Dataset Viewer (First 5GB)
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cyc-pep-6-12mer-650M-2024
Set of ~650 million (almost) unique cyclic and linear peptides comprising 6-12 amino acids, each with some calculated molecular properties.
Dataset Details
Dataset Sources
- Repository: https://huggingface.co/datasets/scbirlab/cyc-pep-6-12mer-650M-2024
Dataset Structure
- linear_id: Identifier for linear peptide
- peptide_sequence: Amino acid sequence of linear peptide
- SMILES: SMILES string of linear peptide
- cyclic_id: Identifier for cyclic peptide
- cyclic_inchikey: Unique identifier for cyclic peptide
- cysteine_to_N_cyclization: SMILES string of cyclic peptide
- cyclic_scaffold: Murcko scaffold of cyclic peptide
- cyclic_mwt: Molecular weight of cyclic peptide
- cyclic_clogp: Crippen LogP of cyclic peptide
- cyclic_tpsa: Topological polar surface area of cyclic peptide
Dataset Creation
Curation Rationale
To develop a large dataset of SMILES strings for peptides.
Data Collection and Processing
Data were generated using schemist, a tool for processing chemical datasets.
Who are the source data producers?
Eachan Johnson (@eachanjohnson).
Personal and Sensitive Information
None
Dataset Card Contact
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