "To", "investigate", "this", "hypothesis", ",", "we", "developed", "hamster", "-", "human", "somatic", "hybrid", "cell", "lines", "from", "VCFS", "/", "DGS", "patients", "with", "all", "three", "classes", "of", "deletions", "and", "we", "now", "show", "that", "the", "breakpoints", "occur", "within", "similar", "low", "copy", "repeats", ",", "termed", "LCR22s", ".", "To", "support", "this", "idea", "further", ",", "we", "identified", "a", "family", "that", "carries", "an", "interstitial", "duplication", "of", "the", "same", "3", "Mb", "region", "that", "is", "deleted", "in", "VCFS", "/", "DGS", "patients", ".", "We", "present", "models", "to", "explain", "how", "the", "LCR22s", "can", "mediate", "different", "homologous", "recombination", "events", ",", "thereby", "generating", "a", "number", "of", "rearrangements", "that", "are", "associated", "with", "congenital", "anomaly", "disorders", ".", "We", "identified", "five", "additional", "copies", "of", "the", "LCR22", "on", "22q11", "that", "may", "mediate", "other", "rearrangements", "leading", "to", "disease", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 1, 2, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 3, 4, 4, 4, 0, 3, 4, 4, 4, 0, 3, 4, 4, 4, 4, 4, 0, 3, 4, 0, 3, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
10369870	[ "Functional", "consequences", "of", "mutations", "in", "the", "early", "growth", "response", "2", "gene", "(", "EGR2", ")", "correlate", "with", "severity", "of", "human", "myelinopathies", ".", "The", "early", "growth", "response", "2", "gene", "(", "EGR2", ")", "is", "a", "Cys2His2zinc", "finger", "transcription", "factor", "which", "is", "thought", "to", "play", "a", "role", "in", "the", "regulation", "of", "peripheral", "nervous", "system", "myelination", ".", "This", "idea", "is", "based", "partly", "on", "the", "phenotype", "of", "homozygous", "Krox20", "(", "Egr2", ")", "knockout", "mice", ",", "which", "display", "hypomyelination", "of", "the", "PNS", "and", "a", "block", "of", "Schwann", "cells", "at", "an", "early", "stage", "of", "differentiation", ".", "Mutations", "in", "the", "human", "EGR2", "gene", "have", "recently", "been", "associated", "with", "the", "inherited", "peripheral", "neuropathies", "Charcot", "-", "Marie", "-", "Tooth", "type", "1", ",", "Dejerine", "-", "Sottas", "syndrome", "and", "congenital", "hypomyelinating", "neuropathy", ".", "Three", "of", "the", "four", "EGR2", "mutations", "are", "dominant", "and", "occur", "within", "the", "zinc", "finger", "DNA", "-", "binding", "domain", ".", "The", "fourth", "mutation", "is", "recessive", "and", "affects", "the", "inhibitory", "domain", "(", "R1", ")", "that", "binds", "the", "NAB", "transcriptional", "co", "-", "repressors", ".", "A", "combination", "of", "DNA", "-", "binding", "assays", "and", "transcriptional", "analysis", "was", "used", "to", "determine", "the", "functional", "consequences", "of", "these", "mutations", ".", "The", "zinc", "finger", "mutations", "affect", "DNA", "binding", "and", "the", "amount", "of", "residual", "binding", "directly", "correlates", "with", "disease", "severity", ".", "The", "R1", "domain", "mutation", "prevents", "interaction", "of", "EGR2", "with", "the", "NAB", "co", "-", "repressors", "and", "thereby", "increases", "transcriptional", "activity", ".", "These", "data", "provide", "insight", "into", "the", "possible", "disease", "mechanisms", "underlying", "EGR2", "mutations", "and", "the", "reason", "for", "varying", "severity", "and", "differences", "in", "inheritance", "patterns", ".", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 3, 4, 4, 4, 4, 4, 4, 0, 3, 4, 4, 4, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
10369876	[ "Autosomal", "recessive", "familial", "neurohypophyseal", "diabetes", "insipidus", "with", "continued", "secretion", "of", "mutant", "weakly", "active", "vasopressin", ".", "Familial", "neurohypophyseal", "diabetes", "insipidus", "is", "an", "autosomal", "dominant", "disorder", "characterized", "by", "post", "-", "natal", "development", "of", "arginine", "vasopressin", "(", "AVP", ")", "deficiency", "due", "to", "mutations", "in", "the", "AVP", "gene", ".", "All", "published", "mutations", "affect", "the", "signal", "peptide", "or", "the", "neurophysin", "-", "II", "carrier", "protein", "and", "are", "presumed", "to", "interfere", "with", "processing", "of", "the", "preprohormone", ",", "leading", "to", "neuronal", "damage", ".", "We", "studied", "an", "unusual", "Palestinian", "family", "consisting", "of", "asymptomatic", "first", "cousin", "parents", "and", "three", "children", "affected", "with", "neurohypophyseal", "diabetes", "insipidus", ",", "suggesting", "autosomal", "recessive", "inheritance", ".", "All", "three", "affected", "children", "were", "homozygous", "and", "the", "parents", "heterozygous", "for", "a", "single", "novel", "mutation", "(", "C301", "-", ">", "T", ")", "in", "exon", "1", ",", "replacing", "Pro7", "of", "mature", "AVP", "with", "Leu", "(", "Leu", "-", "AVP", ")", ".", "Leu", "-", "AVP", "was", "a", "weak", "agonist", "with", "approximately", "30", "-", "fold", "reduced", "binding", "to", "the", "human", "V2", "receptor", ".", "Measured", "by", "radioimmunoassay", "with", "a", "synthetic", "Leu", "-", "AVP", "standard", ",", "serum", "Leu", "-", "AVP", "levels", "were", "elevated", "in", "all", "three", "children", "and", "further", "increased", "during", "water", "deprivation", "to", "as", "high", "as", "30", "times", "normal", ".", "The", "youngest", "child", "(", "2", "years", "old", ")", "was", "only", "mildly", "affected", "but", "had", "Leu", "-", "AVP", "levels", "similar", "to", "her", "severely", "affected", "8", "-", "year", "-", "old", "brother", ",", "suggesting", "that", "unknown", "mechanisms", "may", "partially", "compensate", "for", "a", "deficiency", "of", "active", "AVP", "in", "very", "young", "children", ".", "." ]	[ 3, 4, 4, 4, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
10377440	[ "X", "inactivation", "and", "somatic", "cell", "selection", "rescue", "female", "mice", "carrying", "a", "Piga", "-", "mutation", ".", "A", "somatic", "mutation", "in", "the", "X", "linked", "PIGA", "gene", "is", "responsible", "for", "the", "deficiency", "of", "glycosyl", "phosphatidylinositol", "(", "GPI", ")", "-", "anchored", "proteins", "on", "blood", "cells", "from", "patients", "with", "paroxysmal", "nocturnal", "hemoglobinuria", ".", "No", "inherited", "form", "of", "GPI", "-", "anchor", "deficiency", "has", "been", "described", ".", "Because", "conventional", "Piga", "gene", "knockout", "is", "associated", "with", "high", "embryonic", "lethality", "in", "chimeric", "mice", ",", "we", "used", "the", "Cre", "/", "loxP", "system", ".", "We", "generated", "mice", "in", "which", "two", "loxP", "sites", "flank", "part", "of", "Piga", "exon", "2", ".", "After", "crossbreeding", "with", "female", "mice", "of", "the", "EIIa", "-", "cre", "strain", ",", "the", "floxed", "allele", "undergoes", "Cre", "-", "mediated", "recombination", "with", "high", "efficiency", "during", "early", "embryonic", "development", ".", "Because", "of", "X", "chromosome", "inactivation", ",", "female", "offspring", "are", "mosaic", "for", "cells", "that", "express", "or", "lack", "GPI", "-", "linked", "proteins", ".", "Analysis", "of", "mosaic", "mice", "showed", "that", "in", "heart", ",", "lung", ",", "kidney", ",", "brain", ",", "and", "liver", ",", "mainly", "wild", "-", "type", "Piga", "is", "active", ",", "suggesting", "that", "these", "tissues", "require", "GPI", "-", "linked", "proteins", ".", "The", "salient", "exceptions", "were", "spleen", ",", "thymus", ",", "and", "red", "blood", "cells", ",", "which", "had", "almost", "equal", "numbers", "of", "cells", "expressing", "the", "wild", "-", "type", "or", "the", "recombined", "allele", ",", "implying", "that", "GPI", "-", "linked", "proteins", "are", "not", "essential", "for", "the", "derivation", "of", "these", "tissues", ".", "PIGA", "(", "-", ")", "cells", "had", "no", "growth", "advantage", ",", "suggesting", "that", "other", "factors", "are", "needed", "for", "their", "clonal", "dominance", "in", "patients", "with", "paroxysmal", "nocturnal", "hemoglobinuria", ".", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0 ]
10381492	[ "The", "C282Y", "mutation", "causing", "hereditary", "hemochromatosis", "does", "not", "produce", "a", "allele", ".", "Targeted", "mutagenesis", "was", "used", "to", "produce", "two", "mutations", "in", "the", "murine", "hemochromatosis", "gene", "(", "Hfe", ")", "locus", ".", "The", "first", "mutation", "deletes", "a", "large", "portion", "of", "the", "coding", "sequence", ",", "generating", "a", "allele", ".", "The", "second", "mutation", "introduces", "a", "missense", "mutation", "(", "C282Y", ")", "into", "the", "Hfe", "locus", ",", "but", "otherwise", "leaves", "the", "gene", "intact", ".", "This", "mutation", "is", "identical", "to", "the", "disease", "-", "causing", "mutation", "in", "patients", "with", "hereditary", "hemochromatosis", ".", "Mice", "carrying", "each", "of", "the", "two", "mutations", "were", "bred", "and", "analyzed", ".", "Homozygosity", "for", "either", "mutation", "results", "in", "postnatal", "iron", "loading", ".", "The", "effects", "of", "the", "mutation", "are", "more", "severe", "than", "the", "effects", "of", "the", "C282Y", "mutation", ".", "Mice", "heterozygous", "for", "either", "mutation", "accumulate", "more", "iron", "than", "normal", "controls", ".", "Interestingly", ",", "although", "liver", "iron", "stores", "are", "greatly", "increased", ",", "splenic", "iron", "is", "decreased", ".", "We", "conclude", "that", "the", "C282Y", "mutation", "does", "not", "result", "in", "a", "allele", ".", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
10382909	[ "Genotype", "-", "phenotype", "analysis", "in", "X", "-", "linked", "Emery", "-", "Dreifuss", "muscular", "dystrophy", "and", "identification", "of", "a", "missense", "mutation", "associated", "with", "a", "milder", "phenotype", ".", "Direct", "sequencing", "of", "the", "emerin", "gene", "in", "22", "families", "with", "Emery", "-", "Dreifuss", "muscular", "dystrophy", "(", "EMD", ")", "revealed", "mutations", "in", "21", "(", "95", "%", ")", ",", "confirming", "that", "emerin", "mutations", "can", "be", "identified", "in", "the", "majority", "of", "families", "with", "X", "-", "linked", "EMD", ".", "Most", "emerin", "mutations", "result", "in", "absence", "of", "the", "protein", ".", "In", "this", "study", "three", "mutations", "(", "a", "missense", "mutation", "Pro183Thr", "and", "two", "in", "-", "frame", "deletions", "removing", "residues", "95", "-", "99", "and", "236", "-", "241", ",", "respectively", ")", "were", "unusual", "in", "being", "associated", "with", "expression", "of", "mutant", "protein", ".", "The", "phenotype", "in", "these", "families", "was", "compared", "in", "detail", "with", "the", "clinical", "features", "in", "cases", "with", "typical", "mutations", ".", "For", "the", "in", "-", "frame", "deletions", "there", "were", "no", "significant", "differences", ".", "In", "the", "family", "with", "the", "missense", "mutation", "the", "phenotype", "was", "milder", ".", "Age", "at", "onset", "was", "later", "for", "first", "symptoms", "and", "for", "development", "of", "ankle", "contractures", "and", "muscle", "weakness", ".", "These", "findings", "have", "diagnostic", "implications", "as", "well", "as", "pointing", "to", "functionally", "important", "regions", "of", "the", "emerin", "protein", ".", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 4, 4, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
10382910	[ "Severe", "clinical", "expression", "in", "X", "-", "linked", "Emery", "-", "Dreifuss", "muscular", "dystrophy", ".", "X", "-", "linked", "Emery", "-", "Dreifuss", "muscular", "dystrophy", "(", "EDMD", ")", "is", "a", "relatively", "rare", "benign", "neuromuscular", "disorder", "which", "can", "vary", "remarkably", "in", "onset", ",", "course", "and", "severity", ".", "In", "the", "present", "study", ",", "a", "TCTAC", "deletion", "spanning", "the", "nucleotides", "631", "-", "635", "of", "the", "emerin", "gene", "caused", "an", "unusually", "severe", "disease", "phenotype", "including", "loss", "of", "ambulation", "and", "severe", "muscle", "wasting", "in", "two", "affected", "brothers", ".", "The", "same", "mutation", "has", "been", "reported", "previously", "in", "an", "unrelated", "family", "showing", "a", "significantly", "milder", "phenotype", ".", "The", "interfamilial", "heterogeneity", "in", "distribution", "and", "in", "severity", "of", "the", "features", "in", "the", "two", "families", "point", "to", "environmental", "or", "genetic", "modification", "as", "the", "cause", "of", "clinical", "variability", "in", "Emery", "-", "Dreifuss", "muscular", "dystrophy", ".", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 4, 4, 4, 4, 0, 3, 4, 4, 4, 4, 4, 4, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 4, 0, 0 ]
10398279	[ "Common", "mutations", "in", "BRCA1", "and", "BRCA2", "do", "not", "contribute", "to", "early", "prostate", "cancer", "in", "Jewish", "men", ".", "BACKGROUND", "Families", "with", "a", "high", "incidence", "of", "hereditary", "breast", "cancer", ",", "and", "subsequently", "shown", "to", "have", "terminating", "mutations", "in", "BRCA1", "or", "BRCA2", ",", "appear", "to", "have", "a", "higher", "incidence", "of", "prostate", "cancer", "among", "male", "relatives", ".", "We", "aimed", "to", "determine", "whether", "the", "common", "germline", "mutations", "of", "BRCA1", "or", "BRCA2", "in", "Ashkenazi", "Jewish", "men", "predisposed", "them", "to", "prostate", "cancer", ".", "METHODS", "We", "examined", "genomic", "DNA", "from", "83", "(", "for", "BRCA1", "185delAG", ")", "or", "82", "(", "for", "BRCA2", "6174delT", ")", "Ashkenazi", "Jewish", "prostate", "cancer", "patients", ",", "most", "of", "whom", "were", "treated", "at", "a", "relatively", "young", "age", ",", "for", "the", "most", "common", "germline", "mutation", "in", "each", "gene", "seen", "in", "the", "Ashkenazi", "population", ".", "RESULTS", "Our", "study", "should", "have", "been", "able", "to", "detect", "a", "4", "-", "5", "-", "fold", "increase", "in", "the", "risk", "of", "prostate", "cancer", "due", "to", "mutation", "of", "BRCA1", "or", "BRCA2", ".", "However", ",", "only", "one", "(", "1", ".", "15", "%", ";", "95", "%", "confidence", "interval", ",", "0", "-", "3", ".", "6", "%", ")", "of", "the", "patients", "was", "heterozygous", "for", "the", "BRCA1", "mutant", "allele", ",", "and", "only", "two", "were", "heterozygous", "for", "the", "BRCA2", "mutation", "(", "2", ".", "4", "%", ";", "95", "%", "confidence", "interval", ",", "0", "-", "6", ".", "2", "%", ")", ".", "CONCLUSIONS", "The", "incidence", "of", "each", "of", "the", "germline", "mutations", "in", "these", "prostate", "cancer", "patients", "closely", "matched", "their", "incidence", "(", "about", "1", "%", ")", "in", "the", "general", "Ashkenazi", "Jewish", "population", ".", "This", "suggests", "that", "unlike", "cases", "of", "breast", "and", "ovarian", "cancers", ",", "mutations", "in", "BRCA1", "or", "BRCA2", "do", "not", "significantly", "predispose", "men", "to", "prostate", "cancer" ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4 ]
10398436	[ "Beta", "-", "catenin", "accumulation", "and", "mutation", "of", "the", "CTNNB1", "gene", "in", "hepatoblastoma", ".", "Hepatoblastoma", "is", "a", "rare", "malignant", "tumor", "of", "the", "liver", "that", "occurs", "in", "children", "at", "an", "average", "age", "of", "2", "to", "3", "years", ".", "Epidemiologic", "studies", "have", "shown", "an", "increased", "frequency", "of", "this", "tumor", "type", "in", "families", "affected", "by", "adenomatous", "polyposis", "coli", ".", "In", "addition", "to", "the", "epidemiologic", "data", ",", "molecular", "genetic", "studies", "suggest", "that", "inactivation", "of", "the", "APC", "tumor", "suppressor", "may", "be", "involved", "in", "hepatoblastoma", "tumorigenesis", ".", "A", "major", "function", "of", "APC", "is", "the", "downregulation", "of", "beta", "-", "catenin", ",", "a", "transcription", "-", "activating", "protein", "with", "oncogenic", "potential", ".", "In", "an", "ongoing", "immunohistochemical", "study", "of", "beta", "-", "catenin", "expression", "in", "sporadic", "cases", "of", "tumor", "types", "that", "are", "associated", "with", "adenomatous", "polyposis", "coli", ",", "we", "observed", "increased", "beta", "-", "catenin", "levels", "in", "the", "cytoplasm", "and", "in", "the", "nuclei", "of", "three", "investigated", "hepatoblastomas", ".", "Sequencing", "of", "exon", "3", "of", "the", "beta", "-", "catenin", "gene", "(", "CTNNB1", ")", "revealed", "an", "activating", "mutation", "in", "one", "of", "the", "tumor", "samples", ".", "Our", "data", "indicate", "for", "the", "first", "time", "that", "beta", "-", "catenin", "accumulation", "may", "play", "a", "role", "in", "the", "development", "of", "hepatoblastoma", "and", "that", "activating", "mutations", "of", "the", "beta", "-", "catenin", "gene", "may", "substitute", "biallelic", "APC", "inactivation", "in", "this", "tumor", "type", ".", "Genes", "Chromosomes", "Cancer", "25", "399", "-", "402", ",", "1999", ".", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 3, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
10403837	[ "Decrease", "in", "GTP", "cyclohydrolase", "I", "gene", "expression", "caused", "by", "inactivation", "of", "one", "allele", "in", "hereditary", "progressive", "dystonia", "with", "marked", "diurnal", "fluctuation", ".", "Hereditary", "progressive", "dystonia", "with", "marked", "diurnal", "fluctuation", "(", "HPD", ";", "dopa", "-", "responsive", "dystonia", ",", "DRD", ")", "have", "been", "recently", "found", "to", "be", "caused", "by", "a", "genetic", "defect", "in", "the", "GTP", "cyclohydrolase", "I", "(", "GCH1", ")", "gene", ".", "In", "this", "study", ",", "we", "quantified", "the", "mRNA", "level", "of", "GCH1", "in", "phytohemagglutinin", "(", "PHA", ")", "-", "stimulated", "mononuclear", "blood", "cells", "from", "one", "Japanese", "family", "that", "do", "not", "have", "a", "mutation", "in", "the", "coding", "region", "or", "splice", "junctions", "of", "the", "gene", ".", "The", "results", "showed", "that", "the", "amounts", "of", "the", "GCH1", "mRNA", "were", "decreased", "to", "about", "40", "%", "of", "the", "normal", "level", "in", "both", "patients", "and", "carriers", ".", "In", "addition", ",", "we", "found", "that", "the", "GCH1", "mRNA", "was", "transcribed", "from", "only", "one", "allele", ",", "indicating", "that", "the", "other", "allele", "was", "in", "an", "inactive", "state", ".", "These", "results", "suggest", "that", "some", "novel", "mutations", "should", "exist", "on", "one", "of", "the", "alleles", "in", "some", "unknown", "region", "of", "the", "GCH1", "gene", ",", "and", "may", "decrease", "the", "GCH1", "mRNA", "causing", "the", "HPD", "/", "DRD", "symptoms", ".", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 3, 4, 4, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 7, 0, 0, 0 ]
10404839	[ "Sulfate", "transport", "is", "not", "impaired", "in", "pendred", "syndrome", "thyrocytes", ".", "Pendred", "syndrome", "is", "the", "most", "common", "form", "of", "syndromic", "deafness", ",", "characterized", "by", "dyshormonogenic", "goiter", "associated", "with", "sensory", "-", "neural", "deafness", ".", "The", "gene", "responsible", "for", "the", "disease", "(", "PDS", ")", "has", "been", "cloned", ",", "but", "its", "function", "is", "as", "yet", "unknown", "and", "the", "connection", "between", "thyroid", "goiter", "and", "sensory", "-", "neural", "deafness", "remains", "an", "enigma", ".", "PDS", "codes", "for", "a", "novel", "protein", ",", "pendrin", ",", "which", "is", "closely", "related", "to", "a", "number", "of", "sufate", "transporters", ".", "Mechanisms", "by", "which", "abnormal", "sulfate", "transport", "could", "deleteriously", "affect", "iodide", "organification", "have", "been", "proposed", ".", "We", "tested", "sulfate", "transport", "in", "thyrocytes", "obtained", "from", "Pendred", "syndrome", "patients", "and", "found", "that", "it", "was", "not", "defective", ".", "This", "suggests", "that", "pendrin", "in", "fact", "may", "not", "be", "a", "sulfate", "transporter", ",", "and", "emphasizes", "the", "importance", "of", "functional", "studies", "on", "this", "novel", "protein", ".", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 1, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
10406661	[ "Small", "deletions", "in", "the", "type", "II", "collagen", "triple", "helix", "produce", "kniest", "dysplasia", ".", "Kniest", "dysplasia", "is", "a", "moderately", "severe", "type", "II", "collagenopathy", ",", "characterized", "by", "short", "trunk", "and", "limbs", ",", "kyphoscoliosis", ",", "midface", "hypoplasia", ",", "severe", "myopia", ",", "and", "hearing", "loss", ".", "Mutations", "in", "the", "gene", "that", "encodes", "type", "II", "collagen", "(", "COL2A1", ")", ",", "the", "predominant", "protein", "of", "cartilage", ",", "have", "been", "identified", "in", "a", "number", "of", "individuals", "with", "Kniest", "dysplasia", ".", "All", "but", "two", "of", "these", "previously", "described", "mutations", "cause", "in", "-", "frame", "deletions", "in", "type", "II", "collagen", ",", "either", "by", "small", "deletions", "in", "the", "gene", "or", "splice", "site", "alterations", ".", "Furthermore", ",", "all", "but", "one", "of", "these", "mutations", "is", "located", "between", "exons", "12", "and", "24", "in", "the", "COL2A1", "gene", ".", "We", "used", "heteroduplex", "analysis", "to", "identify", "sequence", "anomalies", "in", "five", "individuals", "with", "Kniest", "dysplasia", ".", "Sequencing", "of", "the", "index", "patients", "genomic", "DNA", "identified", "four", "new", "dominant", "mutations", "in", "COL2A1", "that", "result", "in", "Kniest", "dysplasia", "a", "21", "-", "bp", "deletion", "in", "exon", "16", ",", "an", "18", "-", "bp", "deletion", "in", "exon", "19", ",", "and", "4", "-", "bp", "deletions", "in", "the", "splice", "donor", "sites", "of", "introns", "14", "and", "20", ".", "A", "previously", "described", "28", "-", "bp", "deletion", "at", "the", "COL2A1", "exon", "12", "-", "intron", "12", "junction", ",", "deleting", "the", "splice", "donor", "site", ",", "was", "identified", "in", "the", "fifth", "case", ".", "The", "latter", "three", "mutations", "are", "predicted", "to", "result", "in", "exon", "skipping", "in", "the", "mRNA", "encoded", "from", "the", "mutant", "allele", ".", "These", "data", "suggest", "that", "Kniest", "dysplasia", "results", "from", "shorter", "type", "II", "collagen", "monomers", ",", "and", "support", "the", "hypothesis", "that", "alteration", "of", "a", "specific", "COL2A1", "domain", ",", "which", "may", "span", "from", "exons", "12", "to", "24", ",", "leads", "to", "the", "Kniest", "dysplasia", "phenotype", ".", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 3, 4, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 0, 0, 0 ]
10408771	[ "Classical", "galactosemia", "and", "mutations", "at", "the", "galactose", "-", "1", "-", "phosphate", "uridyl", "transferase", "(", "GALT", ")", "gene", ".", "Classical", "galactosemia", "is", "caused", "by", "a", "deficiency", "in", "activity", "of", "the", "enzyme", "galactose", "-", "1", "-", "phosphate", "uridyl", "transferase", "(", "GALT", ")", ",", "which", ",", "in", "turn", ",", "is", "caused", "by", "mutations", "at", "the", "GALT", "gene", ".", "The", "disorder", "exhibits", "considerable", "allelic", "heterogeneity", "and", ",", "at", "the", "end", "of", "1998", ",", "more", "than", "150", "different", "base", "changes", "were", "recorded", "in", "24", "different", "populations", "and", "ethnic", "groups", "in", "15", "countries", "worldwide", ".", "The", "mutations", "most", "frequently", "cited", "are", "Q188R", ",", "K285N", ",", "S135L", ",", "and", "N314D", ".", "Q188R", "is", "the", "most", "common", "mutation", "in", "European", "populations", "or", "in", "those", "predominantly", "of", "European", "descent", ".", "Overall", ",", "it", "accounts", "for", "60", "-", "70", "%", "of", "mutant", "chromosomes", ",", "but", "there", "are", "significant", "differences", "in", "its", "relative", "frequency", "in", "individual", "populations", ".", "Individuals", "homoallelic", "for", "Q188R", "tend", "to", "have", "a", "severe", "phenotype", "and", "this", "is", "in", "keeping", "with", "the", "virtually", "complete", "loss", "of", "enzyme", "activity", "observed", "in", "in", "vitro", "expression", "systems", ".", "Globally", ",", "K285N", "is", "rarer", ",", "but", "in", "many", "European", "populations", "it", "can", "be", "found", "on", "25", "-", "40", "%", "of", "mutant", "chromosomes", ".", "It", "is", "invariably", "associated", "with", "a", "severe", "phenotype", ".", "S135L", "is", "found", "almost", "exclusively", "in", "African", "Americans", ".", "In", "vitro", "expression", "results", "are", "discrepant", ",", "but", "some", "individuals", "carrying", "S135L", "appear", "to", "exhibit", "GALT", "activity", "in", "some", "tissues", ".", "Duarte", "1", "(", "or", "Los", "Angeles", ")", "and", "Duarte", "2", "(", "or", "Duarte", ")", "variants", "carry", "the", "same", "amino", "acid", "substitution", ",", "N314D", ",", "even", "though", "D1", "is", "associated", "with", "increased", "erythrocyte", "GALT", "activity", "and", "D2", "with", "reduced", "activity", ".", "N314D", "is", "in", "linkage", "disequilibrium", "with", "other", "base", "changes", "that", "differ", "on", "the", "D1", "and", "D2", "alleles", ".", "N314D", "does", "not", "impair", "GALT", "activity", "in", "in", "vitro", "expression", "systems", ".", "However", ",", "there", "are", "differences", "in", "the", "abundance", "of", "GALT", "protein", "in", "lymphoblastoid", "cells", "lines", "from", "D2", "and", "D1", "individuals", ".", "It", "is", "unclear", "whether", "the", "specific", "molecular", "changes", "that", "distinguish", "the", "D1", "and", "D2", "alleles", "account", "for", "the", "different", "activities", ".", "The", "considerable", "genetic", "heterogeneity", "documented", "to", "date", "undoubtedly", "contributes", "to", "the", "phenotypic", "heterogeneity", "that", "is", "observed", "in", "galactosemia", ".", "The", "additional", "effects", "of", "nonallelic", "variation", "and", "other", "constitutional", "factors", "on", "phenotypic", "variability", "remain", "to", "be", "elucidated", ".", "." ]	[ 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
10408776	[ "Mutations", "of", "the", "VHL", "gene", "in", "sporadic", "renal", "cell", "carcinoma", ":", "definition", "of", "a", "risk", "factor", "for", "VHL", "patients", "to", "develop", "an", "RCC", ".", "To", "investigate", "the", "nature", "of", "somatic", "von", "Hippel", "-", "Lindau", "(", "VHL", ")", "mutations", ",", "we", "analyzed", "173", "primary", "sporadic", "human", "renal", "cell", "carcinomas", "for", "mutations", "of", "the", "VHL", "tumor", "suppressor", "gene", ",", "using", "polymerase", "chain", "reaction", "(", "PCR", ")", "and", "single", "-", "strand", "conformational", "polymorphism", "analysis", "(", "SSCP", ")", "of", "DNA", ".", "We", "detected", "abnormal", "SSCP", "pattern", "in", "73", "samples", ".", "After", "sequencing", ",", "we", "identified", "microdeletions", "in", "58", "%", "of", "cases", ",", "microinsertions", "in", "17", "%", ",", "nonsense", "mutations", "in", "8", "%", ",", "and", "missense", "mutations", "in", "17", "%", ".", "Among", "these", "mutations", ",", "50", "%", "correspond", "to", "new", "mutations", ".", "VHL", "mutations", "were", "found", "only", "in", "the", "nonpapillary", "renal", "cell", "carcinoma", "(", "RCC", ")", "subtype", ",", "as", "previously", "reported", ".", "To", "compare", "somatic", "and", "germline", "mutations", ",", "we", "used", "the", "VHL", "database", ",", "which", "includes", "507", "mutations", ".", "The", "study", "of", "mutational", "events", "revealed", "a", "significant", "difference", "between", "somatic", "and", "germline", "mutations", "with", "mutations", "leading", "to", "truncated", "proteins", "observed", "in", "78", "%", "of", "somatic", "mutations", "vs", "only", "37", "%", "in", "germline", "mutations", "(", "P", "<", "0", ".", "001", ")", ".", "We", "postulated", "that", "a", "specific", "pattern", "of", "VHL", "mutations", "is", "associated", "with", "sporadic", "RCC", ".", "This", "pattern", "corresponds", "to", "mutations", "leading", "mainly", "to", "truncated", "proteins", "with", "few", "specific", "missense", "mutations", ".", "We", "then", "analyzed", "the", "occurrence", "of", "RCC", "in", "VHL", "families", ",", "based", "on", "the", "nature", "of", "mutations", ".", "We", "observed", "RCC", "in", "at", "least", "one", "member", "of", "the", "VHL", "families", "in", "77", "%", "of", "cases", "with", "mutations", "leading", "to", "truncated", "proteins", "versus", "55", "%", "in", "cases", "with", "missense", "mutations", "(", "P", "<", "0", ".", "05", ")", ".", "Thus", ",", "mutations", "resulting", "in", "truncated", "proteins", "may", "lead", "to", "a", "higher", "risk", "of", "RCC", "in", "VHL", "patients" ]	[ 0, 0, 0, 7, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 8, 8, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 8, 8, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 7, 0 ]
10411929	[ "Defective", "CTLA", "-", "4", "cycling", "pathway", "in", "Chediak", "-", "Higashi", "syndrome", ":", "a", "possible", "mechanism", "for", "deregulation", "of", "T", "lymphocyte", "activation", ".", "Cytotoxic", "T", "lymphocyte", "-", "associated", "antigen", "4", "(", "CTLA", "-", "4", ",", "also", "known", "as", "CD152", ")", "has", "been", "shown", "to", "play", "a", "major", "role", "in", "the", "regulation", "of", "T", "cell", "activation", ".", "Its", "membrane", "expression", "is", "highly", "regulated", "by", "endocytosis", "and", "trafficking", "through", "the", "secretory", "lysosome", "pathway", ".", "Chediak", "-", "Higashi", "syndrome", "(", "CHS", ")", "is", "an", "inherited", "disorder", "caused", "by", "mutations", "in", "the", "lysosomal", "trafficking", "regulator", "gene", ",", "LYST", ".", "It", "results", "in", "defective", "membrane", "targeting", "of", "the", "proteins", "present", "in", "secretory", "lysosomes", ",", "and", "it", "is", "associated", "with", "a", "variety", "of", "features", ",", "including", "a", "lymphoproliferative", "syndrome", "with", "hemophagocytosis", ".", "The", "murine", "equivalent", "of", "CHS", ",", "beige", "mice", ",", "present", "similar", "characteristics", "but", "do", "not", "develop", "the", "lymphoproliferative", "syndrome", ".", "We", "show", "herein", "that", "CTLA", "-", "4", "is", "present", "in", "enlarged", ",", "abnormal", "vesicles", "in", "CHS", "T", "cells", "and", "is", "not", "properly", "expressed", "at", "the", "cell", "surface", "after", "T", "cell", "activation", ",", "whereas", "its", "surface", "expression", "is", "not", "impaired", ".", "It", "is", "therefore", "proposed", "that", "the", "defective", "surface", "expression", "of", "CTLA", "-", "4", "by", "CHS", "T", "cells", "is", "involved", "in", "the", "generation", "of", "lymphoproliferative", "disease", ".", "This", "observation", "may", "provide", "insight", "into", "the", "role", "of", "CTLA", "-", "4", "in", "humans", ".", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
10417279	[ "Proteolipoprotein", "gene", "analysis", "in", "82", "patients", "with", "sporadic", "Pelizaeus", "-", "Merzbacher", "Disease", ":", "duplications", ",", "the", "major", "cause", "of", "the", "disease", ",", "originate", "more", "frequently", "in", "male", "germ", "cells", ",", "but", "point", "mutations", "do", "not", ".", "The", "Clinical", "European", "Network", "on", "Brain", "Dysmyelinating", "Disease", ".", "Pelizaeus", "-", "Merzbacher", "Disease", "(", "PMD", ")", "is", "an", "X", "-", "linked", "developmental", "defect", "of", "myelination", "affecting", "the", "central", "nervous", "system", "and", "segregating", "with", "the", "proteolipoprotein", "(", "PLP", ")", "locus", ".", "Investigating", "82", "strictly", "selected", "sporadic", "cases", "of", "PMD", ",", "we", "found", "PLP", "mutations", "in", "77", "%", ";", "complete", "PLP", "-", "gene", "duplications", "were", "the", "most", "frequent", "abnormality", "(", "62", "%", ")", ",", "whereas", "point", "mutations", "in", "coding", "or", "splice", "-", "site", "regions", "of", "the", "gene", "were", "involved", "less", "frequently", "(", "38", "%", ")", ".", "We", "analyzed", "the", "maternal", "status", "of", "56", "cases", "to", "determine", "the", "origin", "of", "both", "types", "of", "PLP", "mutation", ",", "since", "this", "is", "relevant", "to", "genetic", "counseling", ".", "In", "the", "22", "point", "mutations", ",", "68", "%", "of", "mothers", "were", "heterozygous", "for", "the", "mutation", ",", "a", "value", "identical", "to", "the", "two", "-", "thirds", "of", "carrier", "mothers", "that", "would", "be", "expected", "if", "there", "were", "an", "equal", "mutation", "rate", "in", "male", "and", "female", "germ", "cells", ".", "In", "sharp", "contrast", ",", "among", "the", "34", "duplicated", "cases", ",", "91", "%", "of", "mothers", "were", "carriers", ",", "a", "value", "significantly", "(", "chi2", "=", "9", ".", "20", ",", "P", "<", ".", "01", ")", "in", "favor", "of", "a", "male", "bias", ",", "with", "an", "estimation", "of", "the", "male", "/", "female", "mutation", "frequency", "(", "k", ")", "of", "9", ".", "3", "3", ".", "Moreover", ",", "we", "observed", "the", "occurrence", "of", "de", "novo", "mutations", "between", "parental", "and", "grandparental", "generations", "in", "17", "three", "-", "generation", "families", ",", "which", "allowed", "a", "direct", "estimation", "of", "the", "k", "value", "(", "k", "=", "11", ")", ".", "Again", ",", "a", "significant", "male", "mutation", "imbalance", "was", "observed", "only", "for", "the", "duplications", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 3, 4, 4, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
10417280	[ "Chromosome", "breakage", "in", "the", "Prader", "-", "Willi", "and", "Angelman", "syndromes", "involves", "recombination", "between", "large", ",", "transcribed", "repeats", "at", "proximal", "and", "distal", "breakpoints", ".", "Prader", "-", "Willi", "syndrome", "(", "PWS", ")", "and", "Angelman", "syndrome", "(", "AS", ")", "are", "distinct", "neurobehavioral", "disorders", "that", "most", "often", "arise", "from", "a", "4", "-", "Mb", "deletion", "of", "chromosome", "15q11", "-", "q13", "during", "paternal", "or", "maternal", "gametogenesis", ",", "respectively", ".", "At", "a", "de", "novo", "frequency", "of", "approximately", ".", "67", "-", "1", "/", "10", ",", "000", "births", ",", "these", "deletions", "represent", "a", "common", "structural", "chromosome", "change", "in", "the", "human", "genome", ".", "To", "elucidate", "the", "mechanism", "underlying", "these", "events", ",", "we", "characterized", "the", "regions", "that", "contain", "two", "proximal", "breakpoint", "clusters", "and", "a", "distal", "cluster", ".", "Novel", "DNA", "sequences", "potentially", "associated", "with", "the", "breakpoints", "were", "positionally", "cloned", "from", "YACs", "within", "or", "near", "these", "regions", ".", "Analyses", "of", "rodent", "-", "human", "somatic", "-", "cell", "hybrids", ",", "YAC", "contigs", ",", "and", "FISH", "of", "normal", "or", "rearranged", "chromosomes", "15", "identified", "duplicated", "sequences", "(", "the", "END", "repeats", ")", "at", "or", "near", "the", "breakpoints", ".", "The", "END", "-", "repeat", "units", "are", "derived", "from", "large", "genomic", "duplications", "of", "a", "novel", "gene", "(", "HERC2", ")", ",", "many", "copies", "of", "which", "are", "transcriptionally", "active", "in", "germline", "tissues", ".", "One", "of", "five", "PWS", "/", "AS", "patients", "analyzed", "to", "date", "has", "an", "identifiable", ",", "rearranged", "HERC2", "transcript", "derived", "from", "the", "deletion", "event", ".", "We", "postulate", "that", "the", "END", "repeats", "flanking", "15q11", "-", "q13", "mediate", "homologous", "recombination", "resulting", "in", "deletion", ".", "Furthermore", ",", "we", "propose", "that", "active", "transcription", "of", "these", "repeats", "in", "male", "and", "female", "germ", "cells", "may", "facilitate", "the", "homologous", "recombination", "process", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 6, 6, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 0, 3, 0, 0, 3, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
10417286	[ "Linkage", "analysis", "in", "a", "large", "Brazilian", "family", "with", "van", "der", "Woude", "syndrome", "suggests", "the", "existence", "of", "a", "susceptibility", "locus", "for", "cleft", "palate", "at", "17p11", ".", "2", "-", "11", ".", "1", ".", "van", "der", "Woude", "syndrome", "(", "VWS", ")", ",", "which", "has", "been", "mapped", "to", "1q32", "-", "41", ",", "is", "characterized", "by", "pits", "and", "/", "or", "sinuses", "of", "the", "lower", "lip", ",", "cleft", "lip", "/", "palate", "(", "CL", "/", "P", ")", ",", "cleft", "palate", "(", "CP", ")", ",", "bifid", "uvula", ",", "and", "hypodontia", "(", "H", ")", ".", "The", "expression", "of", "VWS", ",", "which", "has", "incomplete", "penetrance", ",", "is", "highly", "variable", ".", "Both", "the", "occurrence", "of", "CL", "/", "P", "and", "CP", "within", "the", "same", "genealogy", "and", "a", "recurrence", "risk", "<", "40", "%", "for", "CP", "among", "descendants", "with", "VWS", "have", "suggested", "that", "the", "development", "of", "clefts", "in", "this", "syndrome", "is", "influenced", "by", "modifying", "genes", "at", "other", "loci", ".", "To", "test", "this", "hypothesis", ",", "we", "have", "conducted", "linkage", "analysis", "in", "a", "large", "Brazilian", "kindred", "with", "VWS", ",", "considering", "as", "affected", "the", "individuals", "with", "CP", ",", "regardless", "of", "whether", "it", "is", "associated", "with", "other", "clinical", "signs", "of", "VWS", ".", "Our", "results", "suggest", "that", "a", "gene", "at", "17p11", ".", "2", "-", "11", "2", "-", "11", ".", "1", ",", "together", "with", "the", "VWS", "gene", "at", "1p32", "-", "41", ",", "enhances", "the", "probability", "of", "CP", "in", "an", "individual", "carrying", "the", "two", "at", "-", "risk", "genes", ".", "If", "this", "hypothesis", "is", "confirmed", "in", "other", "VWS", "pedigrees", ",", "it", "will", "represent", "one", "of", "the", "first", "examples", "of", "a", "gene", ",", "mapped", "through", "linkage", "analysis", ",", "which", "modifies", "the", "expression", "of", "a", "major", "gene", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 6, 6, 6, 6, 6, 6, 0, 3, 4, 4, 4, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 3, 4, 0, 3, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 3, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
10425038	[ "New", "mutations", ",", "polymorphisms", ",", "and", "rare", "variants", "in", "the", "ATM", "gene", "detected", "by", "a", "novel", "SSCP", "strategy", ".", "The", "gene", "for", "ataxia", "-", "telangiectasia", ",", "ATM", ",", "spans", "about", "150", "kb", "of", "genomic", "DNA", ".", "ATM", "mutations", "are", "found", "along", "the", "entire", "gene", ",", "with", "no", "evidence", "of", "a", "mutational", "hot", "spot", ".", "Using", "DNA", "as", "the", "starting", "material", ",", "we", "screened", "the", "ATM", "gene", "in", "92", "A", "-", "T", "patients", ",", "using", "an", "optimized", "single", "-", "strand", "conformation", "polymorphism", "(", "SSCP", ")", "technique", "that", "detected", "all", "previously", "known", "mutations", "in", "the", "polymerase", "chain", "reaction", "(", "PCR", ")", "segments", "being", "analyzed", ".", "To", "expedite", "screening", ",", "we", "sequentially", "loaded", "the", "SSCP", "gels", "with", "three", "different", "sets", "of", "PCR", "products", "that", "were", "pretested", "to", "avoid", "overlapping", "patterns", ".", "Many", "of", "the", "DNA", "changes", "we", "detected", "were", "intragenic", "polymorphisms", ".", "Of", "an", "expected", "177", "unknown", "mutations", ",", "we", "detected", "approximately", "70", "%", ",", "mostly", "protein", "truncating", "mutations", "(", "that", "would", "have", "been", "detectable", "by", "protein", "truncation", "testing", "if", "RNA", "starting", "material", "had", "been", "available", ")", ".", "Mutations", "have", "now", "been", "defined", "for", "every", "exon", "of", "the", "ATM", "gene", ".", "Herein", ",", "we", "present", "35", "new", "mutations", "and", "34", "new", "intragenic", "polymorphisms", "or", "rare", "variants", "within", "the", "ATM", "gene", ".", "This", "is", "the", "most", "comprehensive", "compilation", "of", "ATM", "polymorphisms", "assembled", "to", "date", ".", "Defining", "polymorphic", "sites", "as", "well", "as", "mutations", "in", "the", "ATM", "gene", "will", "be", "of", "great", "importance", "in", "designing", "automated", "methods", "for", "detecting", "mutations", ".", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
10426139	[ "A", "novel", "frameshift", "mutation", "in", "the", "McLeod", "syndrome", "gene", "in", "a", "Japanese", "family", ".", "We", "report", "a", "novel", "mutation", "in", "the", "XK", "gene", "(", "XK", ")", "in", "a", "Japanese", "patient", "with", "McLeod", "syndrome", ".", "A", "50", "-", "year", "-", "old", "man", "showed", "progressive", "muscular", "atrophy", ",", "choreic", "movement", ",", "elevated", "level", "of", "serum", "creatinine", "kinase", ",", "and", "acanthocytosis", ".", "The", "expression", "level", "of", "all", "the", "Kell", "antigens", "in", "erythrocyte", "was", "decreased", "and", "molecular", "analysis", "revealed", "a", "single", "-", "base", "(", "T", ")", "deletion", "at", "the", "nucleotide", "position", "1095", "in", "XK", ".", "This", "deletion", "caused", "a", "frameshift", "in", "translation", ",", "leading", "to", "a", "premature", "stop", "codon", "at", "the", "amino", "acid", "position", "408", ".", "We", "conclude", "this", "single", "-", "base", "deletion", "causes", "defective", "Kx", "protein", ",", "which", "is", "responsible", "for", "the", "McLeod", "phenotype", "in", "this", "patient", ".", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
10426999	[ "Association", "of", "BRCA1", "with", "the", "hRad50", "-", "hMre11", "-", "p95", "complex", "and", "the", "DNA", "damage", "response", ".", "BRCA1", "encodes", "a", "tumor", "suppressor", "that", "is", "mutated", "in", "familial", "breast", "and", "ovarian", "cancers", ".", "Here", ",", "it", "is", "shown", "that", "BRCA1", "interacts", "in", "vitro", "and", "in", "vivo", "with", "hRad50", ",", "which", "forms", "a", "complex", "with", "hMre11", "and", "p95", "/", "nibrin", ".", "Upon", "irradiation", ",", "BRCA1", "was", "detected", "in", "discrete", "foci", "in", "the", "nucleus", ",", "which", "colocalize", "with", "hRad50", ".", "Formation", "of", "irradiation", "-", "induced", "foci", "positive", "for", "BRCA1", ",", "hRad50", ",", "hMre11", ",", "or", "p95", "was", "dramatically", "reduced", "in", "HCC", "/", "1937", "breast", "cancer", "cells", "carrying", "a", "homozygous", "mutation", "in", "BRCA1", "but", "was", "restored", "by", "transfection", "of", "wild", "-", "type", "BRCA1", ".", "Ectopic", "expression", "of", "wild", "-", "type", ",", "but", "not", "mutated", ",", "BRCA1", "in", "these", "cells", "rendered", "them", "less", "sensitive", "to", "the", "DNA", "damage", "agent", ",", "methyl", "methanesulfonate", ".", "These", "data", "suggest", "that", "BRCA1", "is", "important", "for", "the", "cellular", "responses", "to", "DNA", "damage", "that", "are", "mediated", "by", "the", "hRad50", "-", "hMre11", "-", "p95", "complex", ".", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 6, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
10429004	[ "Relationship", "among", "genotype", ",", "biochemical", "phenotype", ",", "and", "cognitive", "performance", "in", "females", "with", "phenylalanine", "hydroxylase", "deficiency", ":", "report", "from", "the", "Maternal", "Phenylketonuria", "Collaborative", "Study", ".", "OBJECTIVE", "To", "examine", "the", "relationship", "of", "phenylalanine", "hydroxylase", "(", "PAH", ")", "genotypes", "to", "biochemical", "phenotype", "and", "cognitive", "development", "in", "maternal", "phenylketonuria", "(", "PKU", ")", ".", "METHODOLOGY", "PAH", "gene", "mutations", "were", "examined", "in", "222", "hyperphenylalaninemic", "females", "enrolled", "in", "the", "Maternal", "PKU", "Collaborative", "Study", "(", "MPKUCS", ")", ".", "A", "total", "of", "84", "different", "mutations", "were", "detected", ",", "and", "complete", "genotype", "was", "obtained", "in", "199", "individuals", ".", "Based", "on", "previous", "knowledge", "about", "mutation", "-", "phenotype", "associations", ",", "78", "of", "the", "mutations", "could", "be", "assigned", "to", "one", "of", "four", "classes", "of", "severity", "(", "severe", "PKU", ",", "moderate", "PKU", ",", "mild", "PKU", ",", "and", "mild", "hyperphenylalaninemia", "[", "MHP", "]", ")", ".", "Then", ",", "189", "MPKUCS", "subjects", "were", "grouped", "according", "to", "the", "various", "combinations", "of", "mutation", "classifications", ".", "The", "sample", "sizes", "were", "large", "enough", "for", "statistical", "testing", "in", "four", "groups", "with", "at", "least", "one", "mutation", "that", "completely", "abolishes", "enzyme", "activity", ".", "These", "patients", "are", "considered", "functionally", "hemizygous", ".", "RESULTS", "The", "biochemical", "phenotype", "predicted", "from", "the", "genotype", "in", "functionally", "hemizygous", "patients", "was", "related", "significantly", "to", "the", "assigned", "phenylalanine", "level", ".", "Cognitive", "performance", "(", "IQ", ")", "was", "also", "significantly", "related", "to", "genotype", ".", "The", "IQ", "of", "PAH", "-", "deficient", "mothers", "with", "a", "severe", "PKU", "mutation", "in", "combination", "with", "a", "MHP", "mutation", "or", "a", "mild", "PKU", "mutation", "was", "99", "and", "96", ",", "respectively", ",", "whereas", "the", "IQ", "of", "PKU", "mothers", "with", "two", "severe", "PKU", "mutations", "or", "with", "one", "severe", "and", "one", "moderate", "PKU", "mutation", "was", "83", "and", "84", ",", "respectively", ".", "Of", "the", "patients", "with", "PKU", ",", "92", "%", "had", "been", "treated", "during", "childhood", ".", "Those", "who", "were", "untreated", "or", "treated", "late", "had", "lower", "than", "average", "IQ", "scores", "for", "their", "group", "of", "mutation", "combinations", ".", "Females", "with", "moderate", "or", "mild", "PKU", "who", "were", "treated", "early", "and", "treated", "for", ">", "6", "years", "showed", "IQ", "scores", "10", "points", "above", "average", "for", "their", "group", ".", "CONCLUSIONS", "The", "reproductive", "outcome", "in", "maternal", "phenylketonuria", "is", "dependent", "on", "prenatal", "metabolic", "control", "and", "postnatal", "environmental", "circumstances", ".", "Both", "factors", "depend", "on", "the", "intellectual", "resources", "of", "the", "mother", "with", "PKU", ".", "The", "significant", "relationship", "among", "genotype", ",", "biochemical", "phenotype", ",", "and", "cognitive", "performance", "observed", "in", "the", "present", "study", "is", "of", "importance", "for", "the", "development", "of", "an", "optimal", "strategy", "for", "future", "treatment", "of", "females", "with", "PKU", "who", "plan", "pregnancy", ".", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 3, 0, 0, 3, 0, 0, 3, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 8, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0 ]
10430841	[ "Spinal", "xanthomatosis", ":", "a", "variant", "of", "cerebrotendinous", "xanthomatosis", ".", "We", "describe", "seven", "Dutch", "patients", "from", "six", "families", "with", "a", "slowly", "progressive", ",", "mainly", "spinal", "cord", "syndrome", "that", "remained", "for", "many", "years", "the", "sole", "expression", "of", "cerebrotendinous", "xanthomatosis", "(", "CTX", ")", ".", "MRI", "demonstrated", "white", "matter", "abnormalities", "in", "the", "lateral", "and", "dorsal", "columns", "of", "the", "spinal", "cord", ".", "Post", "-", "mortem", "examination", "of", "one", "of", "the", "patients", "showed", "extensive", "myelin", "loss", "in", "these", "columns", ".", "An", "array", "of", "genotypes", "was", "found", "in", "these", "patients", ".", "We", "conclude", "that", "spinal", "xanthomatosis", "is", "a", "clinical", "and", "radiological", "separate", "entity", "of", "CTX", "that", "should", "be", "included", "in", "the", "differential", "diagnosis", "of", "chronic", "myelopathy", ".", "." ]	[ 3, 4, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0 ]
10430930	[ "A", "transgene", "insertion", "creating", "a", "heritable", "chromosome", "deletion", "mouse", "model", "of", "Prader", "-", "Willi", "and", "angelman", "syndromes", ".", "Prader", "-", "Willi", "syndrome", "(", "PWS", ")", "and", "Angelman", "syndrome", "(", "AS", ")", "result", "from", "the", "loss", "of", "function", "of", "imprinted", "genes", "in", "human", "chromosome", "15q11", "-", "q13", ".", "The", "central", "part", "of", "mouse", "chromosome", "7", "is", "homologous", "to", "human", "15q11", "-", "q13", ",", "with", "conservation", "of", "both", "gene", "order", "and", "imprinted", "features", ".", "We", "report", "here", "the", "characterization", "of", "a", "transgene", "insertion", "(", "Epstein", "-", "Barr", "virus", "Latent", "Membrane", "Protein", "2A", ",", "LMP2A", ")", "into", "mouse", "chromosome", "7C", ",", "which", "has", "resulted", "in", "mouse", "models", "for", "PWS", "and", "AS", "dependent", "on", "the", "sex", "of", "the", "transmitting", "parent", ".", "Epigenotype", "(", "allelic", "expression", "and", "DNA", "methylation", ")", "and", "fluorescence", "in", "situ", "hybridization", "analyses", "indicate", "that", "the", "transgene", "-", "induced", "mutation", "has", "generated", "a", "complete", "deletion", "of", "the", "PWS", "/", "AS", "-", "homologous", "region", "but", "has", "not", "deleted", "flanking", "loci", ".", "Because", "the", "intact", "chromosome", "7", ",", "opposite", "the", "deleted", "homolog", ",", "maintains", "the", "correct", "imprint", "in", "somatic", "cells", "of", "PWS", "and", "AS", "mice", "and", "establishes", "the", "correct", "imprint", "in", "male", "and", "female", "germ", "cells", "of", "AS", "mice", ",", "homologous", "association", "and", "replication", "asynchrony", "are", "not", "part", "of", "the", "imprinting", "mechanism", ".", "This", "heritable", "-", "deletion", "mouse", "model", "will", "be", "particularly", "useful", "for", "the", "identification", "of", "the", "etiological", "genes", "and", "mechanisms", ",", "phenotypic", "basis", ",", "and", "investigation", "of", "therapeutic", "approaches", "for", "PWS", ".", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 6, 6, 6, 0, 3, 4, 4, 4, 0, 3, 0, 0, 3, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0 ]
10434119	[ "Linkage", "analysis", "of", "5", "novel", "van", "der", "Woude", "syndrome", "kindreds", "to", "1q32", "-", "q41", "markers", "further", "supports", "locus", "homogeneity", "of", "the", "disease", "trait", ".", "van", "der", "Woude", "syndrome", "(", "vWS", ",", "MIM", "119300", ")", "is", "a", "rare", "autosomal", "dominant", "clefting", "condition", "with", "cardinal", "features", "of", "mucous", "cysts", "(", "lower", "-", "lip", "pits", ")", "and", "clefts", "to", "the", "lip", "and", "/", "or", "palate", ".", "The", "vWS", "gene", "has", "been", "assigned", "to", "a", "locus", "in", "1q32", "-", "q41", "by", "linkage", "analysis", "and", "physical", "mapping", ".", "We", "have", "investigated", "5", "novel", "vWS", "families", "through", "probands", "attended", "for", "cleft", "lip", "and", "/", "or", "palate", "repair", "at", "the", "Department", "of", "Maxillofacial", "Surgery", "of", "Hopital", "Trousseau", ",", "Paris", ",", "in", "order", "to", "tentatively", "refine", "the", "genetic", "map", "of", "the", "vWS", "region", "in", "1q32", "-", "q41", "and", "possibly", "identify", "unlinked", "pedigrees", ".", "Linkage", "analysis", "was", "carried", "out", "to", "6", "microsatellite", "markers", "(", "D1S249", ",", "D1S425", ",", "D1S491", ",", "D1S205", ",", "D1S414", ",", "D1S425", ")", ",", "yielding", "a", "maximum", "cumulative", "LOD", "score", "of", "Z", "=", "3", ".", "27", "at", "theta", "=", "0", ".", "00", "for", "D1S245", ".", "The", "innermost", "four", "markers", "were", "found", "to", "be", "tightly", "linked", "to", "one", "another", ",", "with", "no", "evidence", "for", "recombination", ".", "Our", "results", "support", "linkage", "of", "vWS", "within", "a", "region", "of", "tightly", "linked", "markers", "and", "do", "not", "favour", "locus", "heterogeneity", "of", "the", "disease", "trait", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 8, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 3, 4, 4, 4, 0, 0, 5, 6, 6, 6, 6, 6, 6, 6, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 8, 8, 8, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
10441329	[ "Null", "mutation", "of", "the", "murine", "ATP7B", "(", "Wilson", "disease", ")", "gene", "results", "in", "intracellular", "copper", "accumulation", "and", "late", "-", "onset", "hepatic", "nodular", "transformation", ".", "The", "Atp7b", "protein", "is", "a", "copper", "-", "transporting", "ATPase", "expressed", "predominantly", "in", "the", "liver", "and", "to", "a", "lesser", "extent", "in", "most", "other", "tissues", ".", "Mutations", "in", "the", "ATP7B", "gene", "lead", "to", "Wilson", "disease", ",", "a", "copper", "toxicity", "disorder", "characterized", "by", "dramatic", "build", "-", "up", "of", "intracellular", "hepatic", "copper", "with", "subsequent", "hepatic", "and", "neuro", "-", "logical", "abnormalities", ".", "Using", "homologous", "recombination", "to", "disrupt", "the", "normal", "translation", "of", "ATP7B", ",", "we", "have", "generated", "a", "strain", "of", "mice", "that", "are", "homozygous", "mutants", "(", ")", "for", "the", "Wilson", "disease", "gene", ".", "The", "ATP7B", "mice", "display", "a", "gradual", "accumulation", "of", "hepatic", "copper", "that", "increases", "to", "a", "level", "60", "-", "fold", "greater", "than", "normal", "by", "5", "months", "of", "age", ".", "An", "increase", "in", "copper", "concentration", "was", "also", "observed", "in", "the", "kidney", ",", "brain", ",", "placenta", "and", "lactating", "mammary", "glands", "of", "homo", "-", "zygous", "mutants", ",", "although", "milk", "from", "the", "mutant", "glands", "was", "copper", "deficient", ".", "Morphological", "abnormalities", "resembling", "cirrhosis", "developed", "in", "the", "majority", "of", "the", "livers", "from", "homozygous", "mutants", "older", "than", "7", "months", "of", "age", ".", "Progeny", "of", "the", "homozygous", "mutant", "females", "demonstrated", "neurological", "abnormalities", "and", "growth", "retardation", "characteristic", "of", "copper", "deficiency", ".", "Copper", "concentration", "in", "the", "livers", "of", "the", "newborn", "homozygous", "mutants", "was", "decreased", "dramatically", ".", "In", "summary", ",", "inactivation", "of", "the", "murine", "ATP7B", "gene", "produces", "a", "form", "of", "cirrhotic", "liver", "disease", "that", "resembles", "Wilson", "disease", "in", "humans", "and", "the", "toxic", "milk", "phenotype", "in", "the", "mouse", ".", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 1, 2, 2, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 6, 6, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 1, 2, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 1, 2, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
10441343	[ "French", "Machado", "-", "Joseph", "disease", "patients", "do", "not", "exhibit", "gametic", "segregation", "distortion", ":", "a", "sperm", "typing", "analysis", ".", "Segregation", "distortion", "has", "been", "reported", "to", "occur", "in", "a", "number", "of", "the", "trinucleotide", "repeat", "disorders", ".", "On", "the", "basis", "of", "a", "sperm", "typing", "study", "performed", "in", "patients", "of", "Japanese", "descent", "with", "Machado", "-", "Joseph", "disease", "(", "MJD", ")", ",", "it", "was", "reported", "that", "disease", "alleles", "are", "preferentially", "transmitted", "during", "meiosis", ".", "We", "performed", "a", "sperm", "typing", "study", "of", "five", "MJD", "patients", "of", "French", "descent", "and", "analysis", "of", "the", "pooled", "data", "shows", "a", "ratio", "of", "mutant", "to", "normal", "alleles", "of", "379", "436", "(", "46", ".", "5", "53", ".", "5", "%", ")", ",", "which", "does", "not", "support", "meiotic", "segregation", "distortion", ".", "To", "confirm", "these", "results", ",", "sperm", "typing", "analysis", "was", "also", "performed", "using", "a", "polymorphic", "marker", ",", "D14S1050", ",", "closely", "linked", "to", "the", "MJD1", "gene", ".", "Among", "910", "sperm", "analyzed", ",", "the", "allele", "linked", "to", "the", "disease", "chromosome", "was", "detected", "in", "50", ".", "3", "%", "of", "the", "samples", "and", "the", "allele", "linked", "to", "the", "normal", "chromosome", "was", "found", "in", "49", ".", "6", "%", "of", "the", "sperm", ".", "The", "difference", "in", "frequency", "of", "these", "two", "alleles", "is", "not", "significant", "(", "P", "=", "0", ".", "8423", ")", ".", "Likelihood", "-", "based", "analysis", "of", "segregation", "distortion", "in", "the", "single", "sperm", "data", "using", "the", "SPERMSEG", "program", "also", "showed", "no", "support", "for", "segregation", "distortion", "at", "the", "gamete", "level", "in", "this", "patient", "population", ".", "The", "previous", "report", "on", "the", "Japanese", "patients", "also", "suggested", "that", "disease", "allele", "stability", "may", "be", "influenced", "by", "a", "trans", "effect", "of", "an", "intragenic", "polymorphism", "(", "987", "G", "/", "C", ")", "in", "the", "wild", "-", "type", "allele", ".", "All", "of", "the", "French", "patients", "were", "heterozygous", "for", "this", "polymorphism", ".", "However", ",", "analysis", "of", "the", "variance", "in", "repeat", "number", "in", "sperm", "from", "the", "French", "MJD", "patients", "overlapped", "significantly", "with", "the", "variance", "in", "repeat", "number", "observed", "in", "the", "C", "/", "C", "homozygous", "Japanese", "patients", "." ]	[ 0, 7, 8, 8, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
10441571	[ "Missense", "mutation", "in", "the", "alternative", "splice", "region", "of", "the", "PAX6", "gene", "in", "eye", "anomalies", ".", "The", "PAX6", "gene", "is", "involved", "in", "ocular", "morphogenesis", ",", "and", "PAX6", "mutations", "have", "been", "detected", "in", "various", "types", "of", "ocular", "anomalies", ",", "including", "aniridia", ",", "Peters", "anomaly", ",", "corneal", "dystrophy", ",", "congenital", "cataract", ",", "and", "foveal", "hypoplasia", ".", "The", "gene", "encodes", "a", "transcriptional", "regulator", "that", "recognizes", "target", "genes", "through", "its", "paired", "-", "type", "DNA", "-", "binding", "domain", ".", "The", "paired", "domain", "is", "composed", "of", "two", "distinct", "DNA", "-", "binding", "subdomains", ",", "the", "N", "-", "terminal", "subdomain", "(", "NTS", ")", "and", "the", "C", "-", "terminal", "subdomain", "(", "CTS", ")", ",", "which", "bind", "respective", "consensus", "DNA", "sequences", ".", "The", "human", "PAX6", "gene", "produces", "two", "alternative", "splice", "isoforms", "that", "have", "the", "distinct", "structure", "of", "the", "paired", "domain", ".", "The", "insertion", ",", "into", "the", "NTS", ",", "of", "14", "additional", "amino", "acids", "encoded", "by", "exon", "5a", "abolishes", "the", "DNA", "-", "binding", "activity", "of", "the", "NTS", "and", "unmasks", "the", "DNA", "-", "binding", "ability", "of", "the", "CTS", ".", "Thus", ",", "exon", "5a", "appears", "to", "function", "as", "a", "molecular", "switch", "that", "specifies", "target", "genes", ".", "We", "ascertained", "a", "novel", "missense", "mutation", "in", "four", "pedigrees", "with", "Peters", "anomaly", ",", "congenital", "cataract", ",", "Axenfeldt", "anomaly", ",", "and", "/", "or", "foveal", "hypoplasia", ",", "which", ",", "to", "our", "knowledge", ",", "is", "the", "first", "mutation", "identified", "in", "the", "splice", "-", "variant", "region", ".", "A", "T", "-", "-", ">", "A", "transition", "at", "the", "20th", "nucleotide", "position", "of", "exon", "5a", "results", "in", "a", "Val", "-", "-", ">", "Asp", "(", "GTC", "-", "-", ">", "GAC", ")", "substitution", "at", "the", "7th", "codon", "of", "the", "alternative", "splice", "region", ".", "Functional", "analyses", "demonstrated", "that", "the", "V54D", "mutation", "slightly", "increased", "NTS", "binding", "and", "decreased", "CTS", "transactivation", "activity", "to", "almost", "half", ".", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 3, 0, 3, 4, 0, 3, 4, 0, 3, 4, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 3, 4, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
10441573	[ "Penetrances", "of", "BRCA1", "1675delA", "and", "1135insA", "with", "respect", "to", "breast", "cancer", "and", "ovarian", "cancer", ".", "For", "genetic", "counseling", "and", "predictive", "testing", "in", "families", "with", "inherited", "breast", "-", "ovarian", "cancer", ",", "penetrances", "and", "expressions", "of", "the", "underlying", "mutations", "should", "be", "known", ".", "We", "have", "previously", "reported", "two", "BRCA1", "founder", "mutations", "in", "the", "Norwegian", "population", ".", "Index", "cases", "for", "the", "present", "study", "were", "found", "two", "different", "ways", "through", "a", "series", "of", "consecutive", "ovarian", "cancers", "(", "n", "=", "16", ")", "and", "through", "our", "family", "cancer", "clinic", "(", "n", "=", "14", ")", ".", "Altogether", ",", "20", "of", "the", "patients", "had", "BRCA1", "1675delA", ",", "and", "10", "had", "1135insA", ".", "Their", "relatives", "were", "described", "with", "respect", "to", "absence", "/", "presence", "of", "breast", "and", "/", "or", "ovarian", "cancer", ".", "Of", "133", "living", "female", "relatives", ",", "83", "(", "62", "%", ")", "were", "tested", "for", "the", "presence", "of", "a", "mutation", ".", "No", "difference", ",", "in", "penetrance", "and", "expression", ",", "between", "the", "two", "mutations", "were", "found", ",", "whereas", "differences", "according", "to", "method", "of", "ascertainment", "were", "seen", ".", "The", "overall", "findings", "were", "that", "disease", "started", "to", "occur", "at", "age", "30", "years", "and", "that", "by", "age", "50", "years", "48", "%", "of", "the", "mutation", "-", "carrying", "women", "had", "experienced", "breast", "and", "/", "or", "ovarian", "cancer", ".", "More", "ovarian", "cancers", "than", "breast", "cancers", "were", "recorded", ".", "Both", "penetrance", "and", "expression", "(", "breast", "cancer", "vs", ".", "ovarian", "cancer", ")", "were", "different", "from", "those", "in", "reports", "of", "the", "Ashkenazi", "founder", "mutations", ".", "Whether", "the", "reported", "differences", "reflect", "true", "differences", "and", "/", "or", "methodological", "problems", "is", "discussed", ".", "An", "observed", "excess", "of", "mutation", "carriers", "could", "not", "be", "accounted", "for", "by", "methodological", "problems", ";", "possible", "explanations", "were", "a", "\"", "true", "\"", "low", "penetrance", "or", "preferential", "segregation", ".", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 6, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 6, 6, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 6, 6, 6, 0, 0, 3, 4, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
10446987	[ "The", "dermatofibrosarcoma", "protuberans", "-", "associated", "collagen", "type", "Ialpha1", "/", "platelet", "-", "derived", "growth", "factor", "(", "PDGF", ")", "B", "-", "chain", "fusion", "gene", "generates", "a", "transforming", "protein", "that", "is", "processed", "to", "functional", "PDGF", "-", "BB", ".", "Dermatofibrosarcoma", "protuberans", "(", "DFSP", ")", "displays", "chromosomal", "rearrangements", "involving", "chromosome", "17", "and", "22", ",", "which", "fuse", "the", "collagen", "type", "Ialpha1", "(", "COLIA1", ")", "gene", "to", "the", "platelet", "-", "derived", "growth", "factor", "(", "PDGF", ")", "B", "-", "chain", "(", "PDGFB", ")", "gene", ".", "To", "characterize", "the", "functional", "and", "structural", "properties", "of", "the", "COLIA1", "/", "PDGFB", "fusion", "protein", ",", "we", "generated", "a", "stable", "NIH3T3", "cell", "line", "that", "contained", "a", "tumor", "-", "derived", "chimeric", "gene", "resulting", "from", "a", "COIA1", "intron", "7", "-", "PDGFB", "intron", "1", "fusion", ".", "Expression", "of", "the", "fusion", "protein", "led", "to", "morphological", "transformation", "and", "increased", "growth", "rate", "of", "these", "cells", ".", "The", "PDGF", "receptor", "kinase", "inhibitor", "CGP57148B", "reversed", "the", "transformed", "phenotype", "and", "reduced", "the", "growth", "rate", "of", "COLIA1", "/", "PDGFB", "-", "expressing", "cells", "but", "had", "no", "effects", "on", "control", "cells", ".", "The", "presence", "of", "dimeric", "COLIA1", "/", "PDGFB", "precursors", "was", "demonstrated", "through", "PDGFB", "immunoprecipitations", "of", "metabolically", "labeled", "cells", "and", "also", "by", "PDGFB", "immunoprecipitations", "followed", "by", "immunoblotting", "with", "COLIA1", "antibodies", ".", "Pulse", "-", "chase", "studies", "demonstrated", "that", "the", "COLIA1", "/", "PDGFB", "precursor", "was", "processed", "to", "an", "end", "product", "that", "was", "indistinguishable", "from", "wild", "-", "type", "PDGF", "-", "BB", ".", "Finally", ",", "COLIA1", "/", "PDGFB", "-", "expressing", "cells", "generated", "tumors", "after", "s", ".", "c", "c", ".", "injection", "into", "nude", "mice", ",", "and", "tumor", "growth", "was", "reduced", "by", "treatment", "with", "CGP57148B", ".", "We", "conclude", "that", "the", "COLIA1", "/", "PDGFB", "fusion", "associated", "with", "DFSP", "contributes", "to", "tumor", "development", "through", "ectopic", "production", "of", "PDGF", "-", "BB", "and", "the", "formation", "of", "an", "autocrine", "loop", ".", "Our", "findings", ",", "thus", ",", "suggest", "that", "PDGF", "receptors", "could", "be", "a", "target", "for", "pharmacological", "treatment", "of", "DFSP", "and", "giant", "cell", "fibroblastoma", ",", "e", ".", "g", ".", ",", "through", "the", "use", "of", "PDGF", "receptor", "kinase", "inhibitors", "such", "as", "CGP57148B", "." ]	[ 0, 7, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
10447258	[ "Identification", "of", "a", "common", "PEX1", "mutation", "in", "Zellweger", "syndrome", ".", "The", "Zellweger", "spectrum", "of", "disease", ",", "encompassing", "Zellweger", "syndrome", "and", "the", "progressively", "milder", "phenotypes", "of", "neonatal", "adrenoleukodystrophy", "and", "infantile", "Refsum", "disease", ",", "is", "due", "to", "a", "failure", "to", "form", "functional", "peroxisomes", ".", "Cell", "fusion", "complementation", "studies", "demonstrated", "that", "these", "diseases", "are", "genetically", "heterogeneous", ",", "with", "two", "-", "thirds", "of", "all", "patients", "lying", "within", "a", "single", "complementation", "group", ",", "CG1", ".", "Molecular", "genetic", "and", "cell", "biology", "studies", "have", "shown", "that", "PEX1", "is", "deficient", "in", "many", "CG1", "patients", ".", "However", ",", "previous", "studies", "have", "focused", "on", "mildly", "affected", "patients", "and", "there", "is", "still", "no", "report", "of", "two", "mutant", "PEX1", "alleles", "in", "any", "Zellweger", "syndrome", "patient", ".", "Furthermore", ",", "mutations", "in", "the", "PMP70", "gene", "have", "also", "been", "identified", "in", "two", "Zellweger", "syndrome", "patients", "from", "CG1", ",", "raising", "the", "possibility", "that", "CG1", "patients", "may", "represent", "a", "mixture", "of", "PEX1", "-", "deficient", "and", "PMP70", "-", "deficient", "individuals", ".", "To", "address", "the", "molecular", "basis", "of", "disease", "in", "Zellweger", "syndrome", "patients", "from", "CG1", ",", "we", "examined", "all", "24", "PEX1", "exons", "in", "four", "patients", ",", "including", "both", "patients", "that", "have", "mutations", "in", "PMP70", ".", "PEX1", "mutations", "were", "detected", "in", "all", "four", "patients", ",", "including", "a", "1", "-", "bp", "insertion", "(", "c", ".", "2097insT", ")", "in", "exon", "13", "that", "was", "present", "in", "three", "of", "the", "four", "patients", ".", "Subsequent", "studies", "demonstrated", "that", "this", "mutation", "is", "present", "in", "one", "-", "half", "of", "all", "CG1", "patients", "and", "correlates", "with", "the", "Zellweger", "syndrome", "phenotype", ".", "As", "this", "mutation", "leads", "to", "a", "loss", "of", "protein", "function", "its", "frequency", "makes", "it", "the", "most", "common", "cause", "of", "Zellweger", "syndrome", ",", "helping", "to", "explain", "the", "high", "percentage", "of", "patients", "that", "belong", "to", "CG1", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
10447259	[ "Novel", "mutations", "in", "the", "Wiskott", "-", "Aldrich", "syndrome", "protein", "gene", "and", "their", "effects", "on", "transcriptional", ",", "translational", ",", "and", "clinical", "phenotypes", ".", "Wiskott", "-", "Aldrich", "syndrome", "(", "WAS", ")", "is", "an", "X", "-", "linked", "recessive", "immunodeficiency", "characterized", "by", "thrombocytopenia", ",", "eczema", ",", "and", "recurrent", "infections", ",", "and", "caused", "by", "mutations", "in", "the", "WAS", "protein", "(", "WASP", ")", "gene", ".", "WASP", "contains", "several", "functional", "domains", "through", "which", "it", "interacts", "with", "proteins", "involved", "in", "intracellular", "signaling", "and", "regulation", "of", "the", "actin", "cytoskeleton", ".", "In", "this", "report", ",", "17", "WASP", "gene", "mutations", "were", "identified", ",", "12", "of", "which", "are", "novel", ".", "DNA", "of", "affected", "males", "and", "obligate", "carriers", "was", "PCR", "amplified", "and", "analyzed", "by", "SSCA", ",", "heteroduplex", "analysis", ",", "and", "direct", "sequencing", ".", "The", "effects", "of", "the", "mutations", "at", "the", "mRNA", "and", "protein", "level", "were", "ascertained", "by", "RT", "-", "PCR", "and", "Western", "blot", "analyses", ".", "All", "missense", "mutations", "were", "located", "in", "exons", "1", "-", "4", ".", "Most", "of", "the", "nonsense", ",", "frameshift", "and", "splice", "site", "mutations", "were", "found", "in", "exons", "6", "-", "11", ".", "Mutations", "that", "alter", "splice", "sites", "led", "to", "the", "synthesis", "of", "several", "types", "of", "mRNAs", ",", "a", "fraction", "of", "which", "represented", "the", "normally", "spliced", "product", ".", "The", "presence", "of", "normally", "spliced", "transcripts", "was", "correlated", "with", "a", "milder", "phenotype", ".", "When", "one", "such", "case", "was", "studied", "by", "Western", "blotting", ",", "reduced", "amounts", "of", "normal", "-", "size", "WASP", "were", "present", ".", "In", "other", "cases", "as", "well", ",", "a", "correlation", "was", "found", "between", "the", "amount", "of", "normal", "or", "mutant", "WASP", "present", "and", "the", "phenotypes", "of", "the", "affected", "individuals", ".", "No", "protein", "was", "detected", "in", "two", "individuals", "with", "severe", "WAS", ".", "Reduced", "levels", "of", "a", "normal", "-", "size", "WASP", "with", "a", "missense", "mutation", "were", "seen", "in", "two", "individuals", "with", "XLT", ".", "It", "is", "concluded", "that", "mutation", "analysis", "at", "the", "DNA", "level", "is", "not", "sufficient", "for", "predicting", "clinical", "course", ".", "Studies", "at", "the", "transcript", "and", "protein", "level", "are", "needed", "for", "a", "better", "assessment", ".", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 7, 8, 8, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 2, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

10021369

[ "Identification", "of", "APC2", ",", "a", "homologue", "of", "the", "adenomatous", "polyposis", "coli", "tumour", "suppressor", ".", "The", "adenomatous", "polyposis", "coli", "(", "APC", ")", "tumour", "-", "suppressor", "protein", "controls", "the", "Wnt", "signalling", "pathway", "by", "forming", "a", "complex", "with", "glycogen", "synthase", "kinase", "3beta", "(", "GSK", "-", "3beta", ")", ",", "axin", "/", "conductin", "and", "betacatenin", ".", "Complex", "formation", "induces", "the", "rapid", "degradation", "of", "betacatenin", ".", "In", "colon", "carcinoma", "cells", ",", "loss", "of", "APC", "leads", "to", "the", "accumulation", "of", "betacatenin", "in", "the", "nucleus", ",", "where", "it", "binds", "to", "and", "activates", "the", "Tcf", "-", "4", "transcription", "factor", "(", "reviewed", "in", "[", "1", "]", "[", "2", "]", ")", ".", "Here", ",", "we", "report", "the", "identification", "and", "genomic", "structure", "of", "APC", "homologues", ".", "Mammalian", "APC2", ",", "which", "closely", "resembles", "APC", "in", "overall", "domain", "structure", ",", "was", "functionally", "analyzed", "and", "shown", "to", "contain", "two", "SAMP", "domains", ",", "both", "of", "which", "are", "required", "for", "binding", "to", "conductin", ".", "Like", "APC", ",", "APC2", "regulates", "the", "formation", "of", "active", "betacatenin", "-", "Tcf", "complexes", ",", "as", "demonstrated", "using", "transient", "transcriptional", "activation", "assays", "in", "APC", "-", "/", "-", "colon", "carcinoma", "cells", ".", "Human", "APC2", "maps", "to", "chromosome", "19p13", ".", "3", ".", "APC", "and", "APC2", "may", "therefore", "have", "comparable", "functions", "in", "development", "and", "cancer", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 8, 8, 0, 0, 0, 7, 8, 8, 8, 8, 8, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0 ]

10051005

[ "A", "common", "MSH2", "mutation", "in", "English", "and", "North", "American", "HNPCC", "families", ":", "origin", ",", "phenotypic", "expression", ",", "and", "sex", "specific", "differences", "in", "colorectal", "cancer", ".", "The", "frequency", ",", "origin", ",", "and", "phenotypic", "expression", "of", "a", "germline", "MSH2", "gene", "mutation", "previously", "identified", "in", "seven", "kindreds", "with", "hereditary", "non", "-", "polyposis", "cancer", "syndrome", "(", "HNPCC", ")", "was", "investigated", ".", "The", "mutation", "(", "A", "-", "-", ">", "T", "at", "nt943", "+", "3", ")", "disrupts", "the", "3", "splice", "site", "of", "exon", "5", "leading", "to", "the", "deletion", "of", "this", "exon", "from", "MSH2", "mRNA", "and", "represents", "the", "only", "frequent", "MSH2", "mutation", "so", "far", "reported", ".", "Although", "this", "mutation", "was", "initially", "detected", "in", "four", "of", "33", "colorectal", "cancer", "families", "analysed", "from", "eastern", "England", ",", "more", "extensive", "analysis", "has", "reduced", "the", "frequency", "to", "four", "of", "52", "(", "8", "%", ")", "English", "HNPCC", "kindreds", "analysed", ".", "In", "contrast", ",", "the", "MSH2", "mutation", "was", "identified", "in", "10", "of", "20", "(", "50", "%", ")", "separately", "identified", "colorectal", "families", "from", "Newfoundland", ".", "To", "investigate", "the", "origin", "of", "this", "mutation", "in", "colorectal", "cancer", "families", "from", "England", "(", "n", "=", "4", ")", ",", "Newfoundland", "(", "n", "=", "10", ")", ",", "and", "the", "United", "States", "(", "n", "=", "3", ")", ",", "haplotype", "analysis", "using", "microsatellite", "markers", "linked", "to", "MSH2", "was", "performed", ".", "Within", "the", "English", "and", "US", "families", "there", "was", "little", "evidence", "for", "a", "recent", "common", "origin", "of", "the", "MSH2", "splice", "site", "mutation", "in", "most", "families", ".", "In", "contrast", ",", "a", "common", "haplotype", "was", "identified", "at", "the", "two", "flanking", "markers", "(", "CA5", "and", "D2S288", ")", "in", "eight", "of", "the", "Newfoundland", "families", ".", "These", "findings", "suggested", "a", "founder", "effect", "within", "Newfoundland", "similar", "to", "that", "reported", "by", "others", "for", "two", "MLH1", "mutations", "in", "Finnish", "HNPCC", "families", ".", "We", "calculated", "age", "related", "risks", "of", "all", ",", "colorectal", ",", "endometrial", ",", "and", "ovarian", "cancers", "in", "nt943", "+", "3", "A", "-", "-", ">", "T", "MSH2", "mutation", "carriers", "(", "n", "=", "76", ")", "for", "all", "patients", "and", "for", "men", "and", "women", "separately", ".", "For", "both", "sexes", "combined", ",", "the", "penetrances", "at", "age", "60", "years", "for", "all", "cancers", "and", "for", "colorectal", "cancer", "were", "0", ".", "86", "and", "0", ".", "57", ",", "respectively", ".", "The", "risk", "of", "colorectal", "cancer", "was", "significantly", "higher", "(", "p", "<", "0", ".", "01", ")", "in", "males", "than", "females", "(", "0", ".", "63", "v", "0", ".", "30", "and", "0", ".", "84", "v", "0", ".", "44", "at", "ages", "50", "and", "60", "years", ",", "respectively", ")", ".", "For", "females", "there", "was", "a", "high", "risk", "of", "endometrial", "cancer", "(", "0", ".", "5", "at", "age", "60", "years", ")", "and", "premenopausal", "ovarian", "cancer", "(", "0", ".", "2", "at", "50", "years", ")", ".", "These", "intersex", "differences", "in", "colorectal", "cancer", "risks", "have", "implications", "for", "screening", "programmes", "and", "for", "attempts", "to", "identify", "colorectal", "cancer", "susceptibility", "modifiers", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 4, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 6, 6, 6, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 0, 0, 0 ]

10051007

[ "Age", "of", "onset", "in", "Huntington", "disease", ":", "sex", "specific", "influence", "of", "apolipoprotein", "E", "genotype", "and", "normal", "CAG", "repeat", "length", ".", "Age", "of", "onset", "(", "AO", ")", "of", "Huntington", "disease", "(", "HD", ")", "is", "known", "to", "be", "correlated", "with", "the", "length", "of", "an", "expanded", "CAG", "repeat", "in", "the", "HD", "gene", ".", "Apolipoprotein", "E", "(", "APOE", ")", "genotype", ",", "in", "turn", ",", "is", "known", "to", "influence", "AO", "in", "Alzheimer", "disease", ",", "rendering", "the", "APOE", "gene", "a", "likely", "candidate", "to", "affect", "AO", "in", "other", "neurological", "diseases", "too", ".", "We", "therefore", "determined", "APOE", "genotype", "and", "normal", "CAG", "repeat", "length", "in", "the", "HD", "gene", "for", "138", "HD", "patients", "who", "were", "previously", "analysed", "with", "respect", "to", "CAG", "repeat", "length", ".", "Genotyping", "for", "APOE", "was", "performed", "blind", "to", "clinical", "information", ".", "In", "addition", "to", "highlighting", "the", "effect", "of", "the", "normal", "repeat", "length", "upon", "AO", "in", "maternally", "inherited", "HD", "and", "in", "male", "patients", ",", "we", "show", "that", "the", "APOE", "epsilon2epsilon3", "genotype", "is", "associated", "with", "significantly", "earlier", "AO", "in", "males", "than", "in", "females", ".", "Such", "a", "sex", "difference", "in", "AO", "was", "not", "apparent", "for", "any", "of", "the", "other", "APOE", "genotypes", ".", "Our", "findings", "suggest", "that", "subtle", "differences", "in", "the", "course", "of", "the", "neurodegeneration", "in", "HD", "may", "allow", "interacting", "genes", "to", "exert", "gender", "specific", "effects", "upon", "AO", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

100562

[ "Familial", "deficiency", "of", "the", "seventh", "component", "of", "complement", "associated", "with", "recurrent", "bacteremic", "infections", "due", "to", "Neisseria", ".", "The", "serum", "of", "a", "29", "-", "year", "old", "woman", "with", "a", "recent", "episode", "of", "disseminated", "gonococcal", "infection", "and", "a", "history", "of", "meningococcal", "meningitis", "and", "arthritis", "as", "a", "child", "was", "found", "to", "lack", "serum", "hemolytic", "complement", "activity", ".", "The", "seventh", "component", "of", "complement", "(", "C7", ")", "was", "not", "detected", "by", "functional", "or", "immunochemical", "assays", ",", "whereas", "other", "components", "were", "normal", "by", "hemolytic", "and", "immunochemical", "assessment", ".", "Her", "fresh", "serum", "lacked", "complement", "-", "mediated", "bactericidal", "activity", "against", "Neisseria", "gonorrhoeae", ",", "but", "the", "addition", "of", "fresh", "normal", "serum", "or", "purified", "C7", "restored", "bactericidal", "activity", "as", "well", "as", "hemolytic", "activity", ".", "The", "absence", "of", "functional", "C7", "activity", "could", "not", "be", "accounted", "for", "on", "the", "basis", "of", "an", "inhibitor", ".", "Opsonization", "and", "generation", "of", "chemotactic", "activity", "functioned", "normally", ".", "Complete", "absence", "of", "C7", "was", "also", "found", "in", "one", "sibling", "who", "had", "the", "clinical", "syndrome", "of", "meningococcal", "meningitis", "and", "arthritis", "as", "a", "child", "and", "in", "this", "siblings", "clinically", "well", "eight", "-", "year", "-", "old", "son", ".", "HLA", "histocompatibility", "typing", "of", "the", "family", "members", "did", "not", "demonstrate", "evidence", "for", "genetic", "linkage", "of", "C7", "deficiency", "with", "the", "major", "histocompatibility", "loci", ".", "This", "report", "represents", "the", "first", "cases", "of", "C7", "deficiency", "associated", "with", "infectious", "complications", "and", "suggests", "that", "bactericidal", "activity", "may", "be", "important", "in", "host", "defense", "against", "bacteremic", "neisseria", "infections", "." ]

[ 3, 4, 4, 4, 4, 4, 4, 4, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 8, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0 ]

10064668

[ "Increased", "incidence", "of", "cancer", "in", "patients", "with", "cartilage", "-", "hair", "hypoplasia", ".", "OBJECTIVE", "Previous", "reports", "have", "suggested", "an", "increased", "risk", "of", "cancer", "among", "patients", "with", "cartilage", "-", "hair", "hypoplasia", "(", "CHH", ")", ".", "This", "study", "was", "carried", "out", "to", "further", "evaluate", "this", "risk", "among", "patients", "with", "CHH", "and", "their", "first", "-", "degree", "relatives", ".", "STUDY", "DESIGN", "One", "hundred", "twenty", "-", "two", "patients", "with", "CHH", "were", "identified", "through", "2", "countrywide", "epidemiologic", "surveys", "in", "1974", "and", "in", "1986", ".", "Their", "parents", "and", "nonaffected", "siblings", "were", "identified", "through", "the", "Population", "Register", "Center", ".", "This", "cohort", "underwent", "follow", "-", "up", "for", "cancer", "incidence", "through", "the", "Finnish", "Cancer", "Registry", "to", "the", "end", "of", "1995", ".", "RESULTS", "A", "statistically", "significant", "excess", "risk", "of", "cancer", "was", "seen", "among", "the", "patients", "with", "CHH", "(", "standardized", "incidence", "ratio", "6", ".", "9", ",", "95", "%", "confidence", "interval", "2", ".", "3", "to", "16", ")", ",", "which", "was", "mainly", "attributable", "to", "non", "-", "Hodgkins", "lymphoma", "(", "standardized", "incidence", "ratio", "90", ",", "95", "%", "confidence", "interval", "18", "to", "264", ")", ".", "In", "addition", ",", "a", "significant", "excess", "risk", "of", "basal", "cell", "carcinoma", "was", "seen", "(", "standardized", "incidence", "ratio", "35", ",", "95", "%", "confidence", "interval", "7", ".", "2", "to", "102", ")", ".", "The", "cancer", "incidence", "among", "the", "siblings", "or", "the", "parents", "did", "not", "differ", "from", "the", "average", "cancer", "incidence", "in", "the", "Finnish", "population", ".", "CONCLUSIONS", "This", "study", "confirms", "an", "increased", "risk", "of", "cancer", ",", "especially", "non", "-", "Hodgkins", "lymphoma", ",", "probably", "attributable", "to", "defective", "immunity", ",", "among", "patients", "with", "CHH", "." ]

[ 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0 ]

10071185

[ "Genotype", "and", "phenotype", "in", "patients", "with", "dihydropyrimidine", "dehydrogenase", "deficiency", ".", "Dihydropyrimidine", "dehydrogenase", "(", "DPD", ")", "deficiency", "is", "an", "autosomal", "recessive", "disease", "characterised", "by", "thymine", "-", "uraciluria", "in", "homozygous", "deficient", "patients", "and", "has", "been", "associated", "with", "a", "variable", "clinical", "phenotype", ".", "In", "order", "to", "understand", "the", "genetic", "and", "phenotypic", "basis", "for", "DPD", "deficiency", ",", "we", "have", "reviewed", "17", "families", "presenting", "22", "patients", "with", "complete", "deficiency", "of", "DPD", ".", "In", "this", "group", "of", "patients", ",", "7", "different", "mutations", "have", "been", "identified", ",", "including", "2", "deletions", "[", "295", "-", "298delTCAT", ",", "1897delC", "]", ",", "1", "splice", "-", "site", "mutation", "[", "IVS14", "+", "1G", ">", "A", ")", "]", "and", "4", "missense", "mutations", "(", "85T", ">", "C", ",", "703C", ">", "T", ",", "2658G", ">", "A", ",", "2983G", ">", "T", ")", ".", "Analysis", "of", "the", "prevalence", "of", "the", "various", "mutations", "among", "DPD", "patients", "has", "shown", "that", "the", "G", "-", "-", ">", "A", "point", "mutation", "in", "the", "invariant", "splice", "donor", "site", "is", "by", "far", "the", "most", "common", "(", "52", "%", ")", ",", "whereas", "the", "other", "six", "mutations", "are", "less", "frequently", "observed", ".", "A", "large", "phenotypic", "variability", "has", "been", "observed", ",", "with", "convulsive", "disorders", ",", "motor", "retardation", "and", "mental", "retardation", "being", "the", "most", "abundant", "manifestations", ".", "A", "clear", "correlation", "between", "the", "genotype", "and", "phenotype", "has", "not", "been", "established", ".", "An", "altered", "beta", "-", "alanine", ",", "uracil", "and", "thymine", "homeostasis", "might", "underlie", "the", "various", "clinical", "abnormalities", "encountered", "in", "patients", "with", "DPD", "deficiency", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 3, 4, 4, 4, 4, 4, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 1, 2, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0 ]

10071193

[ "Fibroblast", "growth", "factor", "homologous", "factor", "2", "(", "FHF2", ")", ":", "gene", "structure", ",", "expression", "and", "mapping", "to", "the", "Borjeson", "-", "Forssman", "-", "Lehmann", "syndrome", "region", "in", "Xq26", "delineated", "by", "a", "duplication", "breakpoint", "in", "a", "BFLS", "-", "like", "patient", ".", "Borjeson", "-", "Forssman", "-", "Lehmann", "syndrome", "(", "BFLS", ")", "is", "a", "syndromal", "X", "-", "linked", "mental", "retardation", ",", "which", "maps", "by", "linkage", "to", "the", "q26", "region", "of", "the", "human", "X", "chromosome", ".", "We", "have", "identified", "a", "male", "patient", "with", "BFLS", "-", "like", "features", "and", "a", "duplication", ",", "46", ",", "Y", ",", "dup", "(", "X", ")", "(", "q26q28", ")", ",", "inherited", "from", "his", "phenotypically", "normal", "mother", ".", "Fluorescence", "in", "situ", "hybridisation", "using", "yeast", "artificial", "chromosome", "clones", "from", "Xq26", "localised", "the", "duplication", "breakpoint", "to", "an", "approximately", "400", "-", "kb", "interval", "in", "the", "Xq26", ".", "3", "region", "between", "DXS155", "and", "DXS294", "/", "DXS730", ".", "Database", "searches", "and", "analysis", "of", "available", "genomic", "DNA", "sequence", "from", "the", "region", "revealed", "the", "presence", "of", "the", "fibroblast", "growth", "factor", "homologous", "factor", "gene", ",", "FHF2", ",", "within", "the", "duplication", "breakpoint", "interval", ".", "The", "gene", "structure", "of", "FHF2", "was", "determined", "and", "two", "new", "exons", "were", "identified", ",", "including", "a", "new", "5", "end", "exon", ",", "1B", ".", "FHF2", "is", "a", "large", "gene", "extending", "over", "approximately", "200", "kb", "in", "Xq26", ".", "3", "and", "is", "composed", "of", "at", "least", "seven", "exons", ".", "It", "shows", "tissue", "-", "specific", "alternative", "splicing", "and", "alternative", "transcription", "starts", ".", "Northern", "blot", "hybridisation", "showed", "highest", "expression", "in", "brain", "and", "skeletal", "muscle", ".", "The", "FHF2", "gene", "localisation", "and", "tissue", "-", "specific", "expression", "pattern", "suggest", "it", "to", "be", "a", "candidate", "gene", "for", "familial", "cases", "of", "the", "BFLS", "syndrome", "and", "other", "syndromal", "and", "non", "-", "specific", "forms", "of", "X", "-", "linked", "mental", "retardation", "mapping", "to", "the", "region", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 8, 8, 8, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 4, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0 ]

10072428

[ "Germline", "E", "-", "cadherin", "gene", "(", "CDH1", ")", "mutations", "predispose", "to", "familial", "gastric", "cancer", "and", "colorectal", "cancer", ".", "Inherited", "mutations", "in", "the", "E", "-", "cadherin", "gene", "(", "CDH1", ")", "were", "described", "recently", "in", "three", "Maori", "kindreds", "with", "familial", "gastric", "cancer", ".", "Familial", "gastric", "cancer", "is", "genetically", "heterogeneous", "and", "it", "is", "not", "clear", "what", "proportion", "of", "gastric", "cancer", "susceptibility", "in", "non", "-", "Maori", "populations", "is", "due", "to", "germline", "CDH1", "mutations", ".", "Therefore", ",", "we", "screened", "eight", "familial", "gastric", "cancer", "kindreds", "of", "British", "and", "Irish", "origin", "for", "germline", "CDH1", "mutations", ",", "by", "SSCP", "analysis", "of", "all", "16", "exons", "and", "flanking", "sequences", ".", "Each", "family", "contained", "(", "i", ")", "two", "cases", "of", "gastric", "cancer", "in", "first", "degree", "relatives", "with", "one", "affected", "before", "age", "50", "years", ";", "or", "(", "ii", ")", "three", "or", "more", "cases", "of", "gastric", "cancer", ".", "Novel", "germline", "CDH1", "mutations", "(", "a", "nonsense", "and", "a", "splice", "site", ")", "were", "detected", "in", "two", "families", "(", "25", "%", ")", ".", "Both", "mutations", "were", "predicted", "to", "truncate", "the", "E", "-", "cadherin", "protein", "in", "the", "signal", "peptide", "domain", ".", "In", "one", "family", "there", "was", "evidence", "of", "non", "-", "penetrance", "and", "susceptibility", "to", "both", "gastric", "and", "colorectal", "cancer", ";", "thus", ",", "in", "addition", "to", "six", "cases", "of", "gastric", "cancer", ",", "a", "CDH1", "mutation", "carrier", "developed", "colorectal", "cancer", "at", "age", "30", "years", ".", "We", "have", "confirmed", "that", "germline", "mutations", "in", "the", "CDH1", "gene", "cause", "familial", "gastric", "cancer", "in", "non", "-", "Maori", "populations", ".", "However", ",", "only", "a", "minority", "of", "familial", "gastric", "cancers", "can", "be", "accounted", "for", "by", "CDH1", "mutations", ".", "Loss", "of", "E", "-", "cadherin", "function", "has", "been", "implicated", "in", "the", "pathogenesis", "of", "sporadic", "colorectal", "and", "other", "cancers", ",", "and", "our", "findings", "provide", "evidence", "that", "germline", "CDH1", "mutations", "predispose", "to", "early", "onset", "colorectal", "cancer", ".", "Thus", ",", "CDH1", "should", "be", "investigated", "as", "a", "cause", "of", "inherited", "susceptibility", "to", "both", "gastric", "and", "colorectal", "cancers", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 6, 0 ]

10077614

[ "A", "zinc", "finger", "truncation", "of", "murine", "WT1", "results", "in", "the", "characteristic", "urogenital", "abnormalities", "of", "Denys", "-", "Drash", "syndrome", ".", "The", "Wilms", "tumor", "-", "suppressor", "gene", ",", "WT1", ",", "plays", "a", "key", "role", "in", "urogenital", "development", ",", "and", "WT1", "dysfunction", "is", "implicated", "in", "both", "neoplastic", "(", "Wilms", "tumor", ",", "mesothelioma", ",", "leukemias", ",", "and", "breast", "cancer", ")", "and", "nonneoplastic", "(", "glomerulosclerosis", ")", "disease", ".", "The", "analysis", "of", "diseases", "linked", "specifically", "with", "WT1", "mutations", ",", "such", "as", "Denys", "-", "Drash", "syndrome", "(", "DDS", ")", ",", "can", "provide", "valuable", "insight", "concerning", "the", "role", "of", "WT1", "in", "development", "and", "disease", ".", "DDS", "is", "a", "rare", "childhood", "disease", "characterized", "by", "a", "nephropathy", "involving", "mesangial", "sclerosis", ",", "XY", "pseudohermaphroditism", ",", "and", "/", "or", "Wilms", "tumor", "(", "WT", ")", ".", "DDS", "patients", "are", "constitutionally", "heterozygous", "for", "exonic", "point", "mutations", "in", "WT1", ",", "which", "include", "mutations", "predicted", "to", "truncate", "the", "protein", "within", "the", "C", "-", "terminal", "zinc", "finger", "(", "ZF", ")", "region", ".", "We", "report", "that", "heterozygosity", "for", "a", "targeted", "murine", "Wt1", "allele", ",", "Wt1", "(", "tmT396", ")", ",", "which", "truncates", "ZF3", "at", "codon", "396", ",", "induces", "mesangial", "sclerosis", "characteristic", "of", "DDS", "in", "adult", "heterozygous", "and", "chimeric", "mice", ".", "Male", "genital", "defects", "also", "were", "evident", "and", "there", "was", "a", "single", "case", "of", "Wilms", "tumor", "in", "which", "the", "transcript", "of", "the", "nontargeted", "allele", "showed", "an", "exon", "9", "skipping", "event", ",", "implying", "a", "causal", "link", "between", "Wt1", "dysfunction", "and", "Wilms", "tumorigenesis", "in", "mice", ".", "However", ",", "the", "mutant", "WT1", "(", "tmT396", ")", "protein", "accounted", "for", "only", "5", "%", "of", "WT1", "in", "both", "heterozygous", "embryonic", "stem", "cells", "and", "the", "WT", ".", "This", "has", "implications", "regarding", "the", "mechanism", "by", "which", "the", "mutant", "allele", "exerts", "its", "effect", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 3, 4, 4, 4, 0, 0, 7, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 3, 4, 0, 3, 0, 3, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 7, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 3, 4, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 3, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

10077651

[ "Mechanism", "of", "increased", "iron", "absorption", "in", "murine", "model", "of", "hereditary", "hemochromatosis", ":", "increased", "duodenal", "expression", "of", "the", "iron", "transporter", "DMT1", ".", "Hereditary", "hemochromatosis", "(", "HH", ")", "is", "a", "common", "autosomal", "recessive", "disorder", "characterized", "by", "tissue", "iron", "deposition", "secondary", "to", "excessive", "dietary", "iron", "absorption", ".", "We", "recently", "reported", "that", "HFE", ",", "the", "protein", "defective", "in", "HH", ",", "was", "physically", "associated", "with", "the", "transferrin", "receptor", "(", "TfR", ")", "in", "duodenal", "crypt", "cells", "and", "proposed", "that", "mutations", "in", "HFE", "attenuate", "the", "uptake", "of", "transferrin", "-", "bound", "iron", "from", "plasma", "by", "duodenal", "crypt", "cells", ",", "leading", "to", "up", "-", "regulation", "of", "transporters", "for", "dietary", "iron", ".", "Here", ",", "we", "tested", "the", "hypothesis", "that", "HFE", "-", "/", "-", "mice", "have", "increased", "duodenal", "expression", "of", "the", "divalent", "metal", "transporter", "(", "DMT1", ")", ".", "By", "4", "weeks", "of", "age", ",", "the", "HFE", "-", "/", "-", "mice", "demonstrated", "iron", "loading", "when", "compared", "with", "HFE", "+", "/", "+", "littermates", ",", "with", "elevated", "transferrin", "saturations", "(", "68", ".", "4", "%", "vs", ".", "49", ".", "8", "%", ")", "and", "elevated", "liver", "iron", "concentrations", "(", "985", "micrograms", "vs", ".", "381", "micrograms", ")", ".", "By", "using", "Northern", "blot", "analyses", ",", "we", "quantitated", "duodenal", "expression", "of", "both", "classes", "of", "DMT1", "transcripts", "one", "containing", "an", "iron", "responsive", "element", "(", "IRE", ")", ",", "called", "DMT1", "(", "IRE", ")", ",", "and", "one", "containing", "no", "IRE", ",", "called", "DMT1", "(", "non", "-", "IRE", ")", ".", "The", "positive", "control", "for", "DMT1", "up", "-", "regulation", "was", "a", "murine", "model", "of", "dietary", "iron", "deficiency", "that", "demonstrated", "greatly", "increased", "levels", "of", "duodenal", "DMT1", "(", "IRE", ")", "mRNA", ".", "HFE", "-", "/", "-", "mice", "also", "demonstrated", "an", "increase", "in", "duodenal", "DMT1", "(", "IRE", ")", "mRNA", "(", "average", "7", ".", "7", "-", "fold", ")", ",", "despite", "their", "elevated", "transferrin", "saturation", "and", "hepatic", "iron", "content", ".", "Duodenal", "expression", "of", "DMT1", "(", "non", "-", "IRE", ")", "was", "not", "increased", ",", "nor", "was", "hepatic", "expression", "of", "DMT1", "increased", ".", "These", "data", "support", "the", "model", "for", "HH", "in", "which", "HFE", "mutations", "lead", "to", "inappropriately", "low", "crypt", "cell", "iron", ",", "with", "resultant", "stabilization", "of", "DMT1", "(", "IRE", ")", "mRNA", ",", "up", "-", "regulation", "of", "DMT1", ",", "and", "increased", "absorption", "of", "dietary", "iron", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

10078732

[ "Neurophysiologic", "follow", "-", "up", "of", "long", "-", "term", "dietary", "treatment", "in", "adult", "-", "onset", "adrenoleukodystrophy", ".", "OBJECTIVE", "To", "monitor", "the", "effects", "of", "dietary", "treatment", "in", "adult", "-", "onset", "adrenoleukodystrophy", "(", "ALD", ")", "by", "means", "of", "somatosensory", "evoked", "potentials", "(", "SEPs", ")", "and", "motor", "evoked", "potentials", "(", "MEPs", ")", ".", "BACKGROUND", "SEPs", "and", "MEPs", "have", "proved", "useful", "in", "revealing", "signs", "of", "progressively", "severe", ",", "central", "dying", "-", "back", "axonopathy", "in", "early", "stages", "of", "adult", "-", "onset", "ALD", ".", "METHODS", "Eight", "patients", "with", "adult", "-", "onset", "ALD", "underwent", "clinical", "examination", ",", "brain", "and", "spine", "MRI", ",", "and", "SEP", "and", "MEP", "studies", "before", "and", "after", "3", "years", "of", "Lorenzos", "oil", "dietary", "therapy", ".", "RESULTS", "Before", "treatment", ",", "brain", "MRI", "was", "normal", "in", "five", "patients", ".", "Three", "of", "these", "patients", "had", "pure", "spinal", "SEP", "abnormalities", "and", "in", "the", "remaining", "two", "patients", "SEPs", "showed", "signs", "of", "involvement", "of", "both", "the", "spinal", "and", "cerebral", "somatosensory", "tracts", ".", "After", "treatment", ",", "the", "three", "patients", "with", "pure", "spinal", "abnormalities", "showed", "clinical", "and", "neurophysiologic", "worsening", ",", "whereas", "the", "two", "patients", "with", "a", "more", "advanced", "stage", "of", "disease", "(", "exhibited", "by", "SEPs", ")", "showed", "substantially", "unchanged", "clinical", "and", "neurophysiologic", "features", ".", "The", "patients", "with", "abnormal", "brain", "MRI", "at", "the", "onset", "of", "treatment", "showed", "clinical", "and", "neurophysiologic", "worsening", ".", "CONCLUSIONS", "Lorenzos", "oil", "therapy", "had", "no", "effect", "on", "patients", "with", "evidence", "of", "inflammatory", "brain", "lesions", ".", "Moreover", ",", "in", "patients", "without", "clear", "signs", "of", "inflammatory", "damage", ",", "this", "treatment", "does", "not", "modify", "significantly", "the", "natural", "course", "of", "the", "disease", ".", "However", ",", "because", "effective", "treatments", "should", "begin", "before", "the", "onset", "of", "severe", "neurologic", "symptoms", ",", "SEPs", "and", "MEPs", "should", "be", "considered", "to", "evaluate", "the", "effectiveness", "of", "other", "experimental", "treatments", "in", "the", "patient", "with", "a", "negative", "brain", "MRI", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

10078749

[ "GCH1", "mutation", "in", "a", "patient", "with", "adult", "-", "onset", "oromandibular", "dystonia", ".", "The", "authors", "report", "a", "mutation", "in", "exon", "5", "of", "GCH1", "in", "a", "patient", "with", "adult", "-", "onset", "oromandibular", "dystonia", "and", "no", "obvious", "family", "history", "of", "dystonia", ".", "The", "patient", "responded", "positively", "to", "treatment", "with", "L", "-", "dopa", ".", "These", "findings", "demonstrate", "that", "GCH1", "mutations", "must", "be", "considered", "even", "in", "patients", "with", "dystonic", "symptoms", "not", "typical", "of", "dopa", "-", "responsive", "dystonia", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 0 ]

10083733

[ "Germline", "mutations", "of", "the", "APC", "gene", "in", "Korean", "familial", "adenomatous", "polyposis", "patients", ".", "We", "extensively", "analyzed", "genomic", "DNA", "and", "messenger", "RNA", "(", "mRNA", ")", "from", "62", "unrelated", "Korean", "patients", "with", "familial", "adenomatous", "polyposis", "(", "FAP", ")", "for", "identification", "of", "germline", "adenomatous", "polyposis", "coli", "(", "APC", ")", "gene", "mutations", ".", "We", "adopted", "both", "single", "-", "strand", "conformation", "polymorphism", "(", "SSCP", ")", "analysis", "and", "a", "method", "of", "analysis", "involving", "the", "reverse", "transcription", "-", "polymerase", "chain", "reaction", "(", "RT", "-", "PCR", ")", "followed", "by", "a", "protein", "truncation", "test", "(", "PTT", ")", ".", "DNA", "sequencing", "confirmed", "all", "alterations", "represented", "by", "aberrant", "bands", ".", "Germline", "mutations", "were", "identified", "in", "38", "patients", "(", "61", "%", ")", ".", "Nineteen", "of", "the", "detected", "mutations", "were", "presumed", "to", "be", "novel", ",", "thus", "emphasizing", "the", "heterogeneity", "of", "the", "mutational", "spectrum", "in", "Korean", "FAP", "patients", ".", "In", "the", "initial", "48", "patients", ",", "SSCP", "analysis", "was", "followed", "by", "PTT", "for", "those", "patients", "for", "whom", "no", "detectable", "mutations", "were", "found", "by", "SSCP", ".", "Using", "this", "combined", "approach", ",", "we", "identified", "germline", "APC", "gene", "mutations", "in", "29", "of", "the", "48", "FAP", "patients", "(", "60", "%", ")", ",", "including", "6", "patients", "in", "whom", "SSCP", "analysis", "failed", "to", "distinguish", "the", "mutant", "allele", ".", "In", "the", "14", "later", "patients", ",", "we", "identified", "truncating", "mutations", "in", "9", "patients", "(", "64", "%", ")", "using", "PTT", "only", ".", "Our", "results", "confirm", "that", "the", "mutation", "detection", "rate", "with", "PTT", "was", "superior", "to", "that", "with", "SSCP", ",", "and", "suggest", "that", "PTT", "would", "be", "a", "more", "practical", "screening", "method", "to", "detect", "germline", "mutations", "of", "the", "APC", "gene", "in", "FAP", "patients", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 7, 8, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 8, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 7, 0, 0 ]

10083734

[ "Molecular", "epidemiology", "of", "C9", "deficiency", "heterozygotes", "with", "an", "Arg95Stop", "mutation", "of", "the", "C9", "gene", "in", "Japan", ".", "Deficiency", "of", "the", "ninth", "component", "of", "human", "complement", "(", "C9", ")", "is", "the", "most", "common", "complement", "deficiency", "in", "Japan", ",", "with", "an", "incidence", "of", "approximately", "one", "homozygote", "in", "1000", ",", "but", "is", "very", "rare", "in", "other", "countries", ".", "Genetic", "analyses", "of", "Japanese", "C9", "deficiency", "have", "shown", "that", "a", "C", "-", "to", "-", "T", "transition", "leading", "to", "TGA", "stop", "codon", "for", "Arg95", "in", "exon", "4", "of", "the", "C9", "gene", "(", "Arg95Stop", ")", "is", "common", "in", "Japanese", "C9", "deficiency", ".", "To", "determine", "the", "prevalence", "of", "heterozygous", "carriers", "of", "the", "Arg95Stop", "mutation", "in", "a", "Japanese", "population", ",", "we", "collected", "DNA", "samples", "from", "300", "individuals", "in", "two", "of", "the", "four", "main", "islands", "of", "Japan", ".", "Heterozygote", "detection", "was", "performed", "with", "an", "allele", "-", "specific", "polymerase", "chain", "reaction", "(", "PCR", ")", "system", "designed", "to", "detect", "exclusively", "only", "one", "of", "the", "normal", "and", "mutant", "alleles", ",", "followed", "by", "confirmation", "with", "PCR", "/", "single", "-", "strand", "conformation", "polymorphism", "(", "SSCP", ")", "analysis", "and", "direct", "sequencing", ".", "Twenty", "individuals", "were", "heterozygous", "for", "the", "Arg95Stop", "mutation", ".", "was", "homozygous", ".", "The", "prevalence", "of", "carriers", "of", "the", "Arg95Stop", "mutation", "was", "6", ".", "7", "%", "(", "20", "/", "300", ")", ".", "An", "estimated", "frequency", "(", "0", ".", "12", "%", ")", "of", "complete", "C9", "deficiency", "due", "to", "homozygous", "Arg95Stop", "mutation", "was", "consistent", "with", "frequencies", "determined", "by", "serological", "studies" ]

[ 0, 0, 0, 7, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 4, 4, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

10085150

[ "The", "hereditary", "hemochromatosis", "protein", ",", "HFE", ",", "specifically", "regulates", "transferrin", "-", "mediated", "iron", "uptake", "in", "HeLa", "cells", ".", "HFE", "is", "the", "protein", "product", "of", "the", "gene", "mutated", "in", "the", "autosomal", "recessive", "disease", "hereditary", "hemochromatosis", "(", "Feder", ",", "J", ".", "N", ".", ",", "Gnirke", ",", "A", ".", ",", "Thomas", ",", "W", ".", ",", "Tsuchihashi", ",", "Z", ".", ",", "Ruddy", ",", "D", ".", "A", ".", ",", "Basava", ",", "A", ".", ",", "Dormishian", ",", "F", ".", ",", "Domingo", ",", "R", ".", "J", ".", ",", "Ellis", ",", "M", ".", "C", ".", ",", "Fullan", ",", "A", ".", ",", "Hinton", ",", "L", ".", "M", ".", ",", "Jones", ",", "N", ".", "L", ".", ",", "Kimmel", ",", "B", ".", "E", ".", ",", "Kronmal", ",", "G", ".", "S", ".", ",", "Lauer", ",", "P", ".", ",", "Lee", ",", "V", ".", "K", ".", ",", "Loeb", ",", "D", ".", "B", ".", ",", "Mapa", ",", "F", ".", "A", ".", ",", "McClelland", ",", "E", ".", ",", "Meyer", ",", "N", ".", "C", ".", ",", "Mintier", ",", "G", ".", "A", ".", ",", "Moeller", ",", "N", ".", ",", "Moore", ",", "T", ".", ",", "Morikang", ",", "E", ".", ",", "Prasss", ",", "C", ".", "E", ".", ",", "Quintana", ",", "L", ".", ",", "Starnes", ",", "S", ".", "M", ".", ",", "Schatzman", ",", "R", ".", "C", ".", ",", "Brunke", ",", "K", ".", "J", ".", ",", "Drayna", ",", "D", ".", "T", ".", ",", "Risch", ",", "N", ".", "J", ".", ",", "Bacon", ",", "B", ".", "R", ".", ",", "and", "Wolff", ",", "R", ".", "R", ".", "(", "1996", ")", "Nat", ".", "Genet", ".", "13", ",", "399", "-", "408", ")", ".", "At", "the", "cell", "surface", ",", "HFE", "complexes", "with", "transferrin", "receptor", "(", "TfR", ")", ",", "increasing", "the", "dissociation", "constant", "of", "transferrin", "(", "Tf", ")", "for", "its", "receptor", "10", "-", "fold", "(", "Gross", ",", "C", ".", "N", ".", ",", "Irrinki", ",", "A", ".", ",", "Feder", ",", "J", ".", "N", ".", ",", "and", "Enns", ",", "C", ".", "A", ".", "(", "1998", ")", "J", ".", "Biol", ".", "Chem", ".", "273", ",", "22068", "-", "22074", ";", "Feder", ",", "J", ".", "N", ".", ",", "Penny", ",", "D", ".", "M", ".", ",", "Irrinki", ",", "A", ".", ",", "Lee", ",", "V", ".", "K", ".", ",", "Lebron", ",", "J", ".", "A", ".", ",", "Watson", ",", "N", ".", ",", "Tsuchihashi", ",", "Z", ".", ",", "Sigal", ",", "E", ".", ",", "Bjorkman", ",", "P", ".", "J", ".", ",", "and", "Schatzman", ",", "R", ".", "C", ".", "(", "1998", ")", "Proc", ".", "Natl", ".", "Acad", ".", "Sci", ".", "U", "S", "A", "95", ",", "1472", "-", "1477", ")", ".", "HFE", "does", "not", "remain", "at", "the", "cell", "surface", ",", "but", "traffics", "with", "TfR", "to", "Tf", "-", "positive", "internal", "compartments", "(", "Gross", "et", "al", ".", ",", "1998", ")", ".", "Using", "a", "HeLa", "cell", "line", "in", "which", "the", "expression", "of", "HFE", "is", "controlled", "by", "tetracycline", ",", "we", "show", "that", "the", "expression", "of", "HFE", "reduces", "55Fe", "uptake", "from", "Tf", "by", "33", "%", "but", "does", "not", "affect", "the", "endocytic", "or", "exocytic", "rates", "of", "TfR", "cycling", ".", "Therefore", ",", "HFE", "appears", "to", "reduce", "cellular", "acquisition", "of", "iron", "from", "Tf", "within", "endocytic", "compartments", ".", "HFE", "specifically", "reduces", "iron", "uptake", "from", "Tf", ",", "as", "non", "-", "Tf", "-", "mediated", "iron", "uptake", "from", "Fe", "-", "nitrilotriacetic", "acid", "is", "not", "altered", ".", "These", "results", "explain", "the", "decreased", "ferritin", "levels", "seen", "in", "our", "HeLa", "cell", "system", "and", "demonstrate", "the", "specific", "control", "of", "HFE", "over", "the", "Tf", "-", "mediated", "pathway", "of", "iron", "uptake", ".", "These", "results", "also", "have", "implications", "for", "the", "understanding", "of", "cellular", "iron", "homeostasis", "in", "organs", "such", "as", "the", "liver", ",", "pancreas", ",", "heart", ",", "and", "spleen", "that", "are", "iron", "loaded", "in", "hereditary", "hemochromatotic", "individuals", "lacking", "functional", "HFE", "." ]

[ 0, 7, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 0, 0, 0, 0, 0 ]

10090880

[ "Mutation", "and", "haplotype", "studies", "of", "familial", "Mediterranean", "fever", "reveal", "new", "ancestral", "relationships", "and", "evidence", "for", "a", "high", "carrier", "frequency", "with", "reduced", "penetrance", "in", "the", "Ashkenazi", "Jewish", "population", ".", "Familial", "Mediterranean", "fever", "(", "FMF", ")", "is", "a", "recessive", "disorder", "characterized", "by", "episodes", "of", "fever", "with", "serositis", "or", "synovitis", ".", "The", "FMF", "gene", "(", "MEFV", ")", "was", "cloned", "recently", ",", "and", "four", "missense", "mutations", "were", "identified", ".", "Here", "we", "present", "data", "from", "non", "-", "Ashkenazi", "Jewish", "and", "Arab", "patients", "in", "whom", "we", "had", "not", "originally", "found", "mutations", "and", "from", "a", "new", ",", "more", "ethnically", "diverse", "panel", ".", "Among", "90", "symptomatic", "mutation", "-", "positive", "individuals", ",", "11", "mutations", "accounted", "for", "79", "%", "of", "carrier", "chromosomes", ".", "Of", "the", "two", "mutations", "that", "are", "novel", ",", "one", "alters", "the", "same", "residue", "(", "680", ")", "as", "a", "previously", "known", "mutation", ",", "and", "the", "other", "(", "P369S", ")", "is", "located", "in", "exon", "3", ".", "Consistent", "with", "another", "recent", "report", ",", "the", "E148Q", "mutation", "was", "observed", "in", "patients", "of", "several", "ethnicities", "and", "on", "multiple", "microsatellite", "haplotypes", ",", "but", "haplotype", "data", "indicate", "an", "ancestral", "relationships", "between", "non", "-", "Jewish", "Italian", "and", "Ashkenazi", "Jewish", "patients", "with", "FMF", "and", "other", "affected", "populations", ".", "Among", "approximately", "200", "anonymous", "Ashkenazi", "Jewish", "DNA", "samples", ",", "the", "MEFV", "carrier", "frequency", "was", "21", "%", ",", "with", "E148Q", "the", "most", "common", "mutation", ".", "Several", "lines", "of", "evidence", "indicate", "reduced", "penetrance", "among", "Ashkenazi", "Jews", ",", "especially", "for", "E148Q", ",", "P369S", ",", "and", "K695R", ".", "Nevertheless", ",", "E148Q", "helps", "account", "for", "recessive", "inheritance", "in", "an", "Ashkenazi", "family", "previously", "reported", "as", "an", "unusual", "case", "of", "dominantly", "inherited", "FMF", ".", "The", "presence", "of", "three", "frequent", "MEFV", "mutations", "in", "multiple", "Mediterranean", "populations", "strongly", "suggests", "a", "heterozygote", "advantage", "in", "this", "geographic", "region", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

10090885

[ "Autoimmune", "lymphoproliferative", "syndrome", "with", "defective", "Fas", ":", "genotype", "influences", "penetrance", ".", "Autoimmune", "lymphoproliferative", "syndrome", "(", "ALPS", ")", "is", "a", "disorder", "of", "lymphocyte", "homeostasis", "and", "immunological", "tolerance", ".", "Most", "patients", "have", "a", "heterozygous", "mutation", "in", "the", "APT1", "gene", ",", "which", "encodes", "Fas", "(", "CD95", ",", "APO", "-", "1", ")", ",", "mediator", "of", "an", "apoptotic", "pathway", "crucial", "to", "lymphocyte", "homeostasis", ".", "Of", "17", "unique", "APT1", "mutations", "in", "unrelated", "ALPS", "probands", ",", "12", "(", "71", "%", ")", "occurred", "in", "exons", "7", "-", "9", ",", "which", "encode", "the", "intracellular", "portion", "of", "Fas", ".", "In", "vitro", ",", "activated", "lymphocytes", "from", "all", "17", "patients", "showed", "apoptotic", "defects", "when", "exposed", "to", "an", "anti", "-", "Fas", "agonist", "monoclonal", "antibody", ".", "Similar", "defects", "were", "found", "in", "a", "Fas", "-", "negative", "cell", "line", "transfected", "with", "cDNAs", "bearing", "each", "of", "the", "mutations", ".", "In", "cotransfection", "experiments", ",", "Fas", "constructs", "with", "either", "intra", "-", "or", "extracellular", "mutations", "caused", "dominant", "inhibition", "of", "apoptosis", "mediated", "by", "wild", "-", "type", "Fas", ".", "Two", "missense", "Fas", "variants", ",", "not", "restricted", "to", "patients", "with", "ALPS", ",", "were", "identified", ".", "Variant", "A", "(", "-", "1", ")", "T", "at", "the", "Fas", "signal", "-", "sequence", "cleavage", "site", ",", "which", "mediates", "apoptosis", "less", "well", "than", "wild", "-", "type", "Fas", "and", "is", "partially", "inhibitory", ",", "was", "present", "in", "13", "%", "of", "African", "American", "alleles", ".", "Among", "the", "ALPS", "-", "associated", "Fas", "mutants", ",", "dominant", "inhibition", "of", "apoptosis", "was", "much", "more", "pronounced", "in", "mutants", "affecting", "the", "intracellular", ",", "versus", "extracellular", ",", "portion", "of", "the", "Fas", "receptor", ".", "Mutations", "causing", "disruption", "of", "the", "intracellular", "Fas", "death", "domain", "also", "showed", "a", "higher", "penetrance", "of", "ALPS", "phenotype", "features", "in", "mutation", "-", "bearing", "relatives", ".", "Significant", "ALPS", "-", "related", "morbidity", "occurred", "in", "44", "%", "of", "relatives", "with", "intracellular", "mutations", ",", "versus", "0", "%", "of", "relatives", "with", "extracellular", "mutations", ".", "Thus", ",", "the", "location", "of", "mutations", "within", "APT1", "strongly", "influences", "the", "development", "and", "the", "severity", "of", "ALPS", "." ]

[ 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 6, 6, 6, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0 ]

10090890

[ "Multicentric", "origin", "of", "hemochromatosis", "gene", "(", "HFE", ")", "mutations", ".", "Genetic", "hemochromatosis", "(", "GH", ")", "is", "believed", "to", "be", "a", "disease", "restricted", "to", "those", "of", "European", "ancestry", ".", "In", "northwestern", "Europe", ",", ">", "80", "%", "of", "GH", "patients", "are", "homozygous", "for", "one", "mutation", ",", "the", "substitution", "of", "tyrosine", "for", "cysteine", "at", "position", "282", "(", "C282Y", ")", "in", "the", "unprocessed", "protein", ".", "In", "a", "proportion", "of", "GH", "patients", ",", "two", "mutations", "are", "present", ",", "C282Y", "and", "H63D", ".", "The", "clinical", "significance", "of", "this", "second", "mutation", "is", "such", "that", "it", "appears", "to", "predispose", "1", "%", "-", "2", "%", "of", "compound", "heterozygotes", "to", "expression", "of", "the", "disease", ".", "The", "distribution", "of", "the", "two", "mutations", "differ", ",", "C282Y", "being", "limited", "to", "those", "of", "northwestern", "European", "ancestry", "and", "H63D", "being", "found", "at", "allele", "frequencies", ">", "5", "%", ",", "in", "Europe", ",", "in", "countries", "bordering", "the", "Mediterranean", ",", "in", "the", "Middle", "East", ",", "and", "in", "the", "Indian", "subcontinent", ".", "The", "C282Y", "mutation", "occurs", "on", "a", "haplotype", "that", "extends", "<", "/", "=", "6", "Mb", ",", "suggesting", "that", "this", "mutation", "has", "arisen", "during", "the", "past", "2", ",", "000", "years", ".", "The", "H63D", "mutation", "is", "older", "and", "does", "not", "occur", "on", "such", "a", "large", "extended", "haplotype", ",", "the", "haplotype", "in", "this", "case", "extending", "<", "/", "=", "700", "kb", ".", "Here", "we", "report", "the", "finding", "of", "the", "H63D", "and", "C282Y", "mutations", "on", "new", "haplotypes", ".", "In", "Sri", "Lanka", "we", "have", "found", "H63D", "on", "three", "new", "haplotypes", "and", "have", "found", "C282Y", "on", "one", "new", "haplotype", ",", "demonstrating", "that", "these", "mutations", "have", "arisen", "independently", "on", "this", "island", ".", "These", "results", "suggest", "that", "the", "HFE", "gene", "has", "been", "the", "subject", "of", "selection", "pressure", ".", "These", "selection", "pressures", "could", "be", "due", "to", "infectious", "diseases", ",", "environmental", "conditions", ",", "or", "other", "genetic", "disorders", "such", "as", "anemia", "." ]

[ 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 1, 0 ]

10094552

[ "A", "retrospective", "anonymous", "pilot", "study", "in", "screening", "newborns", "for", "HFE", "mutations", "in", "Scandinavian", "populations", ".", "We", "have", "retrospectively", "analyzed", "837", "random", "anonymized", "dried", "blood", "spot", "(", "DBS", ")", "samples", "from", "neonatal", "screening", "programs", "in", "Scandinavia", "for", "mutations", "in", "HFE", ",", "the", "candidate", "gene", "for", "hemochromatosis", ".", "We", "have", "found", "C282Y", "allele", "frequencies", "of", "2", ".", "3", "%", "(", "+", "2", ".", "0", "%", ")", "(", "-", "1", ".", "3", "%", ")", "in", "Greenland", ",", "4", ".", "5", "%", "+", "/", "-", "1", ".", "9", "%", "in", "Iceland", ",", "5", ".", "1", "%", "+", "/", "-", "2", ".", "3", "%", "in", "the", "Faeroe", "Islands", ",", "and", "8", ".", "2", "%", "+", "/", "-", "2", ".", "7", "%", "in", "Denmark", ".", "The", "high", "prevalence", "of", "HFE", "mutations", "in", "Denmark", "suggests", "that", "population", "screening", "for", "the", "C282Y", "mutation", "could", "be", "highly", "advantageous", "in", "terms", "of", "preventive", "health", "care", ".", "Long", "-", "term", "follow", "-", "up", "evaluation", "of", "C282Y", "homozygotes", "and", "H63D", "/", "C282Y", "compound", "heterozygotes", "will", "give", "an", "indication", "of", "the", "penetrance", "of", "the", "mutations", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

10094559

[ "Identification", "of", "the", "mutation", "in", "the", "alkaptonuria", "mouse", "model", ".", "Alkaptonuria", "(", "aku", ")", ",", "an", "inborn", "error", "of", "metabolism", "caused", "by", "the", "loss", "of", "homogentisate", "1", ",", "2", "-", "dioxygenase", "(", "HGD", ")", ",", "has", "been", "described", "in", "a", "mouse", "model", "created", "by", "ethylnitrosourea", "mutagenesis", "but", "the", "mutation", "in", "these", "mice", "has", "not", "previously", "been", "identified", ".", "We", "used", "RT", "-", "PCR", "to", "amplify", "the", "Hgd", "cDNA", "from", "Hgd", "(", "aku", ")", "/", "Hgd", "(", "aku", ")", "mice", ".", "Two", "products", "shorter", "than", "the", "wild", "-", "type", "product", "were", "amplified", ".", "Restriction", "mapping", "and", "DNA", "sequencing", "were", "then", "used", "to", "identify", "the", "Hgd", "(", "aku", ")", "mouse", "mutation", ",", "found", "to", "be", "a", "single", "base", "change", "in", "a", "splice", "donor", "consensus", "sequence", ",", "causing", "exon", "skipping", "and", "frame", "-", "shifted", "products", ".", "This", "base", "change", "allowed", "us", "to", "create", "a", "non", "-", "radioactive", "genotyping", "assay", "for", "this", "allele", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 3, 0, 3, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

10190331

[ "Non", "-", "syndromic", "hearing", "loss", "associated", "with", "enlarged", "vestibular", "aqueduct", "is", "caused", "by", "PDS", "mutations", ".", "Enlarged", "vestibular", "aqueduct", "(", "EVA", ")", ",", "known", "as", "the", "most", "common", "form", "of", "inner", "ear", "abnormality", ",", "has", "recently", "been", "of", "particular", "genetic", "interest", "because", "this", "anomaly", "is", "inherited", "in", "a", "recessive", "manner", ".", "The", "locus", "for", "non", "-", "syndromic", "sensorineural", "hearing", "loss", "with", "EVA", "has", "been", "mapped", "to", "the", "same", "chromosomal", "region", ",", "7q31", ",", "as", "the", "Pendred", "syndrome", "locus", ".", "In", "the", "present", "study", ",", "seven", "mutations", "in", "the", "PDS", "gene", "(", "PDS", ")", ",", "the", "gene", "responsible", "for", "Pendred", "syndrome", ",", "have", "been", "found", "in", "families", "of", "non", "-", "syndromic", "sensorineural", "hearing", "loss", "with", "EVA", ".", "One", "family", "is", "homozygous", ",", "three", "families", "are", "compound", "heterozygotes", ",", "and", "two", "families", "are", "heterozygous", "but", "with", "no", "other", "mutation", "detected", ".", "The", "present", "results", "provide", "evidence", "that", "mutations", "in", "PDS", "cause", "both", "syndromic", "and", "non", "-", "syndromic", "hearing", "loss", ".", "." ]

[ 3, 4, 4, 4, 4, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 4, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 4, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 6, 6, 6, 6, 0, 0 ]

10190819

[ "Mutational", "analysis", "and", "genotype", "-", "phenotype", "correlation", "of", "29", "unrelated", "Japanese", "patients", "with", "X", "-", "linked", "adrenoleukodystrophy", ".", "BACKGROUND", "X", "-", "linked", "adrenoleukodystrophy", "(", "ALD", ")", "is", "an", "inherited", "disease", "characterized", "by", "progressive", "neurologic", "dysfunction", ",", "occasionally", "associated", "with", "adrenal", "insufficiency", ".", "The", "classic", "form", "of", "ALD", "usually", "has", "onset", "in", "childhood", "(", "childhood", "cerebral", "ALD", ")", ",", "with", "rapid", "neurologic", "deterioration", "leading", "to", "a", "vegetative", "state", ".", "Adult", "-", "onset", "cerebral", "ALD", "also", "presents", "with", "rapidly", "progressive", "neurologic", "dysfunction", ".", "Milder", "phenotypes", "such", "as", "adrenomyeloneuropathy", "and", "Addison", "disease", "only", "also", "have", "been", "recognized", ".", "Despite", "discovery", "of", "the", "causative", "gene", ",", "a", "molecular", "basis", "for", "the", "diverse", "clinical", "presentations", "remains", "to", "be", "elucidated", ".", "OBJECTIVES", "To", "conduct", "mutational", "analyses", "in", "29", "Japanese", "patients", "with", "ALD", "from", "29", "unrelated", "families", ",", "to", "obtain", "knowledge", "of", "the", "spectrum", "of", "mutations", "in", "this", "gene", ",", "and", "to", "study", "genotype", "-", "phenotype", "correlations", "in", "Japanese", "patients", ".", "METHODS", "The", "29", "patients", "comprised", "13", "patients", "with", "childhood", "cerebral", "ALD", ",", "11", "patients", "with", "adult", "-", "onset", "cerebral", "ALD", ",", "and", "5", "patients", "with", "adrenomyeloneuropathy", ".", "We", "conducted", "detailed", "mutational", "analyses", "of", "29", "unrelated", "Japanese", "patients", "with", "ALD", "by", "genomic", "Southern", "blot", "analysis", "and", "direct", "nucleotide", "sequence", "analysis", "of", "reverse", "transcriptase", "-", "polymerase", "chain", "reaction", "products", "derived", "from", "total", "RNA", "that", "was", "extracted", "from", "cultured", "skin", "fibroblasts", ",", "lymphoblastoid", "cells", ",", "or", "peripheral", "blood", "leukocytes", ".", "RESULTS", "Three", "patients", "with", "adult", "-", "onset", "cerebral", "ALD", "were", "identified", "as", "having", "large", "genomic", "rearrangements", ".", "The", "remaining", "26", "patients", "were", "identified", "as", "having", "21", "independent", "mutations", ",", "including", "12", "novel", "mutations", "resulting", "in", "small", "nucleotide", "alterations", "in", "the", "ALD", "gene", ".", "Eighteen", "(", "69", "%", ")", "of", "26", "mutations", "were", "missense", "mutations", ".", "Most", "missense", "mutations", "involved", "amino", "acids", "conserved", "in", "homologous", "gene", "products", ",", "including", "PMP70", ",", "mALDRP", ",", "and", "Pxa1p", ".", "The", "AG", "dinucleotide", "deletion", "at", "position", "1081", "-", "1082", ",", "which", "has", "been", "reported", "previously", "to", "be", "the", "most", "common", "mutation", "in", "white", "patients", "(", "12", "%", "-", "17", "%", ")", ",", "was", "also", "identified", "as", "the", "most", "common", "mutation", "in", "Japanese", "patients", "(", "12", "%", ")", ".", "All", "phenotypes", "were", "associated", "with", "mutations", "resulting", "in", "protein", "truncation", "or", "subtle", "amino", "acid", "changes", ".", "There", "were", "no", "differences", "in", "phenotypic", "expressions", "between", "missense", "mutations", "involving", "conserved", "amino", "acids", "and", "those", "involving", "nonconserved", "amino", "acids", ".", "CONCLUSIONS", "There", "are", "no", "obvious", "correlations", "between", "the", "phenotypes", "of", "patients", "with", "ALD", "and", "their", "genotypes", ",", "suggesting", "that", "other", "genetic", "or", "environmental", "factors", "modify", "the", "phenotypic", "expressions", "of", "ALD", ".", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0 ]

10192393

[ "A", "common", "human", "skin", "tumour", "is", "caused", "by", "activating", "mutations", "in", "beta", "-", "catenin", ".", "WNT", "signalling", "orchestrates", "a", "number", "of", "developmental", "programs", ".", "In", "response", "to", "this", "stimulus", ",", "cytoplasmic", "beta", "-", "catenin", "(", "encoded", "by", "CTNNB1", ")", "is", "stabilized", ",", "enabling", "downstream", "transcriptional", "activation", "by", "members", "of", "the", "LEF", "/", "TCF", "family", ".", "One", "of", "the", "target", "genes", "for", "beta", "-", "catenin", "/", "TCF", "encodes", "c", "-", "MYC", ",", "explaining", "why", "constitutive", "activation", "of", "the", "WNT", "pathway", "can", "lead", "to", "cancer", ",", "particularly", "in", "the", "colon", ".", "Most", "colon", "cancers", "arise", "from", "mutations", "in", "the", "gene", "encoding", "adenomatous", "polyposis", "coli", "(", "APC", ")", ",", "a", "protein", "required", "for", "ubiquitin", "-", "mediated", "degradation", "of", "beta", "-", "catenin", ",", "but", "a", "small", "percentage", "of", "colon", "and", "some", "other", "cancers", "harbour", "beta", "-", "catenin", "-", "stabilizing", "mutations", ".", "Recently", ",", "we", "discovered", "that", "transgenic", "mice", "expressing", "an", "activated", "beta", "-", "catenin", "are", "predisposed", "to", "developing", "skin", "tumours", "resembling", "pilomatricomas", ".", "Given", "that", "the", "skin", "of", "these", "adult", "mice", "also", "exhibits", "signs", "of", "de", "novo", "hair", "-", "follicle", "morphogenesis", ",", "we", "wondered", "whether", "human", "pilomatricomas", "might", "originate", "from", "hair", "matrix", "cells", "and", "whether", "they", "might", "possess", "beta", "-", "catenin", "-", "stabilizing", "mutations", ".", "Here", ",", "we", "explore", "the", "cell", "origin", "and", "aetiology", "of", "this", "common", "human", "skin", "tumour", ".", "We", "found", "nuclear", "LEF", "-", "1", "in", "the", "dividing", "tumour", "cells", ",", "providing", "biochemical", "evidence", "that", "pilomatricomas", "are", "derived", "from", "hair", "matrix", "cells", ".", "At", "least", "75", "%", "of", "these", "tumours", "possess", "mutations", "affecting", "the", "amino", "-", "terminal", "segment", ",", "normally", "involved", "in", "phosphorylation", "-", "dependent", ",", "ubiquitin", "-", "mediated", "degradation", "of", "the", "protein", ".", "This", "percentage", "of", "CTNNB1", "mutations", "is", "greater", "than", "in", "all", "other", "human", "tumours", "examined", "thus", "far", ",", "and", "directly", "implicates", "beta", "-", "catenin", "/", "LEF", "misregulation", "as", "the", "major", "cause", "of", "hair", "matrix", "cell", "tumorigenesis", "in", "humans", ".", "." ]

[ 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 6, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

10192399

[ "The", "Pendred", "syndrome", "gene", "encodes", "a", "chloride", "-", "iodide", "transport", "protein", ".", "Pendred", "syndrome", "is", "the", "most", "common", "form", "of", "syndromic", "deafness", "and", "characterized", "by", "congenital", "sensorineural", "hearing", "loss", "and", "goitre", ".", "This", "disorder", "was", "mapped", "to", "chromosome", "7", "and", "the", "gene", "causing", "Pendred", "syndrome", "(", "PDS", ")", "was", "subsequently", "identified", "by", "positional", "cloning", ".", "PDS", "encodes", "a", "putative", "transmembrane", "protein", "designated", "pendrin", ".", "Pendrin", "is", "closely", "related", "to", "a", "family", "of", "sulfate", "transport", "proteins", "that", "includes", "the", "rat", "sulfate", "-", "anion", "transporter", "(", "encoded", "by", "Sat", "-", "1", ";", "29", "%", "amino", "acid", "sequence", "identity", ")", ",", "the", "human", "diastrophic", "dysplasia", "sulfate", "transporter", "(", "encoded", "by", "DTD", ";", "32", "%", ")", "and", "the", "human", "sulfate", "transporter", "downregulated", "in", "adenoma", "(", "encoded", "by", "DRA", ";", "45", "%", ")", ".", "On", "the", "basis", "of", "this", "homology", "and", "the", "presence", "of", "a", "slightly", "modified", "sulfate", "-", "transporter", "signature", "sequence", "comprising", "its", "putative", "second", "transmembrane", "domain", ",", "pendrin", "has", "been", "proposed", "to", "function", "as", "a", "sulfate", "transporter", ".", "We", "were", "unable", "to", "detect", "evidence", "of", "sulfate", "transport", "following", "the", "expression", "of", "pendrin", "in", "Xenopus", "laevis", "oocytes", "by", "microinjection", "of", "PDS", "cRNA", "or", "in", "Sf9", "cells", "following", "infection", "with", "PDS", "-", "recombinant", "baculovirus", ".", "The", "rates", "of", "transport", "for", "iodide", "and", "chloride", "were", "significantly", "increased", "following", "the", "expression", "of", "pendrin", "in", "both", "cell", "systems", ".", "Our", "results", "demonstrate", "that", "pendrin", "functions", "as", "a", "transporter", "of", "chloride", "and", "iodide", ",", "but", "not", "sulfate", ",", "and", "may", "provide", "insight", "into", "thyroid", "physiology", "and", "the", "pathophysiology", "of", "Pendred", "syndrome", ".", "." ]

[ 0, 7, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0 ]

10194428

[ "HFE", "mutations", "analysis", "in", "711", "hemochromatosis", "probands", ":", "evidence", "for", "S65C", "implication", "in", "mild", "form", "of", "hemochromatosis", ".", "Hereditary", "hemochromatosis", "(", "HH", ")", "is", "a", "common", "autosomal", "recessive", "genetic", "disorder", "of", "iron", "metabolism", ".", "The", "HFE", "candidate", "gene", "encoding", "an", "HLA", "class", "I", "-", "like", "protein", "involved", "in", "HH", "was", "identified", "in", "1996", ".", "Two", "missense", "mutations", "have", "been", "described", "C282Y", ",", "accounting", "for", "80", "%", "to", "90", "%", "of", "HH", "chromosomes", ",", "and", "H63D", ",", "which", "is", "associated", "with", "a", "milder", "form", "of", "the", "disease", "representing", "40", "%", "to", "70", "%", "of", "non", "-", "C282Y", "HH", "chromosomes", ".", "We", "report", "here", "on", "the", "analysis", "of", "C282Y", ",", "H63D", ",", "and", "the", "193A", "-", "-", ">", "T", "substitution", "leading", "to", "the", "S65C", "missense", "substitution", "in", "a", "large", "series", "of", "probands", "and", "controls", ".", "The", "results", "confirm", "that", "the", "C282Y", "substitution", "was", "the", "main", "mutation", "involved", "in", "hemochromatosis", ",", "accounting", "for", "85", "%", "of", "carrier", "chromosomes", ",", "whereas", "the", "H63D", "substitution", "represented", "39", "%", "of", "the", "HH", "chromosomes", "that", "did", "not", "carry", "the", "C282Y", "mutation", ".", "In", "addition", ",", "our", "screening", "showed", "that", "the", "S65C", "substitution", "was", "significantly", "enriched", "in", "probands", "with", "at", "least", "one", "chromosome", "without", "an", "assigned", "mutation", ".", "This", "substitution", "accounted", "for", "7", ".", "8", "%", "of", "HH", "chromosomes", "that", "were", "neither", "C282Y", "nor", "H63D", ".", "This", "enrichment", "of", "S65C", "among", "HH", "chromosomes", "suggests", "that", "the", "S65C", "substitution", "is", "associated", "with", "the", "mild", "form", "of", "hemochromatosis", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 3, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0 ]

10196379

[ "Germline", "BRCA1", "alterations", "in", "a", "population", "-", "based", "series", "of", "ovarian", "cancer", "cases", ".", "The", "objective", "of", "this", "study", "was", "to", "provide", "more", "accurate", "frequency", "estimates", "of", "breast", "cancer", "susceptibility", "gene", "1", "(", "BRCA1", ")", "germline", "alterations", "in", "the", "ovarian", "cancer", "population", ".", "To", "achieve", "this", ",", "we", "determined", "the", "prevalence", "of", "BRCA1", "alterations", "in", "a", "population", "-", "based", "series", "of", "consecutive", "ovarian", "cancer", "cases", ".", "This", "is", "the", "first", "population", "-", "based", "ovarian", "cancer", "study", "reporting", "BRCA1", "alterations", "derived", "from", "a", "comprehensive", "screen", "of", "the", "entire", "coding", "region", ".", "One", "hundred", "and", "seven", "ovarian", "cancer", "cases", "were", "analyzed", "for", "BRCA1", "alterations", "using", "the", "RNase", "mismatch", "cleavage", "assay", "followed", "by", "direct", "sequencing", ".", "Two", "truncating", "mutations", ",", "962del4", "and", "3600del11", ",", "were", "identified", ".", "Both", "patients", "had", "a", "family", "history", "of", "breast", "or", "ovarian", "cancer", ".", "Several", "novel", "as", "well", "as", "previously", "reported", "uncharacterized", "variants", "were", "also", "identified", ",", "some", "of", "which", "were", "associated", "with", "a", "family", "history", "of", "cancer", ".", "The", "frequency", "distribution", "of", "common", "polymorphisms", "was", "determined", "in", "the", "91", "Caucasian", "cancer", "cases", "in", "this", "series", "and", "24", "sister", "controls", "using", "allele", "-", "specific", "amplification", ".", "The", "rare", "form", "of", "the", "Q356R", "polymorphism", "was", "significantly", "(", "P", "=", "0", ".", "03", ")", "associated", "with", "a", "family", "history", "of", "ovarian", "cancer", ",", "suggesting", "that", "this", "polymorphism", "may", "influence", "ovarian", "cancer", "risk", ".", "In", "summary", ",", "our", "data", "suggest", "a", "role", "for", "some", "uncharacterized", "variants", "and", "rare", "forms", "of", "polymorphisms", "in", "determining", "ovarian", "cancer", "risk", ",", "and", "highlight", "the", "necessity", "to", "screen", "for", "missense", "alterations", "as", "well", "as", "truncating", "mutations", "in", "this", "population", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

10196381

[ "Adrenoleukodystrophy", "-", "related", "protein", "can", "compensate", "functionally", "for", "adrenoleukodystrophy", "protein", "deficiency", "(", "X", "-", "ALD", ")", ":", "implications", "for", "therapy", ".", "Inherited", "defects", "in", "the", "peroxisomal", "ATP", "-", "binding", "cassette", "(", "ABC", ")", "transporter", "adrenoleukodystrophy", "protein", "(", "ALDP", ")", "lead", "to", "the", "lethal", "peroxisomal", "disorder", "X", "-", "linked", "adrenoleukodystrophy", "(", "X", "-", "ALD", ")", ",", "for", "which", "no", "efficient", "treatment", "has", "been", "established", "so", "far", ".", "Three", "other", "peroxisomal", "ABC", "transporters", "currently", "are", "known", "adrenoleukodystrophy", "-", "related", "protein", "(", "ALDRP", ")", ",", "70", "kDa", "peroxisomal", "membrane", "protein", "(", "PMP70", ")", "and", "PMP70", "-", "related", "protein", ".", "By", "using", "transient", "and", "stable", "overexpression", "of", "human", "cDNAs", "encoding", "ALDP", "and", "its", "closest", "relative", "ALDRP", ",", "we", "could", "restore", "the", "impaired", "peroxisomal", "beta", "-", "oxidation", "in", "fibroblasts", "of", "X", "-", "ALD", "patients", ".", "The", "pathognomonic", "accumulation", "of", "very", "long", "chain", "fatty", "acids", "could", "also", "be", "prevented", "by", "overexpression", "of", "ALDRP", "in", "immortalized", "X", "-", "ALD", "cells", ".", "Immunofluorescence", "analysis", "demonstrated", "that", "the", "functional", "replacement", "of", "ALDP", "by", "ALDRP", "was", "not", "due", "to", "stabilization", "of", "the", "mutated", "ALDP", "itself", ".", "Moreover", ",", "we", "were", "able", "to", "restore", "the", "peroxisomal", "beta", "-", "oxidation", "defect", "in", "the", "liver", "of", "ALDP", "-", "deficient", "mice", "by", "stimulation", "of", "ALDRP", "and", "PMP70", "gene", "expression", "through", "a", "dietary", "treatment", "with", "the", "peroxisome", "proliferator", "fenofibrate", ".", "These", "results", "suggest", "that", "a", "correction", "of", "the", "biochemical", "defect", "in", "X", "-", "ALD", "could", "be", "possible", "by", "drug", "-", "induced", "overexpression", "or", "ectopic", "expression", "of", "ALDRP", ".", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 3, 4, 4, 4, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

10198641

[ "Centrosome", "amplification", "and", "a", "defective", "G2", "-", "M", "cell", "cycle", "checkpoint", "induce", "genetic", "instability", "in", "BRCA1", "exon", "11", "isoform", "-", "deficient", "cells", ".", "Germline", "mutations", "of", "the", "Brca1", "tumor", "suppressor", "gene", "predispose", "women", "to", "breast", "and", "ovarian", "cancers", ".", "To", "study", "mechanisms", "underlying", "BRCA1", "-", "related", "tumorigenesis", ",", "we", "derived", "mouse", "embryonic", "fibroblast", "cells", "carrying", "a", "targeted", "deletion", "of", "exon", "11", "of", "the", "Brca1", "gene", ".", "We", "show", "that", "the", "mutant", "cells", "maintain", "an", "intact", "G1", "-", "S", "cell", "cycle", "checkpoint", "and", "proliferate", "poorly", ".", "However", ",", "a", "defective", "G2", "-", "M", "checkpoint", "in", "these", "cells", "is", "accompanied", "by", "extensive", "chromosomal", "abnormalities", ".", "Mutant", "fibroblasts", "contain", "multiple", ",", "functional", "centrosomes", ",", "which", "lead", "to", "unequal", "chromosome", "segregation", ",", "abnormal", "nuclear", "division", ",", "and", "aneuploidy", ".", "These", "data", "uncover", "an", "essential", "role", "of", "BRCA1", "in", "maintaining", "genetic", "stability", "through", "the", "regulation", "of", "centrosome", "duplication", "and", "the", "G2", "-", "M", "checkpoint", "and", "provide", "a", "molecular", "basis", "for", "the", "role", "of", "BRCA1", "in", "tumorigenesis", ".", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

10200300

[ "Defective", "CD95", "/", "APO", "-", "1", "/", "Fas", "signal", "complex", "formation", "in", "the", "human", "autoimmune", "lymphoproliferative", "syndrome", ",", "type", "Ia", ".", "Heterozygous", "mutations", "in", "the", "CD95", "(", "APO", "-", "1", "/", "Fas", ")", "receptor", "occur", "in", "most", "individuals", "with", "autoimmune", "lymphoproliferative", "syndrome", "(", "ALPS", ")", "and", "dominantly", "interfere", "with", "apoptosis", "by", "an", "unknown", "mechanism", ".", "We", "show", "that", "local", "or", "global", "alterations", "in", "the", "structure", "of", "the", "cytoplasmic", "death", "domain", "from", "nine", "independent", "ALPS", "CD95", "death", "-", "domain", "mutations", "result", "in", "a", "failure", "to", "bind", "the", "FADD", "/", "MORT1", "signaling", "protein", ".", "Despite", "heterozygosity", "for", "the", "abnormal", "allele", ",", "lymphocytes", "from", "ALPS", "patients", "showed", "markedly", "decreased", "FADD", "association", "and", "a", "loss", "of", "caspase", "recruitment", "and", "activation", "after", "CD95", "crosslinking", ".", "These", "data", "suggest", "that", "intracytoplasmic", "CD95", "mutations", "in", "ALPS", "impair", "apoptosis", "chiefly", "by", "disrupting", "death", "-", "domain", "interactions", "with", "the", "signaling", "protein", "FADD", "/", "MORT1", ".", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

10205262

[ "Analysis", "of", "alkaptonuria", "(", "AKU", ")", "mutations", "and", "polymorphisms", "reveals", "that", "the", "CCC", "sequence", "motif", "is", "a", "mutational", "hot", "spot", "in", "the", "homogentisate", "1", ",", "2", "dioxygenase", "gene", "(", "HGO", ")", ".", "We", "recently", "showed", "that", "alkaptonuria", "(", "AKU", ")", "is", "caused", "by", "loss", "-", "of", "-", "function", "mutations", "in", "the", "homogentisate", "1", ",", "2", "dioxygenase", "gene", "(", "HGO", ")", ".", "Herein", "we", "describe", "haplotype", "and", "mutational", "analyses", "of", "HGO", "in", "seven", "new", "AKU", "pedigrees", ".", "These", "analyses", "identified", "two", "novel", "single", "-", "nucleotide", "polymorphisms", "(", "INV4", "+", "31A", "-", "-", ">", "G", "and", "INV11", "+", "18A", "-", "-", ">", "G", ")", "and", "six", "novel", "AKU", "mutations", "(", "INV1", "-", "1G", "-", "-", ">", "A", ",", "W60G", ",", "Y62C", ",", "A122D", ",", "P230T", ",", "and", "D291E", ")", ",", "which", "further", "illustrates", "the", "remarkable", "allelic", "heterogeneity", "found", "in", "AKU", ".", "Reexamination", "of", "all", "29", "mutations", "and", "polymorphisms", "thus", "far", "described", "in", "HGO", "shows", "that", "these", "nucleotide", "changes", "are", "not", "randomly", "distributed", ";", "the", "CCC", "sequence", "motif", "and", "its", "inverted", "complement", ",", "GGG", ",", "are", "preferentially", "mutated", ".", "These", "analyses", "also", "demonstrated", "that", "the", "nucleotide", "substitutions", "in", "HGO", "do", "not", "involve", "CpG", "dinucleotides", ",", "which", "illustrates", "important", "differences", "between", "HGO", "and", "other", "genes", "for", "the", "occurrence", "of", "mutation", "at", "specific", "short", "-", "sequence", "motifs", ".", "Because", "the", "CCC", "sequence", "motifs", "comprise", "a", "significant", "proportion", "(", "34", ".", "5", "%", ")", "of", "all", "mutated", "bases", "that", "have", "been", "observed", "in", "HGO", ",", "we", "conclude", "that", "the", "CCC", "triplet", "is", "a", "mutational", "hot", "spot", "in", "HGO", "." ]

[ 0, 0, 7, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

10208848

[ "Fabry", "disease", ":", "identification", "of", "novel", "alpha", "-", "galactosidase", "A", "mutations", "and", "molecular", "carrier", "detection", "by", "use", "of", "fluorescent", "chemical", "cleavage", "of", "mismatches", ".", "Fabry", "disease", "(", "FD", ")", "(", "angiokeratoma", "corporis", "diffusum", ")", "is", "an", "X", "-", "linked", "inborn", "error", "of", "glycosphingolipid", "metabolism", "caused", "by", "defects", "in", "the", "lysosomal", "alpha", "-", "galactosidase", "A", "gene", "(", "GLA", ")", ".", "The", "enzymatic", "defect", "leads", "to", "the", "systemic", "accumulation", "of", "neutral", "glycosphingolipids", "with", "terminal", "alpha", "-", "galactosyl", "moieties", ".", "Clinically", ",", "affected", "hemizygous", "males", "have", "angiokeratoma", ",", "severe", "acroparesthesia", ",", "renal", "failure", ",", "and", "vasculopathy", "of", "the", "heart", "and", "brain", ".", "While", "demonstration", "of", "alpha", "-", "galactosidase", "deficiency", "in", "leukocytes", "is", "diagnostic", "in", "affected", "males", ",", "enzymatic", "detection", "of", "female", "carriers", "is", "often", "inconclusive", ",", "due", "to", "random", "X", "-", "chromosomal", "inactivation", ",", "underlining", "the", "need", "of", "molecular", "investigations", "for", "accurate", "genetic", "counseling", ".", "By", "use", "of", "chemical", "cleavage", "of", "mismatches", "adapted", "to", "fluorescence", "-", "based", "detection", "systems", ",", "we", "have", "characterized", "the", "mutations", "underlying", "alpha", "-", "Gal", "A", "deficiency", "in", "16", "individuals", "from", "six", "unrelated", "families", "with", "FD", ".", "The", "mutational", "spectrum", "included", "five", "missense", "mutations", "(", "C202W", ",", "C223G", ",", "N224D", ",", "R301Q", ",", "and", "Q327K", ")", "and", "one", "splice", "-", "site", "mutation", "[", "IVS3", "G", "(", "-", "1", ")", "-", "-", ">", "C", "]", ".", "Studies", "at", "the", "mRNA", "level", "showed", "that", "the", "latter", "led", "to", "altered", "pre", "-", "mRNA", "splicing", "with", "consequent", "alteration", "of", "the", "mRNA", "translational", "reading", "frame", "and", "generation", "of", "a", "premature", "termination", "codon", "of", "translation", ".", "By", "use", "of", "this", "strategy", ",", "carrier", "status", "was", "accurately", "assessed", "in", "all", "seven", "at", "-", "risk", "females", "tested", ",", "whereas", "enzymatic", "dosages", "failed", "to", "diagnose", "or", "exclude", "heterozygosity", ".", "." ]

[ 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 3, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 3, 4, 0, 3, 4, 0, 0, 5, 6, 6, 6, 6, 6, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

10210128

[ "Prenatal", "diagnosis", "by", "FISH", "in", "a", "family", "with", "Pelizaeus", "-", "Merzbacher", "disease", "caused", "by", "duplication", "of", "PLP", "gene", ".", "A", "diagnosis", "of", "Pelizaeus", "-", "Merzbacher", "disease", "(", "MIM", "312080", ")", "was", "made", "in", "a", "young", "boy", ".", "No", "mutation", "in", "the", "coding", "region", "of", "the", "proteolipid", "protein", "(", "PLP", ")", "gene", "had", "been", "found", ".", "The", "boys", "maternal", "aunt", "came", "for", "prenatal", "diagnosis", "when", "16", "+", "weeks", "pregnant", "and", "carrying", "a", "male", "fetus", ".", "Samples", "were", "tested", "for", "duplication", "of", "the", "PLP", "gene", ",", "by", "interphase", "FISH", ",", "in", "lymphocyte", "preparations", "from", "the", "proband", ",", "his", "aunt", "and", "an", "amniotic", "fluid", "cell", "preparation", "from", "the", "fetus", ".", "The", "proband", "was", "found", "to", "carry", "the", "duplication", ",", "thus", "confirming", "the", "diagnosis", "of", "Pelizaeus", "Merzbacher", "disease", ",", "but", "neither", "the", "aunt", "nor", "the", "fetus", "carried", "a", "duplication", ".", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

10213492

[ "Dominant", "negative", "effect", "of", "the", "APC1309", "mutation", ":", "a", "possible", "explanation", "for", "genotype", "-", "phenotype", "correlations", "in", "familial", "adenomatous", "polyposis", ".", "Inactivation", "of", "the", "adenomatous", "polyposis", "coli", "(", "APC", ")", "gene", "product", "initiates", "colorectal", "tumorigenesis", ".", "Patients", "with", "familial", "APC", "(", "FAP", ")", "carry", "germ", "-", "line", "mutations", "in", "the", "APC", "gene", "and", "develop", "multiple", "colorectal", "adenomas", "and", "subsequent", "carcinomas", "early", "in", "life", ".", "The", "severity", "of", "the", "disease", "correlates", "with", "the", "position", "of", "the", "inherited", "APC", "mutation", "(", "genotype", "-", "phenotype", "correlation", ")", ".", "Together", "with", "the", "fact", "that", "both", "germ", "-", "line", "and", "sporadic", "APC", "mutations", "cluster", "in", "the", "central", "region", "of", "the", "APC", "gene", ",", "this", "points", "to", "a", "dominant", "negative", "effect", "of", "certain", "APC", "mutants", ".", "Loss", "of", "APC", "function", "was", "recently", "shown", "to", "result", "in", "enhanced", "beta", "-", "catenin", "-", "/", "Tcf", "-", "mediated", "transcription", "in", "colon", "epithelial", "cells", ".", "Here", ",", "we", "provide", "experimental", "evidence", "for", "a", "dominant", "negative", "effect", "of", "APC", "gene", "products", "associated", "with", "severe", "polyposis", ".", "Wild", "-", "type", "APC", "activity", "in", "beta", "-", "catenin", "-", "/", "Tcf", "-", "mediated", "transcription", "was", "strongly", "inhibited", "by", "a", "mutant", "APC", "that", "is", "truncated", "at", "codon", "1309", ".", "In", "contrast", ",", "mutant", "APC", "gene", "products", "that", "are", "associated", "with", "attenuated", "polyposis", "(", "codon", "386", "or", "1465", ")", "interfered", "only", "weakly", "with", "wild", "-", "type", "APC", "activity", ".", "These", "results", "suggest", "a", "molecular", "explanation", "for", "the", "genotype", "-", "phenotype", "correlation", "in", "FAP", "patients", "and", "support", "the", "idea", "that", "colorectal", "tumor", "growth", "might", "be", ",", "in", "part", ",", "driven", "by", "selection", "for", "a", "mutation", "in", "the", "mutation", "cluster", "region", ".", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 8, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

10220405

[ "BRCA1", "interacts", "with", "components", "of", "the", "histone", "deacetylase", "complex", ".", "Germ", "-", "line", "mutations", "in", "the", "BRCA1", "tumor", "-", "suppressor", "gene", "are", "associated", "with", "an", "increased", "susceptibility", "to", "breast", "and", "ovarian", "cancer", ".", "BRCA1", "contains", "a", "carboxyl", "-", "terminal", "domain", "(", "BRCT", ")", "that", "is", "shared", "with", "several", "other", "proteins", "involved", "in", "maintaining", "genome", "integrity", ".", "In", "an", "effort", "to", "understand", "the", "function", "of", "BRCA1", ",", "we", "sought", "to", "isolate", "proteins", "that", "interact", "with", "the", "BRCT", "domain", ".", "Purified", "BRCT", "polypeptide", "was", "used", "as", "a", "probe", "to", "screen", "a", "human", "placenta", "cDNA", "expression", "library", "by", "Far", "Western", "analysis", ".", "Here", "we", "report", "that", "BRCA1", "interacts", "in", "vivo", "and", "in", "vitro", "with", "the", "Rb", "-", "binding", "proteins", ",", "RbAp46", "and", "RbAp48", ",", "as", "well", "as", "with", "Rb", ".", "Moreover", ",", "the", "BRCT", "domain", "associates", "with", "the", "histone", "deacetylases", "HDAC1", "and", "HDAC2", ".", "These", "results", "demonstrate", "that", "BRCA1", "interacts", "with", "components", "of", "the", "histone", "deacetylase", "complex", ",", "and", "therefore", "may", "explain", "the", "involvement", "of", "BRCA1", "in", "multiple", "processes", "such", "as", "transcription", ",", "DNA", "repair", ",", "and", "recombination", ".", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

102474

[ "Combined", "genetic", "deficiency", "of", "C6", "and", "C7", "in", "man", ".", "By", "routine", "screening", "of", "sera", ",", "a", "subject", "was", "discovered", "who", "showed", "a", "sub", "-", "total", "deficiency", "of", "C6", "and", "C7", ".", "No", "clinical", "disease", "was", "associated", "with", "this", "deficiency", "which", "was", "transmitted", "through", "the", "subjects", "family", "as", "a", "single", "genetic", "characteristic", ",", "the", "C6", "deficiency", "being", "associated", "with", "a", "silent", "allele", "at", "the", "structural", "locus", ".", "The", "propositus", "was", "found", "to", "have", "low", "quantities", "of", "an", "abnormal", "C6", "which", "was", "both", "antigenically", "deficient", "and", "smaller", "in", "size", "than", "normal", "C6", "(", "110", ",", "000", "daltons", "compared", "with", "140", ",", "000", "daltons", ")", "and", "small", "quantities", "of", "apparently", "normal", "C7", ".", "It", "is", "concluded", "that", "the", "most", "likely", "explanation", "for", "this", "defect", "is", "that", "the", "subject", "has", "a", "structural", "mutation", "in", "his", "C6", "gene", "which", "produces", "hyopsynthesis", "not", "only", "of", "C6", "but", "also", "of", "the", "closely", "linked", "gene", "for", "C7", ".", "These", "findings", "suggest", "the", "possibility", "that", "C6", "and", "C7", "may", "function", "as", "a", "single", "genetic", "unit", "and", "that", "the", "primary", "transcript", "copied", "from", "the", "genome", "includes", "information", "for", "both", "proteins", ".", "." ]

[ 5, 6, 6, 6, 6, 6, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 6, 6, 6, 6, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

10323252

[ "Changes", "at", "P183", "of", "emerin", "weaken", "its", "protein", "-", "protein", "interactions", "resulting", "in", "X", "-", "linked", "Emery", "-", "Dreifuss", "muscular", "dystrophy", ".", "Emery", "-", "Dreifuss", "muscular", "dystrophy", "(", "EDMD", ")", "is", "an", "X", "-", "linked", "recessive", "muscular", "dystrophy", "characterized", "by", "early", "contractures", "of", "the", "elbows", ",", "Achilles", "tendons", "and", "spine", ",", "slowly", "progressive", "muscle", "wasting", "and", "weakness", ",", "and", "cardiomyopathy", "associated", "with", "cardiac", "conduction", "defects", ".", "The", "emerin", "gene", "has", "been", "mapped", "to", "Xq28", "and", "encodes", "a", "34", "-", "kDa", "serine", "-", "rich", "protein", ",", "emerin", ",", "which", "has", "been", "localized", "to", "the", "nuclear", "envelope", "in", "a", "wide", "variety", "of", "tissues", ",", "including", "skeletal", "and", "cardiac", "muscle", ".", "Mutations", "spanning", "the", "emerin", "gene", "have", "been", "identified", "in", "patients", "with", "EDMD", ".", "We", "present", "here", "the", "effect", ",", "on", "emerin", "protein", "expression", ",", "of", "two", "missense", "mutations", "identified", "in", "unrelated", "EDMD", "patients", ".", "These", "alterations", "predict", "the", "replacement", "of", "a", "proline", "residue", "at", "position", "183", "with", "either", "a", "histidine", "or", "a", "threonine", ".", "Biochemical", "analysis", "has", "demonstrated", "that", "the", "mobility", "and", "expression", "levels", "of", "the", "mutant", "forms", "of", "emerin", "are", "indistinguishable", "from", "that", "of", "wild", "-", "type", "emerin", ",", "but", "that", "they", "have", "weakened", "interactions", "with", "nuclear", "lamina", "components", ".", "In", "comparison", "with", "the", "usual", "EDMD", "phenotype", ",", "patients", "with", "P183", "missense", "mutations", "have", "a", "later", "age", "at", "onset", "of", "first", "symptoms", ",", "elbow", "contractures", ",", "ankle", "contractures", ",", "upper", "limb", "weakness", "and", "lower", "limb", "weakness", ",", "but", "there", "is", "no", "difference", "for", "the", "age", "at", "onset", "of", "cardiac", "involvement", ".", "This", "is", "the", "first", "report", "of", "protein", "studies", "on", "patients", "with", "missense", "mutations", "resulting", "in", "the", "clinical", "features", "of", "EDMD", ".", "These", "studies", "demonstrate", "the", "importance", "of", "proline", "183", "for", "the", "proper", "structure", "/", "function", "of", "emerin", ".", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 4, 4, 4, 4, 0, 3, 4, 4, 4, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 6, 6, 6, 6, 6, 6, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 1, 0, 0, 3, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 3, 4, 0, 3, 4, 4, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

10323740

[ "Microdeletions", "at", "chromosome", "bands", "1q32", "-", "q41", "as", "a", "cause", "of", "Van", "der", "Woude", "syndrome", ".", "Van", "der", "Woude", "syndrome", "(", "VWS", ")", "is", "an", "autosomal", "dominant", "disorder", "comprising", "cleft", "lip", "and", "/", "or", "cleft", "palate", "and", "lip", "pits", ".", "We", "reported", "previously", "a", "family", "whose", "underlying", "mutation", "is", "a", "500", "-", "800", "kb", "deletion", "localized", "to", "chromosome", "bands", "1q32", "-", "q41", "[", "Sander", "et", "al", ".", ",", "1994", "Hum", "Mol", "Genet", "3", "576", "-", "578", "]", ".", "Along", "with", "cleft", "lip", "/", "palate", "and", "lip", "pits", ",", "affected", "relatives", "exhibit", "developmental", "delays", ",", "suggesting", "that", "the", "function", "of", "a", "gene", "nearby", "may", "also", "be", "disrupted", ".", "To", "further", "localize", "the", "VWS", "gene", "we", "searched", "for", "other", "deletions", "that", "cause", "VWS", ".", "An", "allele", "loss", "assay", "was", "performed", "using", "a", "novel", "highly", "polymorphic", "marker", ",", "D1S3753", ".", "From", "a", "panel", "of", "37", "unrelated", "individuals", ",", "we", "detected", "an", "allele", "loss", "in", "one", "family", ",", "indicating", "the", "presence", "of", "a", "deletion", ".", "In", "this", "family", ",", "the", "phenotype", "in", "three", "generations", "of", "affected", "individuals", "was", "confined", "to", "the", "cardinal", "signs", "of", "VWS", ".", "Surprisingly", ",", "mapping", "of", "the", "new", "deletion", "showed", "that", "it", "extended", "0", ".", "2", "-", "1", "Mb", "beyond", "the", "proximal", "breakpoint", "for", "the", "deletion", "described", "previously", ".", "No", "deletions", "were", "detected", "in", "seven", "cases", "of", "popliteal", "pterygia", "syndrome", ",", "76", "cases", "of", "mixed", "syndromic", "forms", "of", "cleft", "lip", "and", "palate", ",", "and", "178", "cases", "of", "nonsyndromic", "cleft", "lip", "and", "palate", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 0, 3, 4, 4, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 6, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 6, 6, 6, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 6, 6, 0 ]

10330348

[ "Splicing", "defects", "in", "the", "ataxia", "-", "telangiectasia", "gene", ",", "ATM", ":", "underlying", "mutations", "and", "consequences", ".", "Mutations", "resulting", "in", "defective", "splicing", "constitute", "a", "significant", "proportion", "(", "30", "/", "62", "[", "48", "%", "]", ")", "of", "a", "new", "series", "of", "mutations", "in", "the", "ATM", "gene", "in", "patients", "with", "ataxia", "-", "telangiectasia", "(", "AT", ")", "that", "were", "detected", "by", "the", "protein", "-", "truncation", "assay", "followed", "by", "sequence", "analysis", "of", "genomic", "DNA", ".", "Fewer", "than", "half", "of", "the", "splicing", "mutations", "involved", "the", "canonical", "AG", "splice", "-", "acceptor", "site", "or", "GT", "splice", "-", "donor", "site", ".", "A", "higher", "percentage", "of", "mutations", "occurred", "at", "less", "stringently", "conserved", "sites", ",", "including", "silent", "mutations", "of", "the", "last", "nucleotide", "of", "exons", ",", "mutations", "in", "nucleotides", "other", "than", "the", "conserved", "AG", "and", "GT", "in", "the", "consensus", "splice", "sites", ",", "and", "creation", "of", "splice", "-", "acceptor", "or", "splice", "-", "donor", "sites", "in", "either", "introns", "or", "exons", ".", "These", "splicing", "mutations", "led", "to", "a", "variety", "of", "consequences", ",", "including", "exon", "skipping", "and", ",", "to", "a", "lesser", "degree", ",", "intron", "retention", ",", "activation", "of", "cryptic", "splice", "sites", ",", "or", "creation", "of", "new", "splice", "sites", ".", "In", "addition", ",", "5", "of", "12", "nonsense", "mutations", "and", "1", "missense", "mutation", "were", "associated", "with", "deletion", "in", "the", "cDNA", "of", "the", "exons", "in", "which", "the", "mutations", "occurred", ".", "No", "ATM", "protein", "was", "detected", "by", "western", "blotting", "in", "any", "AT", "cell", "line", "in", "which", "splicing", "mutations", "were", "identified", ".", "Several", "cases", "of", "exon", "skipping", "in", "both", "normal", "controls", "and", "patients", "for", "whom", "no", "underlying", "defect", "could", "be", "found", "in", "genomic", "DNA", "were", "also", "observed", ",", "suggesting", "caution", "in", "the", "interpretation", "of", "exon", "deletions", "observed", "in", "ATM", "cDNA", "when", "there", "is", "no", "accompanying", "identification", "of", "genomic", "mutations", ".", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 7, 8, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

10330430

[ "Alpha", "-", "cardiac", "actin", "is", "a", "novel", "disease", "gene", "in", "familial", "hypertrophic", "cardiomyopathy", ".", "We", "identified", "the", "alpha", "-", "cardiac", "actin", "gene", "(", "ACTC", ")", "as", "a", "novel", "disease", "gene", "in", "a", "pedigree", "suffering", "from", "familial", "hypertrophic", "cardiomyopathy", "(", "FHC", ")", ".", "Linkage", "analyses", "excluded", "all", "the", "previously", "reported", "FHC", "loci", "as", "possible", "disease", "loci", "in", "the", "family", "studied", ",", "with", "lod", "scores", "varying", "between", "-", "2", ".", "5", "and", "-", "6", ".", "0", "0", ".", "Further", "linkage", "analyses", "of", "plausible", "candidate", "genes", "highly", "expressed", "in", "the", "adult", "human", "heart", "identified", "ACTC", "as", "the", "most", "likely", "disease", "gene", ",", "showing", "a", "maximal", "lod", "score", "of", "3", ".", "6", "6", ".", "Mutation", "analysis", "of", "ACTC", "revealed", "an", "Ala295Ser", "mutation", "in", "exon", "5", "close", "to", "2", "missense", "mutations", "recently", "described", "to", "cause", "the", "inherited", "form", "of", "idiopathic", "dilated", "cardiomyopathy", "(", "IDC", ")", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 3, 0, 0 ]

10353787

[ "Overgrowth", "of", "oral", "mucosa", "and", "facial", "skin", ",", "a", "novel", "feature", "of", "aspartylglucosaminuria", ".", "Aspartylglucosaminuria", "(", "AGU", ")", "is", "a", "lysosomal", "storage", "disorder", "caused", "by", "deficiency", "of", "aspartylglucosaminidase", "(", "AGA", ")", ".", "The", "main", "symptom", "is", "progressive", "mental", "retardation", ".", "A", "spectrum", "of", "different", "mutations", "has", "been", "reported", "in", "this", "disease", ",", "one", "missense", "mutation", "(", "Cys163Ser", ")", "being", "responsible", "for", "the", "majority", "of", "Finnish", "cases", ".", "We", "were", "able", "to", "examine", "66", "Finnish", "AGU", "patients", "for", "changes", "in", "the", "oral", "mucosa", "and", "44", "of", "these", "for", "changes", "in", "facial", "skin", ".", "Biopsy", "specimens", "of", "16", "oral", "lesions", ",", "12", "of", "them", "associated", "with", "the", "teeth", ",", "plus", "two", "facial", "lesions", "were", "studied", "histologically", ".", "Immunohistochemical", "staining", "for", "AGA", "was", "performed", "on", "15", "oral", "specimens", ".", "Skin", "was", "seborrhoeic", "in", "adolescent", "and", "adult", "patients", ",", "with", "erythema", "of", "the", "facial", "skin", "already", "common", "in", "childhood", ".", "Of", "44", "patients", ",", "nine", "(", "20", "%", ")", "had", "facial", "angiofibromas", ",", "tumours", "primarily", "occurring", "in", "association", "with", "tuberous", "sclerosis", ".", "Oedemic", "buccal", "mucosa", "(", "leucoedema", ")", "and", "gingival", "overgrowths", "were", "more", "frequent", "in", "AGU", "patients", "than", "in", "controls", "(", "p", "<", "0", ".", "001", ")", ".", "Of", "16", "oral", "mucosal", "lesions", "studied", "histologically", ",", "15", "represented", "fibroepithelial", "or", "epithelial", "hyperplasias", "and", "were", "reactive", "in", "nature", ".", "Cytoplasmic", "vacuolisation", "was", "evident", "in", "four", ".", "Immunohistochemically", ",", "expression", "of", "AGA", "in", "AGU", "patients", "mucosal", "lesions", "did", "not", "differ", "from", "that", "seen", "in", "corresponding", "lesions", "of", "normal", "subjects", ".", "Thus", ",", "the", "high", "frequency", "of", "mucosal", "overgrowth", "in", "AGU", "patients", "does", "not", "appear", "to", "be", "directly", "associated", "with", "lysosomal", "storage", "or", "with", "alterations", "in", "the", "level", "of", "AGA", "expression", "." ]

[ 5, 6, 6, 6, 6, 6, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 3, 0, 3, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 3, 4, 4, 0, 3, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

10364518

[ "Characterization", "of", "a", "germline", "mosaicism", "in", "families", "with", "Lowe", "syndrome", ",", "and", "identification", "of", "seven", "novel", "mutations", "in", "the", "OCRL1", "gene", ".", "The", "oculocerebrorenal", "syndrome", "of", "Lowe", "(", "OCRL", ")", "is", "an", "X", "-", "linked", "disorder", "characterized", "by", "major", "abnormalities", "of", "eyes", ",", "nervous", "system", ",", "and", "kidneys", ".", "Mutations", "in", "the", "OCRL1", "gene", "have", "been", "associated", "with", "the", "disease", ".", "OCRL1", "encodes", "a", "phosphatidylinositol", "4", ",", "5", "-", "biphosphate", "(", "PtdIns", "[", "4", ",", "5", "]", "P2", ")", "5", "-", "phosphatase", ".", "We", "have", "examined", "the", "OCRL1", "gene", "in", "eight", "unrelated", "patients", "with", "OCRL", "and", "have", "found", "seven", "new", "mutations", "and", "one", "recurrent", "in", "-", "frame", "deletion", ".", "Among", "the", "new", "mutations", ",", "two", "nonsense", "mutations", "(", "R317X", "and", "E558X", ")", "and", "three", "other", "frameshift", "mutations", "caused", "premature", "termination", "of", "the", "protein", ".", "A", "missense", "mutation", ",", "R483G", ",", "was", "located", "in", "the", "highly", "conserved", "PtdIns", "(", "4", ",", "5", ")", "P2", "5", "-", "phosphatase", "domain", ".", "Finally", ",", "one", "frameshift", "mutation", ",", "2799delC", ",", "modifies", "the", "C", "-", "terminal", "part", "of", "OCRL1", ",", "with", "an", "extension", "of", "six", "amino", "acids", ".", "Altogether", ",", "70", "%", "of", "missense", "mutations", "are", "located", "in", "exon", "15", ",", "and", "52", "%", "of", "all", "mutations", "cluster", "in", "exons", "11", "-", "15", ".", "We", "also", "identified", "two", "new", "microsatellite", "markers", "for", "the", "OCRL1", "locus", ",", "and", "we", "detected", "a", "germline", "mosaicism", "in", "one", "family", ".", "This", "observation", "has", "direct", "implications", "for", "genetic", "counseling", "of", "Lowe", "syndrome", "families", ".", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 6, 6, 6, 6, 6, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 0, 0, 0 ]

10364520

[ "MEFV", "-", "Gene", "analysis", "in", "armenian", "patients", "with", "Familial", "Mediterranean", "fever", ":", "diagnostic", "value", "and", "unfavorable", "renal", "prognosis", "of", "the", "M694V", "homozygous", "genotype", "-", "genetic", "and", "therapeutic", "implications", ".", "Familial", "Mediterranean", "fever", "(", "FMF", ")", "is", "a", "recessively", "inherited", "disorder", "that", "is", "common", "in", "patients", "of", "Armenian", "ancestry", ".", "To", "date", ",", "its", "diagnosis", ",", "which", "can", "be", "made", "only", "retrospectively", ",", "is", "one", "of", "exclusion", ",", "based", "entirely", "on", "nonspecific", "clinical", "signs", "that", "result", "from", "serosal", "inflammation", "and", "that", "may", "lead", "to", "unnecessary", "surgery", ".", "Renal", "amyloidosis", ",", "prevented", "by", "colchicine", ",", "is", "the", "most", "severe", "complication", "of", "FMF", ",", "a", "disorder", "associated", "with", "mutations", "in", "the", "MEFV", "gene", ".", "To", "evaluate", "the", "diagnostic", "and", "prognostic", "value", "of", "MEFV", "-", "gene", "analysis", ",", "we", "investigated", "90", "Armenian", "FMF", "patients", "from", "77", "unrelated", "families", "that", "were", "not", "selected", "through", "genetic", "-", "linkage", "analysis", ".", "Eight", "mutations", ",", "one", "of", "which", "(", "R408Q", ")", "is", "new", ",", "were", "found", "to", "account", "for", "93", "%", "of", "the", "163", "independent", "FMF", "alleles", ",", "with", "both", "FMF", "alleles", "identified", "in", "89", "%", "of", "the", "patients", ".", "In", "several", "instances", ",", "family", "studies", "provided", "molecular", "evidence", "for", "pseudodominant", "transmission", "and", "incomplete", "penetrance", "of", "the", "disease", "phenotype", ".", "The", "M694V", "homozygous", "genotype", "was", "found", "to", "be", "associated", "with", "a", "higher", "prevalence", "of", "renal", "amyloidosis", "and", "arthritis", ",", "compared", "with", "other", "genotypes", "(", "P", "=", ".", "0002", "and", "P", "=", ".", "006", ",", "respectively", ")", ".", "The", "demonstration", "of", "both", "the", "diagnostic", "and", "prognostic", "value", "of", "MEFV", "analysis", "and", "particular", "modes", "of", "inheritance", "should", "lead", "to", "new", "ways", "for", "management", "of", "FMF", "-", "including", "genetic", "counseling", "and", "therapeutic", "decisions", "in", "affected", "families", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

10364521

[ "Noninvasive", "test", "for", "fragile", "X", "syndrome", ",", "using", "hair", "root", "analysis", ".", "Identification", "of", "the", "FMR1", "gene", "and", "the", "repeat", "-", "amplification", "mechanism", "causing", "fragile", "X", "syndrome", "led", "to", "development", "of", "reliable", "DNA", "-", "based", "diagnostic", "methods", ",", "including", "Southern", "blot", "hybridization", "and", "PCR", ".", "Both", "methods", "are", "performed", "on", "DNA", "isolated", "from", "peripheral", "blood", "cells", "and", "measure", "the", "repeat", "size", "in", "FMR1", ".", "Using", "an", "immunocytochemical", "technique", "on", "blood", "smears", ",", "we", "recently", "developed", "a", "novel", "test", "for", "identification", "of", "patients", "with", "fragile", "X", "syndrome", ".", "This", "method", ",", "also", "called", "\"", "antibody", "test", ",", "\"", "uses", "monoclonal", "antibodies", "against", "the", "FMR1", "gene", "product", "(", "FMRP", ")", "and", "is", "based", "on", "absence", "of", "FMRP", "in", "patients", "cells", ".", "Here", "we", "describe", "a", "new", "diagnostic", "test", "to", "identify", "male", "patients", "with", "fragile", "X", "syndrome", ",", "on", "the", "basis", "of", "lack", "of", "FMRP", "in", "their", "hair", "roots", ".", "Expression", "of", "FMRP", "in", "hair", "roots", "was", "studied", "by", "use", "of", "an", "FMRP", "-", "specific", "antibody", "test", ",", "and", "the", "percentage", "of", "FMRP", "-", "expressing", "hair", "roots", "in", "controls", "and", "in", "male", "fragile", "X", "patients", "was", "determined", ".", "Control", "individuals", "showed", "clear", "expression", "of", "FMRP", "in", "nearly", "every", "hair", "root", ",", "whereas", "male", "fragile", "X", "patients", "lacked", "expression", "of", "FMRP", "in", "almost", "all", "their", "hair", "roots", ".", "Mentally", "retarded", "female", "patients", "with", "a", "full", "mutation", "showed", "FMRP", "expression", "in", "only", "some", "of", "their", "hair", "roots", "(", "<", "55", "%", ")", ",", "and", "no", "overlap", "with", "normal", "female", "controls", "was", "observed", ".", "The", "advantages", "of", "this", "test", "are", "(", "1", ")", "plucking", "of", "hair", "follicles", "does", "no", "appreciable", "harm", "to", "the", "mentally", "retarded", "patient", ",", "(", "2", ")", "hairs", "can", "be", "sent", "in", "a", "simple", "envelope", "to", "a", "diagnostic", "center", ",", "and", "(", "3", ")", "the", "result", "of", "the", "test", "is", "available", "within", "5", "h", "of", "plucking", ".", "In", "addition", ",", "this", "test", "enabled", "us", "to", "identify", "two", "fragile", "X", "patients", "who", "did", "not", "show", "the", "full", "mutation", "by", "analysis", "of", "DNA", "isolated", "from", "blood", "cells", ".", "." ]

[ 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

10364525

[ "In", "Swedish", "families", "with", "hereditary", "prostate", "cancer", ",", "linkage", "to", "the", "HPC1", "locus", "on", "chromosome", "1q24", "-", "25", "is", "restricted", "to", "families", "with", "early", "-", "onset", "prostate", "cancer", ".", "Prostate", "cancer", "clusters", "in", "some", "families", ",", "and", "an", "estimated", "5", "%", "-", "10", "%", "of", "all", "cases", "are", "estimated", "to", "result", "from", "inheritance", "of", "prostate", "cancer", "-", "susceptibility", "genes", ".", "We", "previously", "reported", "evidence", "of", "linkage", "to", "the", "1q24", "-", "25", "region", "(", "HPC1", ")", "in", "91", "North", "American", "and", "Swedish", "families", "each", "with", "multiple", "cases", "of", "prostate", "cancer", "(", "Smith", "et", "al", ".", "1996", ")", ".", "In", "the", "present", "report", "we", "analyze", "40", "(", "12", "original", "and", "28", "newly", "identified", ")", "Swedish", "families", "with", "hereditary", "prostate", "cancer", "(", "HPC", ")", "that", ",", "on", "the", "basis", "of", "40", "markers", "spanning", "a", "25", "-", "cM", "interval", "within", "1q24", "-", "25", ",", "have", "evidence", "of", "linkage", ".", "In", "the", "complete", "set", "of", "families", ",", "a", "maximum", "two", "-", "point", "LOD", "score", "of", "1", ".", "10", "was", "observed", "at", "D1S413", "(", "at", "a", "recombination", "fraction", "[", "theta", "]", "of", ".", "1", ")", ",", "with", "a", "maximum", "NPL", "(", "nonparametric", "linkage", ")", "Z", "score", "of", "1", ".", "64", "at", "D1S202", "(", "P", "=", ".", "05", ")", ".", "The", "evidence", "of", "linkage", "to", "this", "region", "originated", "almost", "exclusively", "from", "the", "subset", "of", "12", "early", "-", "onset", "(", "age", "<", "65", "years", ")", "families", ",", "which", "yielded", "a", "maximum", "LOD", "score", "of", "2", ".", "38", "at", "D1S413", "(", "straight", "theta", "=", "0", ")", "and", "an", "NPL", "Z", "score", "of", "1", ".", "95", "at", "D1S422", "(", "P", "=", ".", "03", ")", ".", "Estimates", "from", "heterogeneity", "tests", "suggest", "that", ",", "within", "Sweden", ",", "as", "many", "as", "50", "%", "of", "early", "-", "onset", "families", "had", "evidence", "of", "linkage", "to", "the", "HPC1", "region", ".", "These", "results", "are", "consistent", "with", "the", "hypothesis", "of", "linkage", "to", "HPC1", "in", "a", "subset", "of", "families", "with", "prostate", "cancer", ",", "particularly", "those", "with", "an", "early", "age", "at", "diagnosis", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

10366443

[ "Molecular", "basis", "of", "feline", "beta", "-", "glucuronidase", "deficiency", ":", "an", "animal", "model", "of", "mucopolysaccharidosis", "VII", ".", "A", "family", "of", "domestic", "cats", "was", "found", "that", "exhibited", "clinical", "and", "biochemical", "abnormalities", "consistent", "with", "mucopolysaccharidosis", "VII", ",", "an", "autosomal", "recessive", "lysosomal", "storage", "disorder", "caused", "by", "beta", "-", "glucuronidase", "deficiency", ".", "beta", "-", "Glucuronidase", "activity", "was", "undetectable", "in", "affected", "cat", "fibroblasts", "and", "restored", "by", "retroviral", "gene", "transfer", "of", "rat", "beta", "-", "glucuronidase", "cDNA", ".", "beta", "-", "Glucuronidase", "mRNA", "was", "normal", "in", "affected", "cat", "testis", "by", "Northern", "blot", "analysis", ".", "Normal", "feline", "beta", "-", "glucuronidase", "cDNA", "was", "cloned", "and", "characterized", ",", "and", "amplified", "from", "affected", "cat", "fibroblasts", "by", "reverse", "transcription", "coupled", "polymerase", "chain", "reaction", ".", "There", "was", "a", "G", "-", "to", "-", "A", "transition", "in", "the", "affected", "cat", "cDNA", "that", "predicted", "an", "E351K", "substitution", ",", "destroyed", "a", "BssSI", "site", ",", "and", "eliminated", "GUSB", "enzymatic", "activity", "in", "expression", "studies", ".", "Multiple", "species", "comparison", "and", "the", "crystal", "structure", "of", "human", "beta", "-", "glucuronidase", "indicated", "that", "E351", "is", "a", "highly", "conserved", "residue", "most", "likely", "essential", "in", "maintenance", "of", "the", "enzymes", "conformation", ".", "BssSI", "digestion", "of", "polymerase", "chain", "reaction", "products", "amplified", "from", "genomic", "DNA", "indicated", "that", "affected", "cats", "were", "homozygous", "and", "cats", "with", "half", "-", "normal", "beta", "-", "glucuronidase", "activity", "were", "heterozygous", "for", "the", "missense", "mutation", ".", "Carriers", "identified", "in", "this", "manner", "produced", "affected", "kittens", "in", "prospective", "breedings", ",", "and", "a", "feline", "MPS", "VII", "breeding", "colony", "has", "been", "established", ".", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 2, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

10369860

[ "A", "common", "molecular", "basis", "for", "rearrangement", "disorders", "on", "chromosome", "22q11", ".", "The", "chromosome", "22q11", "region", "is", "susceptible", "to", "rearrangements", "that", "are", "associated", "with", "congenital", "anomaly", "disorders", "and", "malignant", "tumors", ".", "Three", "congenital", "anomaly", "disorders", ",", "cat", "-", "eye", "syndrome", ",", "der", "(", ")", "syndrome", "and", "velo", "-", "cardio", "-", "facial", "syndrome", "/", "DiGeorge", "syndrome", "(", "VCFS", "/", "DGS", ")", "are", "associated", "with", "tetrasomy", ",", "trisomy", "or", "monosomy", ",", "respectively", ",", "for", "part", "of", "chromosome", "22q11", ".", "VCFS", "/", "DGS", "is", "the", "most", "common", "syndrome", "associated", "with", "22q11", "rearrangements", ".", "In", "order", "to", "determine", "whether", "there", "are", "particular", "regions", "on", "22q11", "that", "are", "prone", "to", "rearrangements", ",", "the", "deletion", "end", "-", "points", "in", "a", "large", "number", "of", "VCFS", "/", "DGS", "patients", "were", "defined", "by", "haplotype", "analysis", ".", "Most", "VCFS", "/", "DGS", "patients", "have", "a", "similar", "3", "Mb", "deletion", ",", "some", "have", "a", "nested", "distal", "deletion", "breakpoint", "resulting", "in", "a", "1", ".", "5", "Mb", "deletion", "and", "a", "few", "rare", "patients", "have", "unique", "deletions", "or", "translocations", ".", "The", "high", "prevalence", "of", "the", "disorder", "in", "the", "population", "and", "the", "fact", "that", "most", "cases", "occur", "sporadically", "suggest", "that", "sequences", "at", "or", "near", "the", "breakpoints", "confer", "susceptibility", "to", "chromosome", "rearrangements", ".", "To", "investigate", "this", "hypothesis", ",", "we", "developed", "hamster", "-", "human", "somatic", "hybrid", "cell", "lines", "from", "VCFS", "/", "DGS", "patients", "with", "all", "three", "classes", "of", "deletions", "and", "we", "now", "show", "that", "the", "breakpoints", "occur", "within", "similar", "low", "copy", "repeats", ",", "termed", "LCR22s", ".", "To", "support", "this", "idea", "further", ",", "we", "identified", "a", "family", "that", "carries", "an", "interstitial", "duplication", "of", "the", "same", "3", "Mb", "region", "that", "is", "deleted", "in", "VCFS", "/", "DGS", "patients", ".", "We", "present", "models", "to", "explain", "how", "the", "LCR22s", "can", "mediate", "different", "homologous", "recombination", "events", ",", "thereby", "generating", "a", "number", "of", "rearrangements", "that", "are", "associated", "with", "congenital", "anomaly", "disorders", ".", "We", "identified", "five", "additional", "copies", "of", "the", "LCR22", "on", "22q11", "that", "may", "mediate", "other", "rearrangements", "leading", "to", "disease", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 1, 2, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 3, 4, 4, 4, 0, 3, 4, 4, 4, 0, 3, 4, 4, 4, 4, 4, 0, 3, 4, 0, 3, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

10369870

[ "Functional", "consequences", "of", "mutations", "in", "the", "early", "growth", "response", "2", "gene", "(", "EGR2", ")", "correlate", "with", "severity", "of", "human", "myelinopathies", ".", "The", "early", "growth", "response", "2", "gene", "(", "EGR2", ")", "is", "a", "Cys2His2zinc", "finger", "transcription", "factor", "which", "is", "thought", "to", "play", "a", "role", "in", "the", "regulation", "of", "peripheral", "nervous", "system", "myelination", ".", "This", "idea", "is", "based", "partly", "on", "the", "phenotype", "of", "homozygous", "Krox20", "(", "Egr2", ")", "knockout", "mice", ",", "which", "display", "hypomyelination", "of", "the", "PNS", "and", "a", "block", "of", "Schwann", "cells", "at", "an", "early", "stage", "of", "differentiation", ".", "Mutations", "in", "the", "human", "EGR2", "gene", "have", "recently", "been", "associated", "with", "the", "inherited", "peripheral", "neuropathies", "Charcot", "-", "Marie", "-", "Tooth", "type", "1", ",", "Dejerine", "-", "Sottas", "syndrome", "and", "congenital", "hypomyelinating", "neuropathy", ".", "Three", "of", "the", "four", "EGR2", "mutations", "are", "dominant", "and", "occur", "within", "the", "zinc", "finger", "DNA", "-", "binding", "domain", ".", "The", "fourth", "mutation", "is", "recessive", "and", "affects", "the", "inhibitory", "domain", "(", "R1", ")", "that", "binds", "the", "NAB", "transcriptional", "co", "-", "repressors", ".", "A", "combination", "of", "DNA", "-", "binding", "assays", "and", "transcriptional", "analysis", "was", "used", "to", "determine", "the", "functional", "consequences", "of", "these", "mutations", ".", "The", "zinc", "finger", "mutations", "affect", "DNA", "binding", "and", "the", "amount", "of", "residual", "binding", "directly", "correlates", "with", "disease", "severity", ".", "The", "R1", "domain", "mutation", "prevents", "interaction", "of", "EGR2", "with", "the", "NAB", "co", "-", "repressors", "and", "thereby", "increases", "transcriptional", "activity", ".", "These", "data", "provide", "insight", "into", "the", "possible", "disease", "mechanisms", "underlying", "EGR2", "mutations", "and", "the", "reason", "for", "varying", "severity", "and", "differences", "in", "inheritance", "patterns", ".", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 3, 4, 4, 4, 4, 4, 4, 0, 3, 4, 4, 4, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

10369876

[ "Autosomal", "recessive", "familial", "neurohypophyseal", "diabetes", "insipidus", "with", "continued", "secretion", "of", "mutant", "weakly", "active", "vasopressin", ".", "Familial", "neurohypophyseal", "diabetes", "insipidus", "is", "an", "autosomal", "dominant", "disorder", "characterized", "by", "post", "-", "natal", "development", "of", "arginine", "vasopressin", "(", "AVP", ")", "deficiency", "due", "to", "mutations", "in", "the", "AVP", "gene", ".", "All", "published", "mutations", "affect", "the", "signal", "peptide", "or", "the", "neurophysin", "-", "II", "carrier", "protein", "and", "are", "presumed", "to", "interfere", "with", "processing", "of", "the", "preprohormone", ",", "leading", "to", "neuronal", "damage", ".", "We", "studied", "an", "unusual", "Palestinian", "family", "consisting", "of", "asymptomatic", "first", "cousin", "parents", "and", "three", "children", "affected", "with", "neurohypophyseal", "diabetes", "insipidus", ",", "suggesting", "autosomal", "recessive", "inheritance", ".", "All", "three", "affected", "children", "were", "homozygous", "and", "the", "parents", "heterozygous", "for", "a", "single", "novel", "mutation", "(", "C301", "-", ">", "T", ")", "in", "exon", "1", ",", "replacing", "Pro7", "of", "mature", "AVP", "with", "Leu", "(", "Leu", "-", "AVP", ")", ".", "Leu", "-", "AVP", "was", "a", "weak", "agonist", "with", "approximately", "30", "-", "fold", "reduced", "binding", "to", "the", "human", "V2", "receptor", ".", "Measured", "by", "radioimmunoassay", "with", "a", "synthetic", "Leu", "-", "AVP", "standard", ",", "serum", "Leu", "-", "AVP", "levels", "were", "elevated", "in", "all", "three", "children", "and", "further", "increased", "during", "water", "deprivation", "to", "as", "high", "as", "30", "times", "normal", ".", "The", "youngest", "child", "(", "2", "years", "old", ")", "was", "only", "mildly", "affected", "but", "had", "Leu", "-", "AVP", "levels", "similar", "to", "her", "severely", "affected", "8", "-", "year", "-", "old", "brother", ",", "suggesting", "that", "unknown", "mechanisms", "may", "partially", "compensate", "for", "a", "deficiency", "of", "active", "AVP", "in", "very", "young", "children", ".", "." ]

[ 3, 4, 4, 4, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

10377440

[ "X", "inactivation", "and", "somatic", "cell", "selection", "rescue", "female", "mice", "carrying", "a", "Piga", "-", "mutation", ".", "A", "somatic", "mutation", "in", "the", "X", "linked", "PIGA", "gene", "is", "responsible", "for", "the", "deficiency", "of", "glycosyl", "phosphatidylinositol", "(", "GPI", ")", "-", "anchored", "proteins", "on", "blood", "cells", "from", "patients", "with", "paroxysmal", "nocturnal", "hemoglobinuria", ".", "No", "inherited", "form", "of", "GPI", "-", "anchor", "deficiency", "has", "been", "described", ".", "Because", "conventional", "Piga", "gene", "knockout", "is", "associated", "with", "high", "embryonic", "lethality", "in", "chimeric", "mice", ",", "we", "used", "the", "Cre", "/", "loxP", "system", ".", "We", "generated", "mice", "in", "which", "two", "loxP", "sites", "flank", "part", "of", "Piga", "exon", "2", ".", "After", "crossbreeding", "with", "female", "mice", "of", "the", "EIIa", "-", "cre", "strain", ",", "the", "floxed", "allele", "undergoes", "Cre", "-", "mediated", "recombination", "with", "high", "efficiency", "during", "early", "embryonic", "development", ".", "Because", "of", "X", "chromosome", "inactivation", ",", "female", "offspring", "are", "mosaic", "for", "cells", "that", "express", "or", "lack", "GPI", "-", "linked", "proteins", ".", "Analysis", "of", "mosaic", "mice", "showed", "that", "in", "heart", ",", "lung", ",", "kidney", ",", "brain", ",", "and", "liver", ",", "mainly", "wild", "-", "type", "Piga", "is", "active", ",", "suggesting", "that", "these", "tissues", "require", "GPI", "-", "linked", "proteins", ".", "The", "salient", "exceptions", "were", "spleen", ",", "thymus", ",", "and", "red", "blood", "cells", ",", "which", "had", "almost", "equal", "numbers", "of", "cells", "expressing", "the", "wild", "-", "type", "or", "the", "recombined", "allele", ",", "implying", "that", "GPI", "-", "linked", "proteins", "are", "not", "essential", "for", "the", "derivation", "of", "these", "tissues", ".", "PIGA", "(", "-", ")", "cells", "had", "no", "growth", "advantage", ",", "suggesting", "that", "other", "factors", "are", "needed", "for", "their", "clonal", "dominance", "in", "patients", "with", "paroxysmal", "nocturnal", "hemoglobinuria", ".", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0 ]

10381492

[ "The", "C282Y", "mutation", "causing", "hereditary", "hemochromatosis", "does", "not", "produce", "a", "allele", ".", "Targeted", "mutagenesis", "was", "used", "to", "produce", "two", "mutations", "in", "the", "murine", "hemochromatosis", "gene", "(", "Hfe", ")", "locus", ".", "The", "first", "mutation", "deletes", "a", "large", "portion", "of", "the", "coding", "sequence", ",", "generating", "a", "allele", ".", "The", "second", "mutation", "introduces", "a", "missense", "mutation", "(", "C282Y", ")", "into", "the", "Hfe", "locus", ",", "but", "otherwise", "leaves", "the", "gene", "intact", ".", "This", "mutation", "is", "identical", "to", "the", "disease", "-", "causing", "mutation", "in", "patients", "with", "hereditary", "hemochromatosis", ".", "Mice", "carrying", "each", "of", "the", "two", "mutations", "were", "bred", "and", "analyzed", ".", "Homozygosity", "for", "either", "mutation", "results", "in", "postnatal", "iron", "loading", ".", "The", "effects", "of", "the", "mutation", "are", "more", "severe", "than", "the", "effects", "of", "the", "C282Y", "mutation", ".", "Mice", "heterozygous", "for", "either", "mutation", "accumulate", "more", "iron", "than", "normal", "controls", ".", "Interestingly", ",", "although", "liver", "iron", "stores", "are", "greatly", "increased", ",", "splenic", "iron", "is", "decreased", ".", "We", "conclude", "that", "the", "C282Y", "mutation", "does", "not", "result", "in", "a", "allele", ".", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

10382909

[ "Genotype", "-", "phenotype", "analysis", "in", "X", "-", "linked", "Emery", "-", "Dreifuss", "muscular", "dystrophy", "and", "identification", "of", "a", "missense", "mutation", "associated", "with", "a", "milder", "phenotype", ".", "Direct", "sequencing", "of", "the", "emerin", "gene", "in", "22", "families", "with", "Emery", "-", "Dreifuss", "muscular", "dystrophy", "(", "EMD", ")", "revealed", "mutations", "in", "21", "(", "95", "%", ")", ",", "confirming", "that", "emerin", "mutations", "can", "be", "identified", "in", "the", "majority", "of", "families", "with", "X", "-", "linked", "EMD", ".", "Most", "emerin", "mutations", "result", "in", "absence", "of", "the", "protein", ".", "In", "this", "study", "three", "mutations", "(", "a", "missense", "mutation", "Pro183Thr", "and", "two", "in", "-", "frame", "deletions", "removing", "residues", "95", "-", "99", "and", "236", "-", "241", ",", "respectively", ")", "were", "unusual", "in", "being", "associated", "with", "expression", "of", "mutant", "protein", ".", "The", "phenotype", "in", "these", "families", "was", "compared", "in", "detail", "with", "the", "clinical", "features", "in", "cases", "with", "typical", "mutations", ".", "For", "the", "in", "-", "frame", "deletions", "there", "were", "no", "significant", "differences", ".", "In", "the", "family", "with", "the", "missense", "mutation", "the", "phenotype", "was", "milder", ".", "Age", "at", "onset", "was", "later", "for", "first", "symptoms", "and", "for", "development", "of", "ankle", "contractures", "and", "muscle", "weakness", ".", "These", "findings", "have", "diagnostic", "implications", "as", "well", "as", "pointing", "to", "functionally", "important", "regions", "of", "the", "emerin", "protein", ".", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 4, 4, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

10382910

[ "Severe", "clinical", "expression", "in", "X", "-", "linked", "Emery", "-", "Dreifuss", "muscular", "dystrophy", ".", "X", "-", "linked", "Emery", "-", "Dreifuss", "muscular", "dystrophy", "(", "EDMD", ")", "is", "a", "relatively", "rare", "benign", "neuromuscular", "disorder", "which", "can", "vary", "remarkably", "in", "onset", ",", "course", "and", "severity", ".", "In", "the", "present", "study", ",", "a", "TCTAC", "deletion", "spanning", "the", "nucleotides", "631", "-", "635", "of", "the", "emerin", "gene", "caused", "an", "unusually", "severe", "disease", "phenotype", "including", "loss", "of", "ambulation", "and", "severe", "muscle", "wasting", "in", "two", "affected", "brothers", ".", "The", "same", "mutation", "has", "been", "reported", "previously", "in", "an", "unrelated", "family", "showing", "a", "significantly", "milder", "phenotype", ".", "The", "interfamilial", "heterogeneity", "in", "distribution", "and", "in", "severity", "of", "the", "features", "in", "the", "two", "families", "point", "to", "environmental", "or", "genetic", "modification", "as", "the", "cause", "of", "clinical", "variability", "in", "Emery", "-", "Dreifuss", "muscular", "dystrophy", ".", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 4, 4, 4, 4, 0, 3, 4, 4, 4, 4, 4, 4, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 4, 0, 0 ]

10398279

[ "Common", "mutations", "in", "BRCA1", "and", "BRCA2", "do", "not", "contribute", "to", "early", "prostate", "cancer", "in", "Jewish", "men", ".", "BACKGROUND", "Families", "with", "a", "high", "incidence", "of", "hereditary", "breast", "cancer", ",", "and", "subsequently", "shown", "to", "have", "terminating", "mutations", "in", "BRCA1", "or", "BRCA2", ",", "appear", "to", "have", "a", "higher", "incidence", "of", "prostate", "cancer", "among", "male", "relatives", ".", "We", "aimed", "to", "determine", "whether", "the", "common", "germline", "mutations", "of", "BRCA1", "or", "BRCA2", "in", "Ashkenazi", "Jewish", "men", "predisposed", "them", "to", "prostate", "cancer", ".", "METHODS", "We", "examined", "genomic", "DNA", "from", "83", "(", "for", "BRCA1", "185delAG", ")", "or", "82", "(", "for", "BRCA2", "6174delT", ")", "Ashkenazi", "Jewish", "prostate", "cancer", "patients", ",", "most", "of", "whom", "were", "treated", "at", "a", "relatively", "young", "age", ",", "for", "the", "most", "common", "germline", "mutation", "in", "each", "gene", "seen", "in", "the", "Ashkenazi", "population", ".", "RESULTS", "Our", "study", "should", "have", "been", "able", "to", "detect", "a", "4", "-", "5", "-", "fold", "increase", "in", "the", "risk", "of", "prostate", "cancer", "due", "to", "mutation", "of", "BRCA1", "or", "BRCA2", ".", "However", ",", "only", "one", "(", "1", ".", "15", "%", ";", "95", "%", "confidence", "interval", ",", "0", "-", "3", ".", "6", "%", ")", "of", "the", "patients", "was", "heterozygous", "for", "the", "BRCA1", "mutant", "allele", ",", "and", "only", "two", "were", "heterozygous", "for", "the", "BRCA2", "mutation", "(", "2", ".", "4", "%", ";", "95", "%", "confidence", "interval", ",", "0", "-", "6", ".", "2", "%", ")", ".", "CONCLUSIONS", "The", "incidence", "of", "each", "of", "the", "germline", "mutations", "in", "these", "prostate", "cancer", "patients", "closely", "matched", "their", "incidence", "(", "about", "1", "%", ")", "in", "the", "general", "Ashkenazi", "Jewish", "population", ".", "This", "suggests", "that", "unlike", "cases", "of", "breast", "and", "ovarian", "cancers", ",", "mutations", "in", "BRCA1", "or", "BRCA2", "do", "not", "significantly", "predispose", "men", "to", "prostate", "cancer" ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4 ]

10398436

[ "Beta", "-", "catenin", "accumulation", "and", "mutation", "of", "the", "CTNNB1", "gene", "in", "hepatoblastoma", ".", "Hepatoblastoma", "is", "a", "rare", "malignant", "tumor", "of", "the", "liver", "that", "occurs", "in", "children", "at", "an", "average", "age", "of", "2", "to", "3", "years", ".", "Epidemiologic", "studies", "have", "shown", "an", "increased", "frequency", "of", "this", "tumor", "type", "in", "families", "affected", "by", "adenomatous", "polyposis", "coli", ".", "In", "addition", "to", "the", "epidemiologic", "data", ",", "molecular", "genetic", "studies", "suggest", "that", "inactivation", "of", "the", "APC", "tumor", "suppressor", "may", "be", "involved", "in", "hepatoblastoma", "tumorigenesis", ".", "A", "major", "function", "of", "APC", "is", "the", "downregulation", "of", "beta", "-", "catenin", ",", "a", "transcription", "-", "activating", "protein", "with", "oncogenic", "potential", ".", "In", "an", "ongoing", "immunohistochemical", "study", "of", "beta", "-", "catenin", "expression", "in", "sporadic", "cases", "of", "tumor", "types", "that", "are", "associated", "with", "adenomatous", "polyposis", "coli", ",", "we", "observed", "increased", "beta", "-", "catenin", "levels", "in", "the", "cytoplasm", "and", "in", "the", "nuclei", "of", "three", "investigated", "hepatoblastomas", ".", "Sequencing", "of", "exon", "3", "of", "the", "beta", "-", "catenin", "gene", "(", "CTNNB1", ")", "revealed", "an", "activating", "mutation", "in", "one", "of", "the", "tumor", "samples", ".", "Our", "data", "indicate", "for", "the", "first", "time", "that", "beta", "-", "catenin", "accumulation", "may", "play", "a", "role", "in", "the", "development", "of", "hepatoblastoma", "and", "that", "activating", "mutations", "of", "the", "beta", "-", "catenin", "gene", "may", "substitute", "biallelic", "APC", "inactivation", "in", "this", "tumor", "type", ".", "Genes", "Chromosomes", "Cancer", "25", "399", "-", "402", ",", "1999", ".", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 3, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

10403837

[ "Decrease", "in", "GTP", "cyclohydrolase", "I", "gene", "expression", "caused", "by", "inactivation", "of", "one", "allele", "in", "hereditary", "progressive", "dystonia", "with", "marked", "diurnal", "fluctuation", ".", "Hereditary", "progressive", "dystonia", "with", "marked", "diurnal", "fluctuation", "(", "HPD", ";", "dopa", "-", "responsive", "dystonia", ",", "DRD", ")", "have", "been", "recently", "found", "to", "be", "caused", "by", "a", "genetic", "defect", "in", "the", "GTP", "cyclohydrolase", "I", "(", "GCH1", ")", "gene", ".", "In", "this", "study", ",", "we", "quantified", "the", "mRNA", "level", "of", "GCH1", "in", "phytohemagglutinin", "(", "PHA", ")", "-", "stimulated", "mononuclear", "blood", "cells", "from", "one", "Japanese", "family", "that", "do", "not", "have", "a", "mutation", "in", "the", "coding", "region", "or", "splice", "junctions", "of", "the", "gene", ".", "The", "results", "showed", "that", "the", "amounts", "of", "the", "GCH1", "mRNA", "were", "decreased", "to", "about", "40", "%", "of", "the", "normal", "level", "in", "both", "patients", "and", "carriers", ".", "In", "addition", ",", "we", "found", "that", "the", "GCH1", "mRNA", "was", "transcribed", "from", "only", "one", "allele", ",", "indicating", "that", "the", "other", "allele", "was", "in", "an", "inactive", "state", ".", "These", "results", "suggest", "that", "some", "novel", "mutations", "should", "exist", "on", "one", "of", "the", "alleles", "in", "some", "unknown", "region", "of", "the", "GCH1", "gene", ",", "and", "may", "decrease", "the", "GCH1", "mRNA", "causing", "the", "HPD", "/", "DRD", "symptoms", ".", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 3, 4, 4, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 7, 0, 0, 0 ]

10404839

[ "Sulfate", "transport", "is", "not", "impaired", "in", "pendred", "syndrome", "thyrocytes", ".", "Pendred", "syndrome", "is", "the", "most", "common", "form", "of", "syndromic", "deafness", ",", "characterized", "by", "dyshormonogenic", "goiter", "associated", "with", "sensory", "-", "neural", "deafness", ".", "The", "gene", "responsible", "for", "the", "disease", "(", "PDS", ")", "has", "been", "cloned", ",", "but", "its", "function", "is", "as", "yet", "unknown", "and", "the", "connection", "between", "thyroid", "goiter", "and", "sensory", "-", "neural", "deafness", "remains", "an", "enigma", ".", "PDS", "codes", "for", "a", "novel", "protein", ",", "pendrin", ",", "which", "is", "closely", "related", "to", "a", "number", "of", "sufate", "transporters", ".", "Mechanisms", "by", "which", "abnormal", "sulfate", "transport", "could", "deleteriously", "affect", "iodide", "organification", "have", "been", "proposed", ".", "We", "tested", "sulfate", "transport", "in", "thyrocytes", "obtained", "from", "Pendred", "syndrome", "patients", "and", "found", "that", "it", "was", "not", "defective", ".", "This", "suggests", "that", "pendrin", "in", "fact", "may", "not", "be", "a", "sulfate", "transporter", ",", "and", "emphasizes", "the", "importance", "of", "functional", "studies", "on", "this", "novel", "protein", ".", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 1, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

10406661

[ "Small", "deletions", "in", "the", "type", "II", "collagen", "triple", "helix", "produce", "kniest", "dysplasia", ".", "Kniest", "dysplasia", "is", "a", "moderately", "severe", "type", "II", "collagenopathy", ",", "characterized", "by", "short", "trunk", "and", "limbs", ",", "kyphoscoliosis", ",", "midface", "hypoplasia", ",", "severe", "myopia", ",", "and", "hearing", "loss", ".", "Mutations", "in", "the", "gene", "that", "encodes", "type", "II", "collagen", "(", "COL2A1", ")", ",", "the", "predominant", "protein", "of", "cartilage", ",", "have", "been", "identified", "in", "a", "number", "of", "individuals", "with", "Kniest", "dysplasia", ".", "All", "but", "two", "of", "these", "previously", "described", "mutations", "cause", "in", "-", "frame", "deletions", "in", "type", "II", "collagen", ",", "either", "by", "small", "deletions", "in", "the", "gene", "or", "splice", "site", "alterations", ".", "Furthermore", ",", "all", "but", "one", "of", "these", "mutations", "is", "located", "between", "exons", "12", "and", "24", "in", "the", "COL2A1", "gene", ".", "We", "used", "heteroduplex", "analysis", "to", "identify", "sequence", "anomalies", "in", "five", "individuals", "with", "Kniest", "dysplasia", ".", "Sequencing", "of", "the", "index", "patients", "genomic", "DNA", "identified", "four", "new", "dominant", "mutations", "in", "COL2A1", "that", "result", "in", "Kniest", "dysplasia", "a", "21", "-", "bp", "deletion", "in", "exon", "16", ",", "an", "18", "-", "bp", "deletion", "in", "exon", "19", ",", "and", "4", "-", "bp", "deletions", "in", "the", "splice", "donor", "sites", "of", "introns", "14", "and", "20", ".", "A", "previously", "described", "28", "-", "bp", "deletion", "at", "the", "COL2A1", "exon", "12", "-", "intron", "12", "junction", ",", "deleting", "the", "splice", "donor", "site", ",", "was", "identified", "in", "the", "fifth", "case", ".", "The", "latter", "three", "mutations", "are", "predicted", "to", "result", "in", "exon", "skipping", "in", "the", "mRNA", "encoded", "from", "the", "mutant", "allele", ".", "These", "data", "suggest", "that", "Kniest", "dysplasia", "results", "from", "shorter", "type", "II", "collagen", "monomers", ",", "and", "support", "the", "hypothesis", "that", "alteration", "of", "a", "specific", "COL2A1", "domain", ",", "which", "may", "span", "from", "exons", "12", "to", "24", ",", "leads", "to", "the", "Kniest", "dysplasia", "phenotype", ".", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 3, 4, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 0, 0, 0 ]

10408771

[ "Classical", "galactosemia", "and", "mutations", "at", "the", "galactose", "-", "1", "-", "phosphate", "uridyl", "transferase", "(", "GALT", ")", "gene", ".", "Classical", "galactosemia", "is", "caused", "by", "a", "deficiency", "in", "activity", "of", "the", "enzyme", "galactose", "-", "1", "-", "phosphate", "uridyl", "transferase", "(", "GALT", ")", ",", "which", ",", "in", "turn", ",", "is", "caused", "by", "mutations", "at", "the", "GALT", "gene", ".", "The", "disorder", "exhibits", "considerable", "allelic", "heterogeneity", "and", ",", "at", "the", "end", "of", "1998", ",", "more", "than", "150", "different", "base", "changes", "were", "recorded", "in", "24", "different", "populations", "and", "ethnic", "groups", "in", "15", "countries", "worldwide", ".", "The", "mutations", "most", "frequently", "cited", "are", "Q188R", ",", "K285N", ",", "S135L", ",", "and", "N314D", ".", "Q188R", "is", "the", "most", "common", "mutation", "in", "European", "populations", "or", "in", "those", "predominantly", "of", "European", "descent", ".", "Overall", ",", "it", "accounts", "for", "60", "-", "70", "%", "of", "mutant", "chromosomes", ",", "but", "there", "are", "significant", "differences", "in", "its", "relative", "frequency", "in", "individual", "populations", ".", "Individuals", "homoallelic", "for", "Q188R", "tend", "to", "have", "a", "severe", "phenotype", "and", "this", "is", "in", "keeping", "with", "the", "virtually", "complete", "loss", "of", "enzyme", "activity", "observed", "in", "in", "vitro", "expression", "systems", ".", "Globally", ",", "K285N", "is", "rarer", ",", "but", "in", "many", "European", "populations", "it", "can", "be", "found", "on", "25", "-", "40", "%", "of", "mutant", "chromosomes", ".", "It", "is", "invariably", "associated", "with", "a", "severe", "phenotype", ".", "S135L", "is", "found", "almost", "exclusively", "in", "African", "Americans", ".", "In", "vitro", "expression", "results", "are", "discrepant", ",", "but", "some", "individuals", "carrying", "S135L", "appear", "to", "exhibit", "GALT", "activity", "in", "some", "tissues", ".", "Duarte", "1", "(", "or", "Los", "Angeles", ")", "and", "Duarte", "2", "(", "or", "Duarte", ")", "variants", "carry", "the", "same", "amino", "acid", "substitution", ",", "N314D", ",", "even", "though", "D1", "is", "associated", "with", "increased", "erythrocyte", "GALT", "activity", "and", "D2", "with", "reduced", "activity", ".", "N314D", "is", "in", "linkage", "disequilibrium", "with", "other", "base", "changes", "that", "differ", "on", "the", "D1", "and", "D2", "alleles", ".", "N314D", "does", "not", "impair", "GALT", "activity", "in", "in", "vitro", "expression", "systems", ".", "However", ",", "there", "are", "differences", "in", "the", "abundance", "of", "GALT", "protein", "in", "lymphoblastoid", "cells", "lines", "from", "D2", "and", "D1", "individuals", ".", "It", "is", "unclear", "whether", "the", "specific", "molecular", "changes", "that", "distinguish", "the", "D1", "and", "D2", "alleles", "account", "for", "the", "different", "activities", ".", "The", "considerable", "genetic", "heterogeneity", "documented", "to", "date", "undoubtedly", "contributes", "to", "the", "phenotypic", "heterogeneity", "that", "is", "observed", "in", "galactosemia", ".", "The", "additional", "effects", "of", "nonallelic", "variation", "and", "other", "constitutional", "factors", "on", "phenotypic", "variability", "remain", "to", "be", "elucidated", ".", "." ]

[ 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

10408776

[ "Mutations", "of", "the", "VHL", "gene", "in", "sporadic", "renal", "cell", "carcinoma", ":", "definition", "of", "a", "risk", "factor", "for", "VHL", "patients", "to", "develop", "an", "RCC", ".", "To", "investigate", "the", "nature", "of", "somatic", "von", "Hippel", "-", "Lindau", "(", "VHL", ")", "mutations", ",", "we", "analyzed", "173", "primary", "sporadic", "human", "renal", "cell", "carcinomas", "for", "mutations", "of", "the", "VHL", "tumor", "suppressor", "gene", ",", "using", "polymerase", "chain", "reaction", "(", "PCR", ")", "and", "single", "-", "strand", "conformational", "polymorphism", "analysis", "(", "SSCP", ")", "of", "DNA", ".", "We", "detected", "abnormal", "SSCP", "pattern", "in", "73", "samples", ".", "After", "sequencing", ",", "we", "identified", "microdeletions", "in", "58", "%", "of", "cases", ",", "microinsertions", "in", "17", "%", ",", "nonsense", "mutations", "in", "8", "%", ",", "and", "missense", "mutations", "in", "17", "%", ".", "Among", "these", "mutations", ",", "50", "%", "correspond", "to", "new", "mutations", ".", "VHL", "mutations", "were", "found", "only", "in", "the", "nonpapillary", "renal", "cell", "carcinoma", "(", "RCC", ")", "subtype", ",", "as", "previously", "reported", ".", "To", "compare", "somatic", "and", "germline", "mutations", ",", "we", "used", "the", "VHL", "database", ",", "which", "includes", "507", "mutations", ".", "The", "study", "of", "mutational", "events", "revealed", "a", "significant", "difference", "between", "somatic", "and", "germline", "mutations", "with", "mutations", "leading", "to", "truncated", "proteins", "observed", "in", "78", "%", "of", "somatic", "mutations", "vs", "only", "37", "%", "in", "germline", "mutations", "(", "P", "<", "0", ".", "001", ")", ".", "We", "postulated", "that", "a", "specific", "pattern", "of", "VHL", "mutations", "is", "associated", "with", "sporadic", "RCC", ".", "This", "pattern", "corresponds", "to", "mutations", "leading", "mainly", "to", "truncated", "proteins", "with", "few", "specific", "missense", "mutations", ".", "We", "then", "analyzed", "the", "occurrence", "of", "RCC", "in", "VHL", "families", ",", "based", "on", "the", "nature", "of", "mutations", ".", "We", "observed", "RCC", "in", "at", "least", "one", "member", "of", "the", "VHL", "families", "in", "77", "%", "of", "cases", "with", "mutations", "leading", "to", "truncated", "proteins", "versus", "55", "%", "in", "cases", "with", "missense", "mutations", "(", "P", "<", "0", ".", "05", ")", ".", "Thus", ",", "mutations", "resulting", "in", "truncated", "proteins", "may", "lead", "to", "a", "higher", "risk", "of", "RCC", "in", "VHL", "patients" ]

[ 0, 0, 0, 7, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 8, 8, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 8, 8, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 7, 0 ]

10411929

[ "Defective", "CTLA", "-", "4", "cycling", "pathway", "in", "Chediak", "-", "Higashi", "syndrome", ":", "a", "possible", "mechanism", "for", "deregulation", "of", "T", "lymphocyte", "activation", ".", "Cytotoxic", "T", "lymphocyte", "-", "associated", "antigen", "4", "(", "CTLA", "-", "4", ",", "also", "known", "as", "CD152", ")", "has", "been", "shown", "to", "play", "a", "major", "role", "in", "the", "regulation", "of", "T", "cell", "activation", ".", "Its", "membrane", "expression", "is", "highly", "regulated", "by", "endocytosis", "and", "trafficking", "through", "the", "secretory", "lysosome", "pathway", ".", "Chediak", "-", "Higashi", "syndrome", "(", "CHS", ")", "is", "an", "inherited", "disorder", "caused", "by", "mutations", "in", "the", "lysosomal", "trafficking", "regulator", "gene", ",", "LYST", ".", "It", "results", "in", "defective", "membrane", "targeting", "of", "the", "proteins", "present", "in", "secretory", "lysosomes", ",", "and", "it", "is", "associated", "with", "a", "variety", "of", "features", ",", "including", "a", "lymphoproliferative", "syndrome", "with", "hemophagocytosis", ".", "The", "murine", "equivalent", "of", "CHS", ",", "beige", "mice", ",", "present", "similar", "characteristics", "but", "do", "not", "develop", "the", "lymphoproliferative", "syndrome", ".", "We", "show", "herein", "that", "CTLA", "-", "4", "is", "present", "in", "enlarged", ",", "abnormal", "vesicles", "in", "CHS", "T", "cells", "and", "is", "not", "properly", "expressed", "at", "the", "cell", "surface", "after", "T", "cell", "activation", ",", "whereas", "its", "surface", "expression", "is", "not", "impaired", ".", "It", "is", "therefore", "proposed", "that", "the", "defective", "surface", "expression", "of", "CTLA", "-", "4", "by", "CHS", "T", "cells", "is", "involved", "in", "the", "generation", "of", "lymphoproliferative", "disease", ".", "This", "observation", "may", "provide", "insight", "into", "the", "role", "of", "CTLA", "-", "4", "in", "humans", ".", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

10417279

[ "Proteolipoprotein", "gene", "analysis", "in", "82", "patients", "with", "sporadic", "Pelizaeus", "-", "Merzbacher", "Disease", ":", "duplications", ",", "the", "major", "cause", "of", "the", "disease", ",", "originate", "more", "frequently", "in", "male", "germ", "cells", ",", "but", "point", "mutations", "do", "not", ".", "The", "Clinical", "European", "Network", "on", "Brain", "Dysmyelinating", "Disease", ".", "Pelizaeus", "-", "Merzbacher", "Disease", "(", "PMD", ")", "is", "an", "X", "-", "linked", "developmental", "defect", "of", "myelination", "affecting", "the", "central", "nervous", "system", "and", "segregating", "with", "the", "proteolipoprotein", "(", "PLP", ")", "locus", ".", "Investigating", "82", "strictly", "selected", "sporadic", "cases", "of", "PMD", ",", "we", "found", "PLP", "mutations", "in", "77", "%", ";", "complete", "PLP", "-", "gene", "duplications", "were", "the", "most", "frequent", "abnormality", "(", "62", "%", ")", ",", "whereas", "point", "mutations", "in", "coding", "or", "splice", "-", "site", "regions", "of", "the", "gene", "were", "involved", "less", "frequently", "(", "38", "%", ")", ".", "We", "analyzed", "the", "maternal", "status", "of", "56", "cases", "to", "determine", "the", "origin", "of", "both", "types", "of", "PLP", "mutation", ",", "since", "this", "is", "relevant", "to", "genetic", "counseling", ".", "In", "the", "22", "point", "mutations", ",", "68", "%", "of", "mothers", "were", "heterozygous", "for", "the", "mutation", ",", "a", "value", "identical", "to", "the", "two", "-", "thirds", "of", "carrier", "mothers", "that", "would", "be", "expected", "if", "there", "were", "an", "equal", "mutation", "rate", "in", "male", "and", "female", "germ", "cells", ".", "In", "sharp", "contrast", ",", "among", "the", "34", "duplicated", "cases", ",", "91", "%", "of", "mothers", "were", "carriers", ",", "a", "value", "significantly", "(", "chi2", "=", "9", ".", "20", ",", "P", "<", ".", "01", ")", "in", "favor", "of", "a", "male", "bias", ",", "with", "an", "estimation", "of", "the", "male", "/", "female", "mutation", "frequency", "(", "k", ")", "of", "9", ".", "3", "3", ".", "Moreover", ",", "we", "observed", "the", "occurrence", "of", "de", "novo", "mutations", "between", "parental", "and", "grandparental", "generations", "in", "17", "three", "-", "generation", "families", ",", "which", "allowed", "a", "direct", "estimation", "of", "the", "k", "value", "(", "k", "=", "11", ")", ".", "Again", ",", "a", "significant", "male", "mutation", "imbalance", "was", "observed", "only", "for", "the", "duplications", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 3, 4, 4, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

10417280

[ "Chromosome", "breakage", "in", "the", "Prader", "-", "Willi", "and", "Angelman", "syndromes", "involves", "recombination", "between", "large", ",", "transcribed", "repeats", "at", "proximal", "and", "distal", "breakpoints", ".", "Prader", "-", "Willi", "syndrome", "(", "PWS", ")", "and", "Angelman", "syndrome", "(", "AS", ")", "are", "distinct", "neurobehavioral", "disorders", "that", "most", "often", "arise", "from", "a", "4", "-", "Mb", "deletion", "of", "chromosome", "15q11", "-", "q13", "during", "paternal", "or", "maternal", "gametogenesis", ",", "respectively", ".", "At", "a", "de", "novo", "frequency", "of", "approximately", ".", "67", "-", "1", "/", "10", ",", "000", "births", ",", "these", "deletions", "represent", "a", "common", "structural", "chromosome", "change", "in", "the", "human", "genome", ".", "To", "elucidate", "the", "mechanism", "underlying", "these", "events", ",", "we", "characterized", "the", "regions", "that", "contain", "two", "proximal", "breakpoint", "clusters", "and", "a", "distal", "cluster", ".", "Novel", "DNA", "sequences", "potentially", "associated", "with", "the", "breakpoints", "were", "positionally", "cloned", "from", "YACs", "within", "or", "near", "these", "regions", ".", "Analyses", "of", "rodent", "-", "human", "somatic", "-", "cell", "hybrids", ",", "YAC", "contigs", ",", "and", "FISH", "of", "normal", "or", "rearranged", "chromosomes", "15", "identified", "duplicated", "sequences", "(", "the", "END", "repeats", ")", "at", "or", "near", "the", "breakpoints", ".", "The", "END", "-", "repeat", "units", "are", "derived", "from", "large", "genomic", "duplications", "of", "a", "novel", "gene", "(", "HERC2", ")", ",", "many", "copies", "of", "which", "are", "transcriptionally", "active", "in", "germline", "tissues", ".", "One", "of", "five", "PWS", "/", "AS", "patients", "analyzed", "to", "date", "has", "an", "identifiable", ",", "rearranged", "HERC2", "transcript", "derived", "from", "the", "deletion", "event", ".", "We", "postulate", "that", "the", "END", "repeats", "flanking", "15q11", "-", "q13", "mediate", "homologous", "recombination", "resulting", "in", "deletion", ".", "Furthermore", ",", "we", "propose", "that", "active", "transcription", "of", "these", "repeats", "in", "male", "and", "female", "germ", "cells", "may", "facilitate", "the", "homologous", "recombination", "process", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 6, 6, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 0, 3, 0, 0, 3, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

10417286

[ "Linkage", "analysis", "in", "a", "large", "Brazilian", "family", "with", "van", "der", "Woude", "syndrome", "suggests", "the", "existence", "of", "a", "susceptibility", "locus", "for", "cleft", "palate", "at", "17p11", ".", "2", "-", "11", ".", "1", ".", "van", "der", "Woude", "syndrome", "(", "VWS", ")", ",", "which", "has", "been", "mapped", "to", "1q32", "-", "41", ",", "is", "characterized", "by", "pits", "and", "/", "or", "sinuses", "of", "the", "lower", "lip", ",", "cleft", "lip", "/", "palate", "(", "CL", "/", "P", ")", ",", "cleft", "palate", "(", "CP", ")", ",", "bifid", "uvula", ",", "and", "hypodontia", "(", "H", ")", ".", "The", "expression", "of", "VWS", ",", "which", "has", "incomplete", "penetrance", ",", "is", "highly", "variable", ".", "Both", "the", "occurrence", "of", "CL", "/", "P", "and", "CP", "within", "the", "same", "genealogy", "and", "a", "recurrence", "risk", "<", "40", "%", "for", "CP", "among", "descendants", "with", "VWS", "have", "suggested", "that", "the", "development", "of", "clefts", "in", "this", "syndrome", "is", "influenced", "by", "modifying", "genes", "at", "other", "loci", ".", "To", "test", "this", "hypothesis", ",", "we", "have", "conducted", "linkage", "analysis", "in", "a", "large", "Brazilian", "kindred", "with", "VWS", ",", "considering", "as", "affected", "the", "individuals", "with", "CP", ",", "regardless", "of", "whether", "it", "is", "associated", "with", "other", "clinical", "signs", "of", "VWS", ".", "Our", "results", "suggest", "that", "a", "gene", "at", "17p11", ".", "2", "-", "11", "2", "-", "11", ".", "1", ",", "together", "with", "the", "VWS", "gene", "at", "1p32", "-", "41", ",", "enhances", "the", "probability", "of", "CP", "in", "an", "individual", "carrying", "the", "two", "at", "-", "risk", "genes", ".", "If", "this", "hypothesis", "is", "confirmed", "in", "other", "VWS", "pedigrees", ",", "it", "will", "represent", "one", "of", "the", "first", "examples", "of", "a", "gene", ",", "mapped", "through", "linkage", "analysis", ",", "which", "modifies", "the", "expression", "of", "a", "major", "gene", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 6, 6, 6, 6, 6, 6, 0, 3, 4, 4, 4, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 3, 4, 0, 3, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 3, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

10425038

[ "New", "mutations", ",", "polymorphisms", ",", "and", "rare", "variants", "in", "the", "ATM", "gene", "detected", "by", "a", "novel", "SSCP", "strategy", ".", "The", "gene", "for", "ataxia", "-", "telangiectasia", ",", "ATM", ",", "spans", "about", "150", "kb", "of", "genomic", "DNA", ".", "ATM", "mutations", "are", "found", "along", "the", "entire", "gene", ",", "with", "no", "evidence", "of", "a", "mutational", "hot", "spot", ".", "Using", "DNA", "as", "the", "starting", "material", ",", "we", "screened", "the", "ATM", "gene", "in", "92", "A", "-", "T", "patients", ",", "using", "an", "optimized", "single", "-", "strand", "conformation", "polymorphism", "(", "SSCP", ")", "technique", "that", "detected", "all", "previously", "known", "mutations", "in", "the", "polymerase", "chain", "reaction", "(", "PCR", ")", "segments", "being", "analyzed", ".", "To", "expedite", "screening", ",", "we", "sequentially", "loaded", "the", "SSCP", "gels", "with", "three", "different", "sets", "of", "PCR", "products", "that", "were", "pretested", "to", "avoid", "overlapping", "patterns", ".", "Many", "of", "the", "DNA", "changes", "we", "detected", "were", "intragenic", "polymorphisms", ".", "Of", "an", "expected", "177", "unknown", "mutations", ",", "we", "detected", "approximately", "70", "%", ",", "mostly", "protein", "truncating", "mutations", "(", "that", "would", "have", "been", "detectable", "by", "protein", "truncation", "testing", "if", "RNA", "starting", "material", "had", "been", "available", ")", ".", "Mutations", "have", "now", "been", "defined", "for", "every", "exon", "of", "the", "ATM", "gene", ".", "Herein", ",", "we", "present", "35", "new", "mutations", "and", "34", "new", "intragenic", "polymorphisms", "or", "rare", "variants", "within", "the", "ATM", "gene", ".", "This", "is", "the", "most", "comprehensive", "compilation", "of", "ATM", "polymorphisms", "assembled", "to", "date", ".", "Defining", "polymorphic", "sites", "as", "well", "as", "mutations", "in", "the", "ATM", "gene", "will", "be", "of", "great", "importance", "in", "designing", "automated", "methods", "for", "detecting", "mutations", ".", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

10426139

[ "A", "novel", "frameshift", "mutation", "in", "the", "McLeod", "syndrome", "gene", "in", "a", "Japanese", "family", ".", "We", "report", "a", "novel", "mutation", "in", "the", "XK", "gene", "(", "XK", ")", "in", "a", "Japanese", "patient", "with", "McLeod", "syndrome", ".", "A", "50", "-", "year", "-", "old", "man", "showed", "progressive", "muscular", "atrophy", ",", "choreic", "movement", ",", "elevated", "level", "of", "serum", "creatinine", "kinase", ",", "and", "acanthocytosis", ".", "The", "expression", "level", "of", "all", "the", "Kell", "antigens", "in", "erythrocyte", "was", "decreased", "and", "molecular", "analysis", "revealed", "a", "single", "-", "base", "(", "T", ")", "deletion", "at", "the", "nucleotide", "position", "1095", "in", "XK", ".", "This", "deletion", "caused", "a", "frameshift", "in", "translation", ",", "leading", "to", "a", "premature", "stop", "codon", "at", "the", "amino", "acid", "position", "408", ".", "We", "conclude", "this", "single", "-", "base", "deletion", "causes", "defective", "Kx", "protein", ",", "which", "is", "responsible", "for", "the", "McLeod", "phenotype", "in", "this", "patient", ".", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

10426999

[ "Association", "of", "BRCA1", "with", "the", "hRad50", "-", "hMre11", "-", "p95", "complex", "and", "the", "DNA", "damage", "response", ".", "BRCA1", "encodes", "a", "tumor", "suppressor", "that", "is", "mutated", "in", "familial", "breast", "and", "ovarian", "cancers", ".", "Here", ",", "it", "is", "shown", "that", "BRCA1", "interacts", "in", "vitro", "and", "in", "vivo", "with", "hRad50", ",", "which", "forms", "a", "complex", "with", "hMre11", "and", "p95", "/", "nibrin", ".", "Upon", "irradiation", ",", "BRCA1", "was", "detected", "in", "discrete", "foci", "in", "the", "nucleus", ",", "which", "colocalize", "with", "hRad50", ".", "Formation", "of", "irradiation", "-", "induced", "foci", "positive", "for", "BRCA1", ",", "hRad50", ",", "hMre11", ",", "or", "p95", "was", "dramatically", "reduced", "in", "HCC", "/", "1937", "breast", "cancer", "cells", "carrying", "a", "homozygous", "mutation", "in", "BRCA1", "but", "was", "restored", "by", "transfection", "of", "wild", "-", "type", "BRCA1", ".", "Ectopic", "expression", "of", "wild", "-", "type", ",", "but", "not", "mutated", ",", "BRCA1", "in", "these", "cells", "rendered", "them", "less", "sensitive", "to", "the", "DNA", "damage", "agent", ",", "methyl", "methanesulfonate", ".", "These", "data", "suggest", "that", "BRCA1", "is", "important", "for", "the", "cellular", "responses", "to", "DNA", "damage", "that", "are", "mediated", "by", "the", "hRad50", "-", "hMre11", "-", "p95", "complex", ".", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 6, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

10429004

[ "Relationship", "among", "genotype", ",", "biochemical", "phenotype", ",", "and", "cognitive", "performance", "in", "females", "with", "phenylalanine", "hydroxylase", "deficiency", ":", "report", "from", "the", "Maternal", "Phenylketonuria", "Collaborative", "Study", ".", "OBJECTIVE", "To", "examine", "the", "relationship", "of", "phenylalanine", "hydroxylase", "(", "PAH", ")", "genotypes", "to", "biochemical", "phenotype", "and", "cognitive", "development", "in", "maternal", "phenylketonuria", "(", "PKU", ")", ".", "METHODOLOGY", "PAH", "gene", "mutations", "were", "examined", "in", "222", "hyperphenylalaninemic", "females", "enrolled", "in", "the", "Maternal", "PKU", "Collaborative", "Study", "(", "MPKUCS", ")", ".", "A", "total", "of", "84", "different", "mutations", "were", "detected", ",", "and", "complete", "genotype", "was", "obtained", "in", "199", "individuals", ".", "Based", "on", "previous", "knowledge", "about", "mutation", "-", "phenotype", "associations", ",", "78", "of", "the", "mutations", "could", "be", "assigned", "to", "one", "of", "four", "classes", "of", "severity", "(", "severe", "PKU", ",", "moderate", "PKU", ",", "mild", "PKU", ",", "and", "mild", "hyperphenylalaninemia", "[", "MHP", "]", ")", ".", "Then", ",", "189", "MPKUCS", "subjects", "were", "grouped", "according", "to", "the", "various", "combinations", "of", "mutation", "classifications", ".", "The", "sample", "sizes", "were", "large", "enough", "for", "statistical", "testing", "in", "four", "groups", "with", "at", "least", "one", "mutation", "that", "completely", "abolishes", "enzyme", "activity", ".", "These", "patients", "are", "considered", "functionally", "hemizygous", ".", "RESULTS", "The", "biochemical", "phenotype", "predicted", "from", "the", "genotype", "in", "functionally", "hemizygous", "patients", "was", "related", "significantly", "to", "the", "assigned", "phenylalanine", "level", ".", "Cognitive", "performance", "(", "IQ", ")", "was", "also", "significantly", "related", "to", "genotype", ".", "The", "IQ", "of", "PAH", "-", "deficient", "mothers", "with", "a", "severe", "PKU", "mutation", "in", "combination", "with", "a", "MHP", "mutation", "or", "a", "mild", "PKU", "mutation", "was", "99", "and", "96", ",", "respectively", ",", "whereas", "the", "IQ", "of", "PKU", "mothers", "with", "two", "severe", "PKU", "mutations", "or", "with", "one", "severe", "and", "one", "moderate", "PKU", "mutation", "was", "83", "and", "84", ",", "respectively", ".", "Of", "the", "patients", "with", "PKU", ",", "92", "%", "had", "been", "treated", "during", "childhood", ".", "Those", "who", "were", "untreated", "or", "treated", "late", "had", "lower", "than", "average", "IQ", "scores", "for", "their", "group", "of", "mutation", "combinations", ".", "Females", "with", "moderate", "or", "mild", "PKU", "who", "were", "treated", "early", "and", "treated", "for", ">", "6", "years", "showed", "IQ", "scores", "10", "points", "above", "average", "for", "their", "group", ".", "CONCLUSIONS", "The", "reproductive", "outcome", "in", "maternal", "phenylketonuria", "is", "dependent", "on", "prenatal", "metabolic", "control", "and", "postnatal", "environmental", "circumstances", ".", "Both", "factors", "depend", "on", "the", "intellectual", "resources", "of", "the", "mother", "with", "PKU", ".", "The", "significant", "relationship", "among", "genotype", ",", "biochemical", "phenotype", ",", "and", "cognitive", "performance", "observed", "in", "the", "present", "study", "is", "of", "importance", "for", "the", "development", "of", "an", "optimal", "strategy", "for", "future", "treatment", "of", "females", "with", "PKU", "who", "plan", "pregnancy", ".", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 3, 0, 0, 3, 0, 0, 3, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 8, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0 ]

10430841

[ "Spinal", "xanthomatosis", ":", "a", "variant", "of", "cerebrotendinous", "xanthomatosis", ".", "We", "describe", "seven", "Dutch", "patients", "from", "six", "families", "with", "a", "slowly", "progressive", ",", "mainly", "spinal", "cord", "syndrome", "that", "remained", "for", "many", "years", "the", "sole", "expression", "of", "cerebrotendinous", "xanthomatosis", "(", "CTX", ")", ".", "MRI", "demonstrated", "white", "matter", "abnormalities", "in", "the", "lateral", "and", "dorsal", "columns", "of", "the", "spinal", "cord", ".", "Post", "-", "mortem", "examination", "of", "one", "of", "the", "patients", "showed", "extensive", "myelin", "loss", "in", "these", "columns", ".", "An", "array", "of", "genotypes", "was", "found", "in", "these", "patients", ".", "We", "conclude", "that", "spinal", "xanthomatosis", "is", "a", "clinical", "and", "radiological", "separate", "entity", "of", "CTX", "that", "should", "be", "included", "in", "the", "differential", "diagnosis", "of", "chronic", "myelopathy", ".", "." ]

[ 3, 4, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0 ]

10430930

[ "A", "transgene", "insertion", "creating", "a", "heritable", "chromosome", "deletion", "mouse", "model", "of", "Prader", "-", "Willi", "and", "angelman", "syndromes", ".", "Prader", "-", "Willi", "syndrome", "(", "PWS", ")", "and", "Angelman", "syndrome", "(", "AS", ")", "result", "from", "the", "loss", "of", "function", "of", "imprinted", "genes", "in", "human", "chromosome", "15q11", "-", "q13", ".", "The", "central", "part", "of", "mouse", "chromosome", "7", "is", "homologous", "to", "human", "15q11", "-", "q13", ",", "with", "conservation", "of", "both", "gene", "order", "and", "imprinted", "features", ".", "We", "report", "here", "the", "characterization", "of", "a", "transgene", "insertion", "(", "Epstein", "-", "Barr", "virus", "Latent", "Membrane", "Protein", "2A", ",", "LMP2A", ")", "into", "mouse", "chromosome", "7C", ",", "which", "has", "resulted", "in", "mouse", "models", "for", "PWS", "and", "AS", "dependent", "on", "the", "sex", "of", "the", "transmitting", "parent", ".", "Epigenotype", "(", "allelic", "expression", "and", "DNA", "methylation", ")", "and", "fluorescence", "in", "situ", "hybridization", "analyses", "indicate", "that", "the", "transgene", "-", "induced", "mutation", "has", "generated", "a", "complete", "deletion", "of", "the", "PWS", "/", "AS", "-", "homologous", "region", "but", "has", "not", "deleted", "flanking", "loci", ".", "Because", "the", "intact", "chromosome", "7", ",", "opposite", "the", "deleted", "homolog", ",", "maintains", "the", "correct", "imprint", "in", "somatic", "cells", "of", "PWS", "and", "AS", "mice", "and", "establishes", "the", "correct", "imprint", "in", "male", "and", "female", "germ", "cells", "of", "AS", "mice", ",", "homologous", "association", "and", "replication", "asynchrony", "are", "not", "part", "of", "the", "imprinting", "mechanism", ".", "This", "heritable", "-", "deletion", "mouse", "model", "will", "be", "particularly", "useful", "for", "the", "identification", "of", "the", "etiological", "genes", "and", "mechanisms", ",", "phenotypic", "basis", ",", "and", "investigation", "of", "therapeutic", "approaches", "for", "PWS", ".", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 6, 6, 6, 0, 3, 4, 4, 4, 0, 3, 0, 0, 3, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0 ]

10434119

[ "Linkage", "analysis", "of", "5", "novel", "van", "der", "Woude", "syndrome", "kindreds", "to", "1q32", "-", "q41", "markers", "further", "supports", "locus", "homogeneity", "of", "the", "disease", "trait", ".", "van", "der", "Woude", "syndrome", "(", "vWS", ",", "MIM", "119300", ")", "is", "a", "rare", "autosomal", "dominant", "clefting", "condition", "with", "cardinal", "features", "of", "mucous", "cysts", "(", "lower", "-", "lip", "pits", ")", "and", "clefts", "to", "the", "lip", "and", "/", "or", "palate", ".", "The", "vWS", "gene", "has", "been", "assigned", "to", "a", "locus", "in", "1q32", "-", "q41", "by", "linkage", "analysis", "and", "physical", "mapping", ".", "We", "have", "investigated", "5", "novel", "vWS", "families", "through", "probands", "attended", "for", "cleft", "lip", "and", "/", "or", "palate", "repair", "at", "the", "Department", "of", "Maxillofacial", "Surgery", "of", "Hopital", "Trousseau", ",", "Paris", ",", "in", "order", "to", "tentatively", "refine", "the", "genetic", "map", "of", "the", "vWS", "region", "in", "1q32", "-", "q41", "and", "possibly", "identify", "unlinked", "pedigrees", ".", "Linkage", "analysis", "was", "carried", "out", "to", "6", "microsatellite", "markers", "(", "D1S249", ",", "D1S425", ",", "D1S491", ",", "D1S205", ",", "D1S414", ",", "D1S425", ")", ",", "yielding", "a", "maximum", "cumulative", "LOD", "score", "of", "Z", "=", "3", ".", "27", "at", "theta", "=", "0", ".", "00", "for", "D1S245", ".", "The", "innermost", "four", "markers", "were", "found", "to", "be", "tightly", "linked", "to", "one", "another", ",", "with", "no", "evidence", "for", "recombination", ".", "Our", "results", "support", "linkage", "of", "vWS", "within", "a", "region", "of", "tightly", "linked", "markers", "and", "do", "not", "favour", "locus", "heterogeneity", "of", "the", "disease", "trait", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 8, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 3, 4, 4, 4, 0, 0, 5, 6, 6, 6, 6, 6, 6, 6, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 8, 8, 8, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

10441329

[ "Null", "mutation", "of", "the", "murine", "ATP7B", "(", "Wilson", "disease", ")", "gene", "results", "in", "intracellular", "copper", "accumulation", "and", "late", "-", "onset", "hepatic", "nodular", "transformation", ".", "The", "Atp7b", "protein", "is", "a", "copper", "-", "transporting", "ATPase", "expressed", "predominantly", "in", "the", "liver", "and", "to", "a", "lesser", "extent", "in", "most", "other", "tissues", ".", "Mutations", "in", "the", "ATP7B", "gene", "lead", "to", "Wilson", "disease", ",", "a", "copper", "toxicity", "disorder", "characterized", "by", "dramatic", "build", "-", "up", "of", "intracellular", "hepatic", "copper", "with", "subsequent", "hepatic", "and", "neuro", "-", "logical", "abnormalities", ".", "Using", "homologous", "recombination", "to", "disrupt", "the", "normal", "translation", "of", "ATP7B", ",", "we", "have", "generated", "a", "strain", "of", "mice", "that", "are", "homozygous", "mutants", "(", ")", "for", "the", "Wilson", "disease", "gene", ".", "The", "ATP7B", "mice", "display", "a", "gradual", "accumulation", "of", "hepatic", "copper", "that", "increases", "to", "a", "level", "60", "-", "fold", "greater", "than", "normal", "by", "5", "months", "of", "age", ".", "An", "increase", "in", "copper", "concentration", "was", "also", "observed", "in", "the", "kidney", ",", "brain", ",", "placenta", "and", "lactating", "mammary", "glands", "of", "homo", "-", "zygous", "mutants", ",", "although", "milk", "from", "the", "mutant", "glands", "was", "copper", "deficient", ".", "Morphological", "abnormalities", "resembling", "cirrhosis", "developed", "in", "the", "majority", "of", "the", "livers", "from", "homozygous", "mutants", "older", "than", "7", "months", "of", "age", ".", "Progeny", "of", "the", "homozygous", "mutant", "females", "demonstrated", "neurological", "abnormalities", "and", "growth", "retardation", "characteristic", "of", "copper", "deficiency", ".", "Copper", "concentration", "in", "the", "livers", "of", "the", "newborn", "homozygous", "mutants", "was", "decreased", "dramatically", ".", "In", "summary", ",", "inactivation", "of", "the", "murine", "ATP7B", "gene", "produces", "a", "form", "of", "cirrhotic", "liver", "disease", "that", "resembles", "Wilson", "disease", "in", "humans", "and", "the", "toxic", "milk", "phenotype", "in", "the", "mouse", ".", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 1, 2, 2, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 6, 6, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 1, 2, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 1, 2, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

10441343

[ "French", "Machado", "-", "Joseph", "disease", "patients", "do", "not", "exhibit", "gametic", "segregation", "distortion", ":", "a", "sperm", "typing", "analysis", ".", "Segregation", "distortion", "has", "been", "reported", "to", "occur", "in", "a", "number", "of", "the", "trinucleotide", "repeat", "disorders", ".", "On", "the", "basis", "of", "a", "sperm", "typing", "study", "performed", "in", "patients", "of", "Japanese", "descent", "with", "Machado", "-", "Joseph", "disease", "(", "MJD", ")", ",", "it", "was", "reported", "that", "disease", "alleles", "are", "preferentially", "transmitted", "during", "meiosis", ".", "We", "performed", "a", "sperm", "typing", "study", "of", "five", "MJD", "patients", "of", "French", "descent", "and", "analysis", "of", "the", "pooled", "data", "shows", "a", "ratio", "of", "mutant", "to", "normal", "alleles", "of", "379", "436", "(", "46", ".", "5", "53", ".", "5", "%", ")", ",", "which", "does", "not", "support", "meiotic", "segregation", "distortion", ".", "To", "confirm", "these", "results", ",", "sperm", "typing", "analysis", "was", "also", "performed", "using", "a", "polymorphic", "marker", ",", "D14S1050", ",", "closely", "linked", "to", "the", "MJD1", "gene", ".", "Among", "910", "sperm", "analyzed", ",", "the", "allele", "linked", "to", "the", "disease", "chromosome", "was", "detected", "in", "50", ".", "3", "%", "of", "the", "samples", "and", "the", "allele", "linked", "to", "the", "normal", "chromosome", "was", "found", "in", "49", ".", "6", "%", "of", "the", "sperm", ".", "The", "difference", "in", "frequency", "of", "these", "two", "alleles", "is", "not", "significant", "(", "P", "=", "0", ".", "8423", ")", ".", "Likelihood", "-", "based", "analysis", "of", "segregation", "distortion", "in", "the", "single", "sperm", "data", "using", "the", "SPERMSEG", "program", "also", "showed", "no", "support", "for", "segregation", "distortion", "at", "the", "gamete", "level", "in", "this", "patient", "population", ".", "The", "previous", "report", "on", "the", "Japanese", "patients", "also", "suggested", "that", "disease", "allele", "stability", "may", "be", "influenced", "by", "a", "trans", "effect", "of", "an", "intragenic", "polymorphism", "(", "987", "G", "/", "C", ")", "in", "the", "wild", "-", "type", "allele", ".", "All", "of", "the", "French", "patients", "were", "heterozygous", "for", "this", "polymorphism", ".", "However", ",", "analysis", "of", "the", "variance", "in", "repeat", "number", "in", "sperm", "from", "the", "French", "MJD", "patients", "overlapped", "significantly", "with", "the", "variance", "in", "repeat", "number", "observed", "in", "the", "C", "/", "C", "homozygous", "Japanese", "patients", "." ]

[ 0, 7, 8, 8, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

10441571

[ "Missense", "mutation", "in", "the", "alternative", "splice", "region", "of", "the", "PAX6", "gene", "in", "eye", "anomalies", ".", "The", "PAX6", "gene", "is", "involved", "in", "ocular", "morphogenesis", ",", "and", "PAX6", "mutations", "have", "been", "detected", "in", "various", "types", "of", "ocular", "anomalies", ",", "including", "aniridia", ",", "Peters", "anomaly", ",", "corneal", "dystrophy", ",", "congenital", "cataract", ",", "and", "foveal", "hypoplasia", ".", "The", "gene", "encodes", "a", "transcriptional", "regulator", "that", "recognizes", "target", "genes", "through", "its", "paired", "-", "type", "DNA", "-", "binding", "domain", ".", "The", "paired", "domain", "is", "composed", "of", "two", "distinct", "DNA", "-", "binding", "subdomains", ",", "the", "N", "-", "terminal", "subdomain", "(", "NTS", ")", "and", "the", "C", "-", "terminal", "subdomain", "(", "CTS", ")", ",", "which", "bind", "respective", "consensus", "DNA", "sequences", ".", "The", "human", "PAX6", "gene", "produces", "two", "alternative", "splice", "isoforms", "that", "have", "the", "distinct", "structure", "of", "the", "paired", "domain", ".", "The", "insertion", ",", "into", "the", "NTS", ",", "of", "14", "additional", "amino", "acids", "encoded", "by", "exon", "5a", "abolishes", "the", "DNA", "-", "binding", "activity", "of", "the", "NTS", "and", "unmasks", "the", "DNA", "-", "binding", "ability", "of", "the", "CTS", ".", "Thus", ",", "exon", "5a", "appears", "to", "function", "as", "a", "molecular", "switch", "that", "specifies", "target", "genes", ".", "We", "ascertained", "a", "novel", "missense", "mutation", "in", "four", "pedigrees", "with", "Peters", "anomaly", ",", "congenital", "cataract", ",", "Axenfeldt", "anomaly", ",", "and", "/", "or", "foveal", "hypoplasia", ",", "which", ",", "to", "our", "knowledge", ",", "is", "the", "first", "mutation", "identified", "in", "the", "splice", "-", "variant", "region", ".", "A", "T", "-", "-", ">", "A", "transition", "at", "the", "20th", "nucleotide", "position", "of", "exon", "5a", "results", "in", "a", "Val", "-", "-", ">", "Asp", "(", "GTC", "-", "-", ">", "GAC", ")", "substitution", "at", "the", "7th", "codon", "of", "the", "alternative", "splice", "region", ".", "Functional", "analyses", "demonstrated", "that", "the", "V54D", "mutation", "slightly", "increased", "NTS", "binding", "and", "decreased", "CTS", "transactivation", "activity", "to", "almost", "half", ".", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 3, 0, 3, 4, 0, 3, 4, 0, 3, 4, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 3, 4, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

10441573

[ "Penetrances", "of", "BRCA1", "1675delA", "and", "1135insA", "with", "respect", "to", "breast", "cancer", "and", "ovarian", "cancer", ".", "For", "genetic", "counseling", "and", "predictive", "testing", "in", "families", "with", "inherited", "breast", "-", "ovarian", "cancer", ",", "penetrances", "and", "expressions", "of", "the", "underlying", "mutations", "should", "be", "known", ".", "We", "have", "previously", "reported", "two", "BRCA1", "founder", "mutations", "in", "the", "Norwegian", "population", ".", "Index", "cases", "for", "the", "present", "study", "were", "found", "two", "different", "ways", "through", "a", "series", "of", "consecutive", "ovarian", "cancers", "(", "n", "=", "16", ")", "and", "through", "our", "family", "cancer", "clinic", "(", "n", "=", "14", ")", ".", "Altogether", ",", "20", "of", "the", "patients", "had", "BRCA1", "1675delA", ",", "and", "10", "had", "1135insA", ".", "Their", "relatives", "were", "described", "with", "respect", "to", "absence", "/", "presence", "of", "breast", "and", "/", "or", "ovarian", "cancer", ".", "Of", "133", "living", "female", "relatives", ",", "83", "(", "62", "%", ")", "were", "tested", "for", "the", "presence", "of", "a", "mutation", ".", "No", "difference", ",", "in", "penetrance", "and", "expression", ",", "between", "the", "two", "mutations", "were", "found", ",", "whereas", "differences", "according", "to", "method", "of", "ascertainment", "were", "seen", ".", "The", "overall", "findings", "were", "that", "disease", "started", "to", "occur", "at", "age", "30", "years", "and", "that", "by", "age", "50", "years", "48", "%", "of", "the", "mutation", "-", "carrying", "women", "had", "experienced", "breast", "and", "/", "or", "ovarian", "cancer", ".", "More", "ovarian", "cancers", "than", "breast", "cancers", "were", "recorded", ".", "Both", "penetrance", "and", "expression", "(", "breast", "cancer", "vs", ".", "ovarian", "cancer", ")", "were", "different", "from", "those", "in", "reports", "of", "the", "Ashkenazi", "founder", "mutations", ".", "Whether", "the", "reported", "differences", "reflect", "true", "differences", "and", "/", "or", "methodological", "problems", "is", "discussed", ".", "An", "observed", "excess", "of", "mutation", "carriers", "could", "not", "be", "accounted", "for", "by", "methodological", "problems", ";", "possible", "explanations", "were", "a", "\"", "true", "\"", "low", "penetrance", "or", "preferential", "segregation", ".", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 6, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 6, 6, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 6, 6, 6, 0, 0, 3, 4, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

10446987

[ "The", "dermatofibrosarcoma", "protuberans", "-", "associated", "collagen", "type", "Ialpha1", "/", "platelet", "-", "derived", "growth", "factor", "(", "PDGF", ")", "B", "-", "chain", "fusion", "gene", "generates", "a", "transforming", "protein", "that", "is", "processed", "to", "functional", "PDGF", "-", "BB", ".", "Dermatofibrosarcoma", "protuberans", "(", "DFSP", ")", "displays", "chromosomal", "rearrangements", "involving", "chromosome", "17", "and", "22", ",", "which", "fuse", "the", "collagen", "type", "Ialpha1", "(", "COLIA1", ")", "gene", "to", "the", "platelet", "-", "derived", "growth", "factor", "(", "PDGF", ")", "B", "-", "chain", "(", "PDGFB", ")", "gene", ".", "To", "characterize", "the", "functional", "and", "structural", "properties", "of", "the", "COLIA1", "/", "PDGFB", "fusion", "protein", ",", "we", "generated", "a", "stable", "NIH3T3", "cell", "line", "that", "contained", "a", "tumor", "-", "derived", "chimeric", "gene", "resulting", "from", "a", "COIA1", "intron", "7", "-", "PDGFB", "intron", "1", "fusion", ".", "Expression", "of", "the", "fusion", "protein", "led", "to", "morphological", "transformation", "and", "increased", "growth", "rate", "of", "these", "cells", ".", "The", "PDGF", "receptor", "kinase", "inhibitor", "CGP57148B", "reversed", "the", "transformed", "phenotype", "and", "reduced", "the", "growth", "rate", "of", "COLIA1", "/", "PDGFB", "-", "expressing", "cells", "but", "had", "no", "effects", "on", "control", "cells", ".", "The", "presence", "of", "dimeric", "COLIA1", "/", "PDGFB", "precursors", "was", "demonstrated", "through", "PDGFB", "immunoprecipitations", "of", "metabolically", "labeled", "cells", "and", "also", "by", "PDGFB", "immunoprecipitations", "followed", "by", "immunoblotting", "with", "COLIA1", "antibodies", ".", "Pulse", "-", "chase", "studies", "demonstrated", "that", "the", "COLIA1", "/", "PDGFB", "precursor", "was", "processed", "to", "an", "end", "product", "that", "was", "indistinguishable", "from", "wild", "-", "type", "PDGF", "-", "BB", ".", "Finally", ",", "COLIA1", "/", "PDGFB", "-", "expressing", "cells", "generated", "tumors", "after", "s", ".", "c", "c", ".", "injection", "into", "nude", "mice", ",", "and", "tumor", "growth", "was", "reduced", "by", "treatment", "with", "CGP57148B", ".", "We", "conclude", "that", "the", "COLIA1", "/", "PDGFB", "fusion", "associated", "with", "DFSP", "contributes", "to", "tumor", "development", "through", "ectopic", "production", "of", "PDGF", "-", "BB", "and", "the", "formation", "of", "an", "autocrine", "loop", ".", "Our", "findings", ",", "thus", ",", "suggest", "that", "PDGF", "receptors", "could", "be", "a", "target", "for", "pharmacological", "treatment", "of", "DFSP", "and", "giant", "cell", "fibroblastoma", ",", "e", ".", "g", ".", ",", "through", "the", "use", "of", "PDGF", "receptor", "kinase", "inhibitors", "such", "as", "CGP57148B", "." ]

[ 0, 7, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

10447258

[ "Identification", "of", "a", "common", "PEX1", "mutation", "in", "Zellweger", "syndrome", ".", "The", "Zellweger", "spectrum", "of", "disease", ",", "encompassing", "Zellweger", "syndrome", "and", "the", "progressively", "milder", "phenotypes", "of", "neonatal", "adrenoleukodystrophy", "and", "infantile", "Refsum", "disease", ",", "is", "due", "to", "a", "failure", "to", "form", "functional", "peroxisomes", ".", "Cell", "fusion", "complementation", "studies", "demonstrated", "that", "these", "diseases", "are", "genetically", "heterogeneous", ",", "with", "two", "-", "thirds", "of", "all", "patients", "lying", "within", "a", "single", "complementation", "group", ",", "CG1", ".", "Molecular", "genetic", "and", "cell", "biology", "studies", "have", "shown", "that", "PEX1", "is", "deficient", "in", "many", "CG1", "patients", ".", "However", ",", "previous", "studies", "have", "focused", "on", "mildly", "affected", "patients", "and", "there", "is", "still", "no", "report", "of", "two", "mutant", "PEX1", "alleles", "in", "any", "Zellweger", "syndrome", "patient", ".", "Furthermore", ",", "mutations", "in", "the", "PMP70", "gene", "have", "also", "been", "identified", "in", "two", "Zellweger", "syndrome", "patients", "from", "CG1", ",", "raising", "the", "possibility", "that", "CG1", "patients", "may", "represent", "a", "mixture", "of", "PEX1", "-", "deficient", "and", "PMP70", "-", "deficient", "individuals", ".", "To", "address", "the", "molecular", "basis", "of", "disease", "in", "Zellweger", "syndrome", "patients", "from", "CG1", ",", "we", "examined", "all", "24", "PEX1", "exons", "in", "four", "patients", ",", "including", "both", "patients", "that", "have", "mutations", "in", "PMP70", ".", "PEX1", "mutations", "were", "detected", "in", "all", "four", "patients", ",", "including", "a", "1", "-", "bp", "insertion", "(", "c", ".", "2097insT", ")", "in", "exon", "13", "that", "was", "present", "in", "three", "of", "the", "four", "patients", ".", "Subsequent", "studies", "demonstrated", "that", "this", "mutation", "is", "present", "in", "one", "-", "half", "of", "all", "CG1", "patients", "and", "correlates", "with", "the", "Zellweger", "syndrome", "phenotype", ".", "As", "this", "mutation", "leads", "to", "a", "loss", "of", "protein", "function", "its", "frequency", "makes", "it", "the", "most", "common", "cause", "of", "Zellweger", "syndrome", ",", "helping", "to", "explain", "the", "high", "percentage", "of", "patients", "that", "belong", "to", "CG1", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

10447259

[ "Novel", "mutations", "in", "the", "Wiskott", "-", "Aldrich", "syndrome", "protein", "gene", "and", "their", "effects", "on", "transcriptional", ",", "translational", ",", "and", "clinical", "phenotypes", ".", "Wiskott", "-", "Aldrich", "syndrome", "(", "WAS", ")", "is", "an", "X", "-", "linked", "recessive", "immunodeficiency", "characterized", "by", "thrombocytopenia", ",", "eczema", ",", "and", "recurrent", "infections", ",", "and", "caused", "by", "mutations", "in", "the", "WAS", "protein", "(", "WASP", ")", "gene", ".", "WASP", "contains", "several", "functional", "domains", "through", "which", "it", "interacts", "with", "proteins", "involved", "in", "intracellular", "signaling", "and", "regulation", "of", "the", "actin", "cytoskeleton", ".", "In", "this", "report", ",", "17", "WASP", "gene", "mutations", "were", "identified", ",", "12", "of", "which", "are", "novel", ".", "DNA", "of", "affected", "males", "and", "obligate", "carriers", "was", "PCR", "amplified", "and", "analyzed", "by", "SSCA", ",", "heteroduplex", "analysis", ",", "and", "direct", "sequencing", ".", "The", "effects", "of", "the", "mutations", "at", "the", "mRNA", "and", "protein", "level", "were", "ascertained", "by", "RT", "-", "PCR", "and", "Western", "blot", "analyses", ".", "All", "missense", "mutations", "were", "located", "in", "exons", "1", "-", "4", ".", "Most", "of", "the", "nonsense", ",", "frameshift", "and", "splice", "site", "mutations", "were", "found", "in", "exons", "6", "-", "11", ".", "Mutations", "that", "alter", "splice", "sites", "led", "to", "the", "synthesis", "of", "several", "types", "of", "mRNAs", ",", "a", "fraction", "of", "which", "represented", "the", "normally", "spliced", "product", ".", "The", "presence", "of", "normally", "spliced", "transcripts", "was", "correlated", "with", "a", "milder", "phenotype", ".", "When", "one", "such", "case", "was", "studied", "by", "Western", "blotting", ",", "reduced", "amounts", "of", "normal", "-", "size", "WASP", "were", "present", ".", "In", "other", "cases", "as", "well", ",", "a", "correlation", "was", "found", "between", "the", "amount", "of", "normal", "or", "mutant", "WASP", "present", "and", "the", "phenotypes", "of", "the", "affected", "individuals", ".", "No", "protein", "was", "detected", "in", "two", "individuals", "with", "severe", "WAS", ".", "Reduced", "levels", "of", "a", "normal", "-", "size", "WASP", "with", "a", "missense", "mutation", "were", "seen", "in", "two", "individuals", "with", "XLT", ".", "It", "is", "concluded", "that", "mutation", "analysis", "at", "the", "DNA", "level", "is", "not", "sufficient", "for", "predicting", "clinical", "course", ".", "Studies", "at", "the", "transcript", "and", "protein", "level", "are", "needed", "for", "a", "better", "assessment", ".", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 7, 8, 8, 8, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 2, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

Datasets:

yasmmin
/

ncbi_nerfair_processed

Benchmark dataset NCBI

Collection including yasmmin/ncbi_nerfair_processed

nerfair processed datasets